59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0067 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0067  ribosomal protein L10.e  100 
 
 		 171 aa  354  2.9999999999999997e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0342271  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0848  50S ribosomal protein L10e  61.21 
 
 		 170 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.019401  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1074  50S ribosomal protein L10e  58.93 
 
 		 173 aa  210  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00939806  normal  0.46194 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0181  50S ribosomal protein L10e  60.48 
 
 		 170 aa  207  6e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0734  50S ribosomal protein L10e  58.68 
 
 		 248 aa  206  9e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16736  normal  0.255836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0088  50S ribosomal protein L10e  58.43 
 
 		 170 aa  205  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0379  50S ribosomal protein L10e  59.64 
 
 		 166 aa  197  6e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1371  50S ribosomal protein L10e  58.48 
 
 		 173 aa  196  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1422  50S ribosomal protein L10e  55.36 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0013  50S ribosomal protein L10e  54.17 
 
 		 173 aa  184  6e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0304  50S ribosomal protein L10e  53.57 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0534  50S ribosomal protein L10e  52.98 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.586885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1385  50S ribosomal protein L10e  52.98 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.447341  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0599  50S ribosomal protein L10e  54.17 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.164962  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1865  50S ribosomal protein L10e  53.57 
 
 		 175 aa  175  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.58071 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2544  50S ribosomal protein L10e  47.34 
 
 		 176 aa  170  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.016395  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0057  50S ribosomal protein L10e  47.34 
 
 		 176 aa  170  7.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.737976  decreased coverage  0.000179775 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0653  ribosomal protein L16  47.93 
 
 		 176 aa  170  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0632081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0287  ribosomal protein L10.e  48.52 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2137  ribosomal protein L10.e  48.52 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0902  50S ribosomal protein L10e  51.19 
 
 		 182 aa  163  8e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.514047  normal  0.97666 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2226  50S ribosomal protein L10e  49.4 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1271  Ribosomal protein L10e/L16  48.81 
 
 		 178 aa  160  8.000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1995  50S ribosomal protein L10e  50.88 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0917  50S ribosomal protein L10e  50.3 
 
 		 182 aa  159  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.617288  normal  0.240594 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0546  50S ribosomal protein L10e  47.02 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06083  hypothetical protein similar to ribosomal L10 protein (Broad)  46.15 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.896752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0968  50S ribosomal protein L10e  46.75 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000124621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77042  ribosomal protein L10  42.94 
 
 		 220 aa  133  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0449  50S ribosomal protein L10e  46.91 
 
 		 169 aa  131  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000174136 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02360  ribosomal L10 protein, putative  42.35 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00987477  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30754  Ribosomal protein L10, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  41.76 
 
 		 226 aa  124  7e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.484174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48699  predicted protein  41.51 
 
 		 217 aa  118  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0086  50S ribosomal protein L16  30 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391105 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2250  50S ribosomal protein L16  29.17 
 
 		 137 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000631878  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0689  50S ribosomal protein L16  31.2 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  30.77 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1758  50S ribosomal protein L16  29.17 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.160083  normal  0.394515 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  28.79 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  28.79 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0065  50S ribosomal protein L16  30.65 
 
 		 137 aa  44.7  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00303691  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0594  ribosomal protein L16  28.15 
 
 		 139 aa  44.3  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.158135  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0667  50S ribosomal protein L16  28.33 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00972373  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl130  50S ribosomal protein L16  29.91 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  28.93 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3988  ribosomal protein L16  28.1 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  28.93 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2767  ribosomal protein L16  27.35 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000162016  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0634  ribosomal protein L16  27.61 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.953159  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29670  LSU ribosomal protein L16P  28.21 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.810934  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0938  ribosomal protein L16  31.68 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  30.63 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1278  ribosomal protein L16  28.28 
 
 		 140 aa  42  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0233  50S ribosomal protein L16  30.58 
 
 		 138 aa  42  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  28.83 
 
 		 139 aa  40.8  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1714  50S ribosomal protein L16  29.77 
 
 		 139 aa  40.8  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66738  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1900  50S ribosomal protein L16  29.84 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.12767  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  26.67 
 
 		 145 aa  40.8  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  28.83 
 
 		 139 aa  40.8  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>