More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0055 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0055  MATE efflux family protein  100 
 
 
446 aa  880    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  37.19 
 
 
438 aa  258  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  34.25 
 
 
458 aa  253  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  34.2 
 
 
475 aa  242  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  31.06 
 
 
461 aa  204  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  30.77 
 
 
464 aa  196  9e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  30.84 
 
 
464 aa  195  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  29.86 
 
 
464 aa  194  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1359  multi anti extrusion protein MatE  34.15 
 
 
408 aa  192  8e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4087  MATE efflux family protein  31.51 
 
 
447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3993  MATE efflux family protein  31.51 
 
 
447 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  30.77 
 
 
469 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  31.11 
 
 
452 aa  187  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0575  MATE efflux family protein  29.28 
 
 
459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000335028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4400  MATE efflux family protein  30.69 
 
 
453 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  29.84 
 
 
453 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0316  MATE efflux family protein  33.48 
 
 
444 aa  168  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000262265  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2237  MATE efflux family protein  29.59 
 
 
469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000615121  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  28.08 
 
 
450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  29.51 
 
 
468 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  26.99 
 
 
448 aa  158  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0358  multi anti extrusion protein MatE  29.2 
 
 
452 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000377442  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  29.71 
 
 
483 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  30.16 
 
 
475 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  27.96 
 
 
469 aa  150  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3129  MATE efflux family protein  28.68 
 
 
452 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  29.38 
 
 
485 aa  147  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  25.68 
 
 
442 aa  146  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  29.05 
 
 
454 aa  144  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  27.66 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05890  putative efflux protein, MATE family  26.64 
 
 
472 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  26.61 
 
 
462 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  30.73 
 
 
486 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1418  MATE efflux family protein  27.3 
 
 
462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  26.32 
 
 
500 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  25.69 
 
 
460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  27.33 
 
 
518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2542  MATE efflux family protein  27.66 
 
 
459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1541  MATE efflux family protein  25.99 
 
 
486 aa  131  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  27.69 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  26.73 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  26.81 
 
 
463 aa  128  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  27.36 
 
 
451 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
460 aa  127  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
499 aa  126  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  26.21 
 
 
466 aa  126  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3815  MATE efflux family protein  26.05 
 
 
467 aa  126  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.142559  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  26.65 
 
 
500 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1252  MATE efflux family protein  26.59 
 
 
445 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000131388  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  27.01 
 
 
490 aa  123  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  25.72 
 
 
461 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  26.29 
 
 
463 aa  123  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0048  MATE efflux family protein  25.49 
 
 
501 aa  123  8e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.331446 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  24.15 
 
 
445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0100  MATE efflux family protein  26.74 
 
 
454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0456451  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  25.51 
 
 
453 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  27.13 
 
 
475 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  24.67 
 
 
463 aa  121  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2333  MATE efflux family protein  26.61 
 
 
456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  26 
 
 
467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  27.23 
 
 
475 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  28.25 
 
 
464 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  28.73 
 
 
470 aa  119  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0686  MATE efflux family protein  26.54 
 
 
498 aa  119  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.221481  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  24.83 
 
 
466 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  25.57 
 
 
468 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  24.16 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  29.08 
 
 
525 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
450 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  27.21 
 
 
498 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.17 
 
 
454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  27.41 
 
 
470 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  27.74 
 
 
464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  25 
 
 
461 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  25.6 
 
 
454 aa  117  5e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  27.57 
 
 
486 aa  117  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.26 
 
 
477 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  27.74 
 
 
464 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  27.74 
 
 
464 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  27.74 
 
 
464 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  27.13 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  27.74 
 
 
464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  26.76 
 
 
485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  27.74 
 
 
464 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27.74 
 
 
538 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  25.95 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  26.65 
 
 
485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  27.13 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  27.09 
 
 
463 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  27.52 
 
 
463 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  29.11 
 
 
467 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2872  hypothetical protein  25.91 
 
 
474 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0273189  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  27.25 
 
 
464 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  26.72 
 
 
554 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  25.39 
 
 
465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  26.3 
 
 
470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  24.5 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  26.8 
 
 
477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  27.42 
 
 
464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>