More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0020 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  100 
 
 
1359 aa  2763    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  33.04 
 
 
895 aa  364  8e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  34.12 
 
 
1011 aa  349  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  33 
 
 
1204 aa  343  2e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  31.59 
 
 
855 aa  323  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  30.03 
 
 
1131 aa  323  1.9999999999999998e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  30.33 
 
 
1109 aa  317  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  30.56 
 
 
872 aa  291  5.0000000000000004e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  29.52 
 
 
862 aa  284  7.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  28.38 
 
 
842 aa  278  5e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  29.73 
 
 
862 aa  276  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  29.79 
 
 
874 aa  261  5.0000000000000005e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  26.98 
 
 
832 aa  259  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  28.77 
 
 
805 aa  250  1e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  27.68 
 
 
923 aa  241  9e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  27.26 
 
 
879 aa  229  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  26.07 
 
 
764 aa  199  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2608  exporter of the RND superfamily protein  23.52 
 
 
860 aa  170  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0269848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  24.49 
 
 
748 aa  166  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  23.61 
 
 
864 aa  149  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  23.53 
 
 
755 aa  139  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  24.24 
 
 
752 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  22.46 
 
 
758 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  23.1 
 
 
747 aa  136  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  24.62 
 
 
777 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  22.61 
 
 
812 aa  131  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  24.01 
 
 
752 aa  131  9.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  21.99 
 
 
778 aa  131  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  25.61 
 
 
385 aa  126  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  27.53 
 
 
388 aa  124  9e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  24.19 
 
 
746 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  22 
 
 
777 aa  124  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.88 
 
 
756 aa  121  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  22.73 
 
 
821 aa  120  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  22.76 
 
 
767 aa  120  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  28.74 
 
 
385 aa  118  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  26.51 
 
 
380 aa  116  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.79 
 
 
831 aa  116  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  28.12 
 
 
385 aa  115  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  23.05 
 
 
807 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.21 
 
 
1051 aa  108  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  27.57 
 
 
387 aa  105  7e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  22.19 
 
 
865 aa  102  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  20.36 
 
 
755 aa  102  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  23.44 
 
 
687 aa  101  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.4 
 
 
807 aa  99.8  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  24.17 
 
 
905 aa  99  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  21.38 
 
 
801 aa  97.8  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  21.2 
 
 
869 aa  95.5  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  22.19 
 
 
773 aa  94.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  28.93 
 
 
893 aa  94  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  29.82 
 
 
861 aa  92.8  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  19.01 
 
 
778 aa  92.4  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  23.1 
 
 
859 aa  90.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  23.21 
 
 
889 aa  89.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27841  RND family transporter: Niemann-Pick type C1 disease protein-like protein  22.76 
 
 
808 aa  90.1  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.938041  normal  0.0539189 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  22.04 
 
 
835 aa  89  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  21.61 
 
 
820 aa  88.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.59 
 
 
886 aa  87  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  20.33 
 
 
756 aa  87  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  21.88 
 
 
792 aa  86.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  25.08 
 
 
884 aa  86.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  24.65 
 
 
898 aa  85.9  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  23.73 
 
 
695 aa  85.9  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  19.06 
 
 
815 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  22.28 
 
 
825 aa  84.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.71 
 
 
1045 aa  84.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  21.98 
 
 
788 aa  83.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0221  RND efflux transporter  23.05 
 
 
771 aa  83.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.822518  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0548  MMPL domain protein  21.68 
 
 
684 aa  83.2  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1695  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.04 
 
 
782 aa  82  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  20.68 
 
 
800 aa  82  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  28.02 
 
 
901 aa  81.6  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  21.89 
 
 
800 aa  79.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.97 
 
 
808 aa  79.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  29.94 
 
 
890 aa  79  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  22.03 
 
 
816 aa  78.6  0.0000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  22.26 
 
 
811 aa  79  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  24.23 
 
 
972 aa  78.6  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  22.05 
 
 
765 aa  77  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  23.79 
 
 
813 aa  77.4  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  24.74 
 
 
823 aa  77  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  29.76 
 
 
729 aa  77  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  20.88 
 
 
839 aa  75.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  21.75 
 
 
779 aa  75.5  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  21.4 
 
 
779 aa  75.1  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  25.67 
 
 
815 aa  75.1  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  27.39 
 
 
868 aa  74.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  25.73 
 
 
862 aa  73.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1909  hypothetical protein  26.95 
 
 
692 aa  73.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00515667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  27.22 
 
 
920 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  21.29 
 
 
727 aa  73.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  29.33 
 
 
872 aa  73.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  24.05 
 
 
899 aa  72.4  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  30.6 
 
 
767 aa  72.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.04 
 
 
868 aa  72.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  24.19 
 
 
974 aa  72  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  22.71 
 
 
1083 aa  72  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  19.57 
 
 
803 aa  72  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  25.71 
 
 
892 aa  72  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>