38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0013 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0013  transglutaminase domain protein  100 
 
 
376 aa  769    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.854186  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2177  transglutaminase domain-containing protein  31.19 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1888  transglutaminase domain-containing protein  31.19 
 
 
391 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1574  transglutaminase domain-containing protein  27.23 
 
 
453 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000322367  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2594  transglutaminase-like  35.48 
 
 
216 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.727338  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2396  transglutaminase-like  22.71 
 
 
328 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0878  transglutaminase domain-containing protein  26.47 
 
 
266 aa  51.2  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.53102 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0165  transglutaminase domain protein  24.66 
 
 
436 aa  50.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.665704  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1343  transglutaminase domain-containing protein  44.44 
 
 
369 aa  50.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0562  transglutaminase domain protein  27.21 
 
 
398 aa  49.7  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.567565  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1220  transglutaminase domain-containing protein  26.61 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.826592  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1847  transglutaminase-like  29.41 
 
 
300 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.753598  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  46.03 
 
 
1257 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3474  transglutaminase domain-containing protein  30.1 
 
 
528 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.934792  normal  0.0999002 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3413  transglutaminase-like  29.13 
 
 
523 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2537  transglutaminase domain-containing protein  30 
 
 
337 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.243337  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1086  transglutaminase-like  31.25 
 
 
338 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506332  hitchhiker  0.0000050405 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2873  twin-arginine translocation pathway signal  22.27 
 
 
379 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0642  transglutaminase domain protein  31.4 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2790  twin-arginine translocation pathway signal  22.17 
 
 
379 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2128  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2969  transglutaminase domain-containing protein  21.8 
 
 
379 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  26.53 
 
 
264 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2177  transglutaminase domain protein  28.26 
 
 
336 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3562  transglutaminase domain protein  28.16 
 
 
523 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.209631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3494  transglutaminase domain protein  28.16 
 
 
523 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1117  transglutaminase domain-containing protein  26.04 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.113705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  31.31 
 
 
265 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15691  transglutaminase-like superfamily protein  21.36 
 
 
281 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.798972  normal  0.306347 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1670  transglutaminase domain protein  28.57 
 
 
277 aa  43.9  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.492777  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0068  transglutaminase domain protein  24.17 
 
 
373 aa  43.9  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0531153  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11690  hypothetical protein  29.58 
 
 
310 aa  43.5  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.556512  normal  0.379907 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  28.4 
 
 
263 aa  43.1  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  24.68 
 
 
373 aa  43.5  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  28.92 
 
 
659 aa  43.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0148  transglutaminase domain-containing protein  28.57 
 
 
495 aa  42.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  24.53 
 
 
330 aa  42.7  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1555  transglutaminase-like  25 
 
 
500 aa  42.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.047572  normal  0.368889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>