More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_R0058 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_R0058  tRNA-Val  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.703111  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0033  tRNA-Val  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000215711  hitchhiker  0.00721353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0003  tRNA-Val  96.55 
 
 
72 bp  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0040  tRNA-Val  97.96 
 
 
72 bp  81.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0001  tRNA-Ala  92.86 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0032  tRNA-Ala  92.86 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0018  tRNA-Ala  92.86 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0308139  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0049  tRNA-Ala  92.86 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0004  tRNA-Ala  94.23 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.892843  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0041  tRNA-Ala  94.23 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.312045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0027  tRNA-Ala  92.73 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309290  tRNA-Ala  92.73 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0008  tRNA-Ala  92.73 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0953331  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0032  tRNA-Ala  92.73 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.168105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0037  tRNA-Ala  92.73 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.344221  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0051  tRNA-Ala  92.73 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0021  tRNA-Ala  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000106448  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0034  tRNA-Ala  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000564918  normal  0.218531 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309282  tRNA-Ala  92.73 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.127609 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0072  tRNA-Val  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577987  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAlaVIMSS1309204  tRNA-Ala  92.59 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72887  normal  0.842293 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAlaVIMSS1309140  tRNA-Ala  92.59 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0078  tRNA-Val  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAlaVIMSS1309089  tRNA-Ala  92.59 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0019  tRNA-Ala  92.59 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.399377  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0038  tRNA-Ala  92.59 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0011  tRNA-Val  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000560887  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0020  tRNA-Ala  92.59 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0046  tRNA-Val  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000498396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0031  tRNA-Val  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.03601e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0011  tRNA-Ala  92.59 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAlaVIMSS1309372  tRNA-Ala  92.59 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.272937  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAlaVIMSS1309163  tRNA-Ala  92.59 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0052  tRNA-Val  91.38 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.599035  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0004  tRNA-Ala  92.59 
 
 
73 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0039  tRNA-Val  97.78 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430844  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2183  tRNA-Val  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Val-1  tRNA-Val  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.581803  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Val-2  tRNA-Val  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.57043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0072  tRNA-Val  93.75 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0117931  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1157  tRNA-Val  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00434161  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1739  tRNA-Val  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000050357  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1161  tRNA-Val  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0179935  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2179  tRNA-Val  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0510  tRNA-Val  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.228812  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0090  tRNA-Val  93.75 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000163432  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0019  tRNA-Val  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0513  tRNA-Val  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309523  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2260  tRNA-Val  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.177016  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2218  tRNA-Val  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0089  tRNA-Val  93.75 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000177778  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1735  tRNA-Val  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000539085  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0598  tRNA-Val  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.149876  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0602  tRNA-Val  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.375399  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0002  tRNA-Ala  90.91 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0038  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0041  tRNA-Ala  92.16 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.239536  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0022  tRNA-Val  95.65 
 
 
72 bp  67.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.520763  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0709  tRNA-Val  97.62 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0051  tRNA-Val  94 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000148873  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0062  tRNA-Gly  95.12 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.669958  normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1590  tRNA-Val  89.29 
 
 
78 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0985046  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAValVIMSS1309362  tRNA-Val  93.75 
 
 
72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0039  tRNA-Val  93.18 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0206433  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0010  tRNA-Ala  90.38 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.407573  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0005  tRNA-Ala  90.38 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314904 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAValVIMSS1309119  tRNA-Val  93.75 
 
 
72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.255702  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAValVIMSS1309272  tRNA-Val  93.75 
 
 
72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAValVIMSS1309068  tRNA-Val  93.75 
 
 
72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0025  tRNA-Ala  90.38 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0027  tRNA-Val  93.75 
 
 
72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0010  tRNA-Ala  90.38 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0057492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0002  tRNA-Ala  90.38 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0028  tRNA-Val  91.67 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0005  tRNA-Ala  90.38 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.352047  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0045  tRNA-Val  93.75 
 
 
72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.106461  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAValVIMSS1309144  tRNA-Val  93.75 
 
 
72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0213338  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0026  tRNA-Val  91.67 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAValVIMSS1309186  tRNA-Val  93.75 
 
 
72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.8123 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0046  tRNA-Ala  90.38 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0258027  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0051  tRNA-Ala  90.38 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00326143  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0003  tRNA-Ala  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00250  tRNA-Val  93.02 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2543  tRNA-Val  93.02 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00155589  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2329  tRNA-Val  93.02 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0016  tRNA-Ala  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.262033  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0020  tRNA-Ala  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna025  tRNA-Val  93.02 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0656621  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0061  tRNA-Ala  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0057  tRNA-Ala  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.185628  hitchhiker  0.000293533 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0067  tRNA-Ala  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000523585  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0016  tRNA-Ala  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.168843  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0013  tRNA-Val  93.02 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0062  tRNA-Ala  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0469123  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0021  tRNA-Ala  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.984556  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0050  tRNA-Ala  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0200036 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0058  tRNA-Ala  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0063  tRNA-Ala  90.2 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00469  tRNA-Val  93.02 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06828  tRNA-Val  93.02 
 
 
73 bp  61.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>