14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_R0013 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_R0013  tRNA-Val  100 
 
 		 69 bp  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.160269  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0012  tRNA-Ala  98.36 
 
 		 73 bp  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000301607  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0002  tRNA-Ala  96.72 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0002  tRNA-Ala  96.72 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0043  tRNA-Ala  95.08 
 
 		 73 bp  97.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.734011 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0008  tRNA-Ala  93.44 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309286  tRNA-Ala  91.8 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0040  tRNA-Ala  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0043  tRNA-Ala  88.52 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0877    91.3 
 
 		 294 bp  60  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0031  tRNA-Ala  86.89 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0170329  normal  0.236609 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.05432  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1441  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000019523  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0048  tRNA-Ala  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>