296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_R0011 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000337805  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0047  tRNA-Ser  85.06 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.548242 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0001  tRNA-Ser  85.06 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0001  tRNA-Ser  85.06 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0016  tRNA-Ser  95.12 
 
 
91 bp  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0005  tRNA-Ser  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.087026  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0011  tRNA-Ser  83.91 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000281552  normal  0.938437 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0021  tRNA-Ser  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146581  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0007  tRNA-Ser  83.91 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309091  tRNA-Ser  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309106  tRNA-Ser  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309205  tRNA-Ser  94.87 
 
 
87 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.98258  normal  0.324955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0033  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56325  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0040  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.140248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0057  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  94.74 
 
 
92 bp  60  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0047  tRNA-Ser  92.68 
 
 
91 bp  58  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0016  tRNA-Ser  92.68 
 
 
90 bp  58  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0014  tRNA-Ser  92.68 
 
 
90 bp  58  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359735  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0015  tRNA-Ser  92.68 
 
 
90 bp  58  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0025  tRNA-Ser  92.68 
 
 
90 bp  58  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217878  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0017  tRNA-Ser  92.68 
 
 
90 bp  58  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0008  tRNA-Ser  92.68 
 
 
90 bp  58  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289156  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0029  tRNA-Ser  92.68 
 
 
91 bp  58  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.287395  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6042  tRNA-Ser  92.68 
 
 
90 bp  58  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516287  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07713  tRNA-Ser  92.5 
 
 
88 bp  56  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309375  tRNA-Ser  85.23 
 
 
87 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.748623  hitchhiker  0.000994808 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309260  tRNA-Ser  85.23 
 
 
87 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  54  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt13  tRNA-Ser  85.06 
 
 
88 bp  54  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt13  tRNA-Ser  85.06 
 
 
88 bp  54  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.123019  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0009  tRNA-Ser  84.34 
 
 
86 bp  54  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309285  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0044  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564577 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309165  tRNA-Ser  92.31 
 
 
87 bp  54  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0017  tRNA-Ser  96.77 
 
 
89 bp  54  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00474021  normal  0.100605 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1336  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000172836  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.565194  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0116  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0194907  hitchhiker  0.0000623575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154227  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.71316e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.39796e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0016  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0044  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000135641  normal  0.305478 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0025  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.940611  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0039  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194122  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t15  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t17  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t21  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.216172  normal  0.054895 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0106  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000623575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0025  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000078606  normal  0.16194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0032  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0015  tRNA-Ser  89.13 
 
 
90 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109725  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1335  hypothetical protein  100 
 
 
126 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0066  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00163913  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.231561  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0068  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.504463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0024  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.107228  normal  0.17939 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178185  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 
96 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  52  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000391887  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0032  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000491895  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0031  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.981637  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.985807  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0060  tRNA-Ser  94.12 
 
 
90 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0021  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00559548  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 
95 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0111  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  hitchhiker  0.0000655456 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0035  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0387862 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309071  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0036  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.325342  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309189  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0057  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1277  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00670593  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0671  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0435402  hitchhiker  0.00788518 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023989  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0023  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000401861 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309147  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309365  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0044  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0814997  hitchhiker  0.00838863 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0776  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0954361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>