296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_R0011 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  172  9e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000337805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0001  tRNA-Ser  85.06 
 
 
87 bp  69.9  9e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0001  tRNA-Ser  85.06 
 
 
87 bp  69.9  9e-11  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0047  tRNA-Ser  85.06 
 
 
87 bp  69.9  9e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.548242 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0016  tRNA-Ser  95.12 
 
 
91 bp  65.9  1e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0021  tRNA-Ser  94.87 
 
 
87 bp  61.9  2e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146581  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0007  tRNA-Ser  83.91 
 
 
87 bp  61.9  2e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNASerVIMSS1309106  tRNA-Ser  94.87 
 
 
87 bp  61.9  2e-08  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309091  tRNA-Ser  94.87 
 
 
87 bp  61.9  2e-08  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0011  tRNA-Ser  83.91 
 
 
87 bp  61.9  2e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  2.81552e-12  normal  0.938437 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309205  tRNA-Ser  94.87 
 
 
87 bp  61.9  2e-08  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.98258  normal  0.324955 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0005  tRNA-Ser  94.87 
 
 
87 bp  61.9  2e-08  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.087026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0033  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  9e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56325  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0025  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  9e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0067  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  9e-08  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0027  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  9e-08  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.5818  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRAt11  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  9e-08  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.644598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0040  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  9e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.140248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0057  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  9e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0911  tRNA-Ser  94.74 
 
 
90 bp  60  9e-08  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.531015  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1009  tRNA-Ser  94.74 
 
 
92 bp  60  9e-08  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0047  tRNA-Ser  92.68 
 
 
91 bp  58  4e-07  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.018693  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0029  tRNA-Ser  92.68 
 
 
91 bp  58  4e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.287395  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0025  tRNA-Ser  92.68 
 
 
90 bp  58  4e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217878  normal  0.142788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0017  tRNA-Ser  92.68 
 
 
90 bp  58  4e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0015  tRNA-Ser  92.68 
 
 
90 bp  58  4e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0008  tRNA-Ser  92.68 
 
 
90 bp  58  4e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289156  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0016  tRNA-Ser  92.68 
 
 
90 bp  58  4e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.745909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0014  tRNA-Ser  92.68 
 
 
90 bp  58  4e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.359735  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6042  tRNA-Ser  92.68 
 
 
90 bp  58  4e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516287  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309260  tRNA-Ser  85.23 
 
 
87 bp  56  1e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07713  tRNA-Ser  92.5 
 
 
88 bp  56  1e-06  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309375  tRNA-Ser  85.23 
 
 
87 bp  56  1e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.748623  hitchhiker  0.000994808 
 
 
-
 
NC_006369  lplt13  tRNA-Ser  85.06 
 
 
88 bp  54  6e-06  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNASerVIMSS1309285  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  54  6e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  54  6e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  54  6e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.123019  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  54  6e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0017  tRNA-Ser  96.77 
 
 
89 bp  54  6e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00474021  normal  0.100605 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309165  tRNA-Ser  92.31 
 
 
87 bp  54  6e-06  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0044  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  54  6e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564577 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0009  tRNA-Ser  84.34 
 
 
86 bp  54  6e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lppt13  tRNA-Ser  85.06 
 
 
88 bp  54  6e-06  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNASerVIMSS1309071  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  52  2e-05  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  2e-05  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0116  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  52  2e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0194907  hitchhiker  6.23575e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0111  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  52  2e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44922  hitchhiker  6.55456e-05 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0060  tRNA-Ser  94.12 
 
 
90 bp  52  2e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  52  2e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  52  2e-05  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  52  2e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.78185e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0030  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  52  2e-05  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00742423 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1336  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  2e-05  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000172836  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0025  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  52  2e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.0387574 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  2e-05  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00055942 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0068  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  52  2e-05  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.504463 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNASerVIMSS1309147  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  52  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  2e-05  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0035  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  52  2e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0387862 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0018  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  2e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0021  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  2e-05  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0717904 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  2e-05  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0057  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  2e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0011  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  52  2e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0054  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  52  2e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0026  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  52  2e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0107164  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNASerVIMSS1309189  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  52  2e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0106  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  52  2e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  6.23575e-05 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0062  tRNA-Ser  100 
 
 
95 bp  52  2e-05  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNASerVIMSS1309365  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  52  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t17  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  2e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t21  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  52  2e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0010  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  52  2e-05  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.216172  normal  0.054895 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  52  2e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0435402  hitchhiker  0.00788518 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  52  2e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  52  2e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023989  hitchhiker  0.00746416 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0038  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  2e-05  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.231561  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0036  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  2e-05  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.325342  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0833  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  2e-05  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t15  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  2e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0039  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  52  2e-05  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.194122  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0020  tRNA-Ser  100 
 
 
89 bp  52  2e-05  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.565194  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  52  2e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  1.54227e-13  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0044  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  52  2e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0814997  hitchhiker  0.00838863 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 
94 bp  52  2e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.71316e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 
88 bp  52  2e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.39796e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0014  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  52  2e-05  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0016  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  52  2e-05  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0044  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  52  2e-05  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  1.35641e-06  normal  0.305478 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0025  tRNA-Ser  100 
 
 
87 bp  52  2e-05  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.940611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0023  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  2e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.01861e-06 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1277  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  2e-05  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00670593  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0025  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  2e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.8606e-06  normal  0.16194 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0006  tRNA-Ser  100 
 
 
96 bp  52  2e-05  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0036  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  52  2e-05  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1335  hypothetical protein  100 
 
 
126 bp  52  2e-05  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0032  tRNA-Ser  100 
 
 
90 bp  52  2e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  4.91895e-05  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0031  tRNA-Ser  100 
 
 
93 bp  52  2e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.981637  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 
91 bp  52  2e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.985807  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0043  tRNA-Ser  100 
 
 
92 bp  52  2e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0613926  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>