More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_4539 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  82.28 
 
 
474 aa  761    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4539  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 
470 aa  939    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.470079  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  67.97 
 
 
461 aa  630  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0142  preprotein translocase subunit SecD  68.03 
 
 
464 aa  620  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  63.98 
 
 
470 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  64.69 
 
 
471 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  63.98 
 
 
470 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5128  preprotein translocase subunit SecD  68.71 
 
 
464 aa  586  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.473691  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  47.96 
 
 
493 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  48.07 
 
 
495 aa  430  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  49.49 
 
 
495 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  46.64 
 
 
489 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  46.68 
 
 
496 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  46.3 
 
 
496 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  45.64 
 
 
489 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  45.7 
 
 
487 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  46.25 
 
 
489 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  43.62 
 
 
486 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  41.33 
 
 
461 aa  322  9.000000000000001e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  40.32 
 
 
399 aa  309  8e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  39.77 
 
 
416 aa  306  6e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  41.47 
 
 
413 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  40.4 
 
 
403 aa  302  8.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  39 
 
 
515 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  41.67 
 
 
594 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  41.67 
 
 
594 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3104  protein-export membrane protein SecD  40.24 
 
 
538 aa  277  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000111638  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  39.81 
 
 
410 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  42.73 
 
 
748 aa  274  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  39.29 
 
 
761 aa  274  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  38.13 
 
 
735 aa  273  6e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1272  preprotein translocase subunit SecD  38.81 
 
 
411 aa  272  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  44.69 
 
 
524 aa  271  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.44 
 
 
849 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  36.55 
 
 
406 aa  271  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0313  preprotein translocase subunit SecD  38.56 
 
 
449 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000119854  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  37.35 
 
 
403 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0333  preprotein translocase subunit SecD  38.64 
 
 
449 aa  270  5e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000488895  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  39.56 
 
 
533 aa  270  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.53 
 
 
848 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  39.17 
 
 
533 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3982  protein-export membrane protein SecD  37.47 
 
 
468 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.728055 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_275  protein-export membrane protein, preprotein translocase SecD subunit  38.56 
 
 
449 aa  266  4e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000478055  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  37.94 
 
 
533 aa  266  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3326  protein-export membrane protein SecD  36.14 
 
 
474 aa  266  7e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  38.35 
 
 
532 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  39.18 
 
 
532 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  38.53 
 
 
533 aa  263  3e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  39 
 
 
534 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  39.2 
 
 
531 aa  264  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  39 
 
 
843 aa  263  4e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  37.91 
 
 
535 aa  263  6e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.63 
 
 
856 aa  263  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  38.85 
 
 
530 aa  263  6.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  39.39 
 
 
530 aa  262  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  39.09 
 
 
532 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  39.35 
 
 
532 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  40.74 
 
 
533 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  38.31 
 
 
533 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  42.59 
 
 
457 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  39.36 
 
 
531 aa  259  6e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.52 
 
 
756 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0504  protein-export membrane protein SecD  37.31 
 
 
462 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000522922  hitchhiker  0.000170526 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.56 
 
 
853 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  39.51 
 
 
533 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  37.65 
 
 
533 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.19 
 
 
839 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  39.39 
 
 
532 aa  256  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  39.59 
 
 
533 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  37.44 
 
 
473 aa  256  6e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0387  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.07 
 
 
911 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.807363  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  38.94 
 
 
530 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  37.28 
 
 
512 aa  254  3e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  39.18 
 
 
533 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  37.31 
 
 
613 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  37.38 
 
 
525 aa  251  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  37.04 
 
 
554 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  37.56 
 
 
613 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  37.8 
 
 
556 aa  249  7e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  37.33 
 
 
613 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  36.21 
 
 
554 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  36.21 
 
 
554 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  37.83 
 
 
554 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  37.65 
 
 
534 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  37.59 
 
 
534 aa  247  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  37.16 
 
 
554 aa  246  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  38.02 
 
 
759 aa  246  6e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  38.05 
 
 
632 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  37.59 
 
 
534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  44.37 
 
 
415 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  38.85 
 
 
604 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  38.72 
 
 
533 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  35.04 
 
 
594 aa  243  5e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  37.53 
 
 
533 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  36.67 
 
 
534 aa  242  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  37.79 
 
 
532 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  35.19 
 
 
487 aa  242  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  36.41 
 
 
616 aa  242  1e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  37.8 
 
 
632 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  37.97 
 
 
632 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>