More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_4404 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3135  transcription-repair coupling factor  37.85 
 
 		 1164 aa  675    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.223116  normal  0.109749 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2754  transcription-repair coupling factor  36.52 
 
 		 1112 aa  671    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502691  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1281  transcription-repair coupling factor  38.29 
 
 		 1148 aa  672    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0700  transcription-repair coupling factor  36.79 
 
 		 1165 aa  684    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00154056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2632  transcription-repair coupling factor  37.79 
 
 		 1178 aa  783    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0593  transcription-repair coupling factor  37.97 
 
 		 1165 aa  741    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0141  transcription-repair coupling factor  35.8 
 
 		 1169 aa  700    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1827  transcription-repair coupling factor  71.78 
 
 		 1169 aa  1743    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0051  transcription-repair coupling factor  37.75 
 
 		 1176 aa  758    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32300  transcription-repair coupling factor Mfd  37.29 
 
 		 1199 aa  655    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.742659  normal  0.328282 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0008  transcription-repair coupling factor  39.35 
 
 		 1165 aa  648    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0050  transcription-repair coupling factor  38.42 
 
 		 1177 aa  742    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0052  transcription-repair coupling factor  37.66 
 
 		 1176 aa  758    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0048  transcription-repair coupling factor  37.75 
 
 		 1178 aa  759    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0048  transcription-repair coupling factor  37.37 
 
 		 1176 aa  757    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14371  transcriptional-repair coupling factor  57.07 
 
 		 1193 aa  1318    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  37.35 
 
 		 1153 aa  646    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  36.85 
 
 		 1153 aa  642    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0777  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  36.58 
 
 		 1194 aa  641    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2072  transcription-repair coupling factor  42.08 
 
 		 1123 aa  725    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3090  transcription-repair coupling factor  38.38 
 
 		 1174 aa  748    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.192538  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0369  transcriptional-repair coupling factor  51.57 
 
 		 1167 aa  1251    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4404  transcription-repair coupling factor  100 
 
 		 1166 aa  2405    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0048  transcription-repair coupling factor  39.19 
 
 		 1176 aa  762    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1478  transcription-repair coupling factor  38.87 
 
 		 1246 aa  733    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313815 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2767  transcription-repair coupling factor  81.98 
 
 		 1188 aa  2033    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09151  transcriptional-repair coupling factor  43.98 
 
 		 1175 aa  1088    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1023  transcription-repair coupling factor  37.04 
 
 		 1168 aa  657    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0182  transcription-repair coupling factor  38.07 
 
 		 1183 aa  713    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1092  transcription-repair coupling factor  37.71 
 
 		 1148 aa  676    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  36.4 
 
 		 1161 aa  642    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0062  transcription-repair coupling factor  37.75 
 
 		 1176 aa  758    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4373  transcription-repair coupling factor  65.99 
 
 		 1158 aa  1610    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.456695  hitchhiker  0.00000184147 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1176  transcription-repair coupling factor  58.22 
 
 		 1192 aa  1374    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0803  transcription-repair coupling factor  37.45 
 
 		 1188 aa  663    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0214899 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1300  transcription-repair coupling factor  58.14 
 
 		 1192 aa  1359    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0072  transcription-repair coupling factor  37.98 
 
 		 1176 aa  723    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0902915  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0048  transcription-repair coupling factor  38.4 
 
 		 1177 aa  751    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0067  transcription-repair coupling factor  38.07 
 
 		 1196 aa  738    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0052  transcription-repair coupling factor  37.66 
 
 		 1176 aa  758    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0961  transcriptional-repair coupling factor  45.48 
 
 		 1174 aa  1119    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.489301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1326  transcription-repair coupling factor  66.3 
 
 		 1153 aa  1607    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0048  transcription-repair coupling factor  37.4 
 
 		 1176 aa  748    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  38.97 
 
 		 1183 aa  740    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10301  transcriptional-repair coupling factor  44.82 
 
 		 1170 aa  1112    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10301  transcriptional-repair coupling factor  45.16 
 
 		 1169 aa  1114    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3926  transcription-repair coupling factor  36.4 
 
 		 1208 aa  648    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.892466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1067  transcription-repair coupling factor  36.36 
 
 		 1193 aa  637    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0112  transcription-repair coupling factor  36.68 
 
 		 1179 aa  704    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4624  transcription-repair coupling factor  35.85 
 
 		 1211 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1894  transcription-repair coupling factor  34.02 
 
 		 1109 aa  643    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.377763  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0884  transcription-repair coupling factor  35.68 
 
 		 1216 aa  657    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0829  transcription-repair coupling factor  35.65 
 
 		 1218 aa  655    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.46683  normal  0.375475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2656  transcription-repair coupling factor  36.86 
 
 		 1207 aa  682    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0357057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1064  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase)  37.86 
 
 		 1154 aa  684    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.566316  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11038  transcription-repair coupling factor mfd  37.35 
 
 		 1234 aa  659    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.970521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  35.95 
 
 		 1150 aa  636    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3741  transcription-repair coupling factor  38.4 
 
 		 1182 aa  731    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.34254 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10511  transcriptional-repair coupling factor  51.74 
 
 		 1167 aa  1254    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4549  transcription-repair coupling factor  37.28 
 
 		 1182 aa  677    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.191603 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09271  transcriptional-repair coupling factor  49.28 
 
 		 1169 aa  1212    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.254503  hitchhiker  0.0000230767 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0059  transcription-repair coupling factor  37.75 
 
 		 1176 aa  759    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4245  transcription-repair coupling factor  35.87 
 
 		 1211 aa  651    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3660  transcription-repair coupling factor  38.2 
 
 		 1265 aa  712    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1298  transcription-repair coupling factor  36.39 
 
 		 1220 aa  644    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122104 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0111  transcription-repair coupling factor  39.25 
 
 		 1169 aa  739    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00148726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0058  transcription-repair coupling factor  37.47 
 
 		 1176 aa  751    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2807  transcription-repair coupling factor  36.44 
 
 		 1162 aa  733    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2493  transcription-repair coupling factor  36.52 
 
 		 1162 aa  736    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4312  transcription-repair coupling factor  66.13 
 
 		 1158 aa  1610    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1671  transcription-repair coupling factor  65.2 
 
 		 1180 aa  1588    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  35.54 
 
 		 1157 aa  645    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0188  transcription-repair coupling factor  36.94 
 
 		 1182 aa  658    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3738  transcription-repair coupling factor  65.99 
 
 		 1168 aa  1624    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21200  transcription-repair coupling factor  38.54 
 
 		 1170 aa  783    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.010694  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0214  transcription-repair coupling factor  39.06 
 
 		 1197 aa  754    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0330142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5258  transcription-repair coupling factor  37.47 
 
 		 1176 aa  749    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0011  transcription-repair coupling factor  37.94 
 
 		 1162 aa  693    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0271  transcription-repair coupling factor  38.22 
 
 		 1165 aa  691    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0399  transcription-repair coupling factor  35.37 
 
 		 1179 aa  650    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0007  transcription-repair coupling factor  38.75 
 
 		 1168 aa  703    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1245  transcription-repair coupling factor  36.2 
 
 		 1222 aa  642    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  34.77 
 
 		 1174 aa  643    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1355  transcription-repair coupling factor  38.55 
 
 		 1150 aa  677    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  35.63 
 
 		 1157 aa  649    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  37.24 
 
 		 1177 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0131  transcription-repair coupling factor  38.25 
 
 		 1197 aa  696    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.10317  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0924  transcription-repair coupling factor  35.86 
 
 		 1224 aa  647    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410165  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0124  transcription-repair coupling factor  35.35 
 
 		 1147 aa  649    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00760781  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4331  transcription-repair coupling factor  35.87 
 
 		 1211 aa  651    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.376638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4777  transcription-repair coupling factor  37.64 
 
 		 1212 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0657  transcription-repair coupling factor  38.71 
 
 		 1202 aa  650    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0262  transcription-repair coupling factor  34.76 
 
 		 1179 aa  670    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0525  transcription-repair coupling factor  38.13 
 
 		 1168 aa  680    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0538  transcription-repair coupling factor  38.13 
 
 		 1168 aa  680    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  34.96 
 
 		 1153 aa  634  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8585  transcription-repair coupling factor  37.13 
 
 		 1204 aa  634  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0183  transcription-repair coupling factor  34.31 
 
 		 1188 aa  634  1e-180  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1948  transcription-repair coupling factor  37.27 
 
 		 1198 aa  635  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1287  transcription-repair coupling factor  35.12 
 
 		 1155 aa  630  1e-179  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0502901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>