144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_3188 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_3188  translation initiation factor SUI1  100 
 
 
118 aa  238  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00588203  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1910  translation initiation factor Sui1  80.91 
 
 
115 aa  172  1e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3343  translation initiation factor Sui1  69.57 
 
 
122 aa  154  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4810  translation initiation factor Sui1  67.23 
 
 
116 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2964  translation initiation factor Sui1  66.36 
 
 
117 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.650467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3154  translation initiation factor Sui1  66.36 
 
 
117 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2142  translation initiation factor Sui1  57.14 
 
 
111 aa  125  2e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.183879  normal  0.356716 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3853  translation initiation factor SUI1  53.7 
 
 
123 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4092  translation initiation factor SUI1  44.07 
 
 
117 aa  88.2  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0471  translation initiation factor SUI1  48.78 
 
 
110 aa  82  2e-15  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2099  putative translation initiation factor SUI1  43.81 
 
 
117 aa  82  3e-15  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5669  translation initiation factor SUI1  39.29 
 
 
120 aa  80.5  7e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2806  translation initiation factor Sui1  49.41 
 
 
121 aa  79.7  1e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.297006  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0413  translation initiation factor Sui1  40.98 
 
 
122 aa  79.7  1e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2419  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  44.76 
 
 
108 aa  79  2e-14  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0343  translation initiation factor Sui1  45.22 
 
 
121 aa  78.6  3e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  8.65275e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3941  translation initiation factor SUI1  45.35 
 
 
110 aa  77.4  6e-14  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4380  translation initiation factor Sui1  53.01 
 
 
123 aa  77  9e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830208  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2203  translation initiation factor SUI1  55.88 
 
 
114 aa  76.6  1e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.513989 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27071  translation initiation factor SUI1  47.56 
 
 
113 aa  76.6  1e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1480  translation initiation factor Sui1  40.83 
 
 
120 aa  76.6  1e-13  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4841  translation initiation factor SUI1, putative  49.4 
 
 
123 aa  75.5  2e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4599  translation initiation factor Sui1  47.73 
 
 
123 aa  75.5  2e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0413  translation initiation factor Sui1  40.16 
 
 
122 aa  75.1  3e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3595  translation initiation factor SUI1  48.19 
 
 
112 aa  75.1  3e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52235  normal  0.025407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0566  translation initiation factor Sui1  47.73 
 
 
123 aa  74.7  4e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0611  translation initiation factor Sui1  47.73 
 
 
123 aa  74.7  4e-13  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0649934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0605  translation initiation factor SUI1  47.73 
 
 
184 aa  74.7  4e-13  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2195  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  38.33 
 
 
121 aa  74.3  5e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0976146  normal  0.851363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0626  translation initiation factor Sui1  49.4 
 
 
123 aa  73.6  8e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2059  translation initiation factor SUI1  46.99 
 
 
120 aa  73.6  1e-12  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1338  translation initiation factor Sui1  37.84 
 
 
109 aa  72  2e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0446445  hitchhiker  0.000386966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1568  translation initiation factor Sui1  47.37 
 
 
121 aa  72  2e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1133  translation initiation factor Sui1  40.19 
 
 
109 aa  72.4  2e-12  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64000  translation initiation factor Sui1  44.32 
 
 
123 aa  72.4  2e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0636  translation initiation factor Sui1  44.71 
 
 
103 aa  71.2  4e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171454  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1238  translation initiation factor Sui1  39.64 
 
 
109 aa  71.2  4e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.120876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5560  translation initiation factor Sui1  44.32 
 
 
123 aa  71.2  5e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0267  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  50 
 
 
124 aa  71.2  5e-12  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2580  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  44.71 
 
 
107 aa  70.9  6e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2675  translation initiation factor Sui1  41.18 
 
 
121 aa  70.1  9e-12  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.5449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0726  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  40.91 
 
 
144 aa  70.1  1e-11  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1145  translation initiation factor Sui1  43.37 
 
 
109 aa  69.7  1e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.244875  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2854  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  39.51 
 
 
111 aa  69.7  1e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339586  normal  0.0877983 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3549  translation initiation factor SUI1  41.46 
 
 
120 aa  68.9  2e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0680444 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1443  translation initiation factor SUI1  50 
 
 
125 aa  69.3  2e-11  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  normal  0.134693 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1532  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  42.68 
 
 
107 aa  68.9  2e-11  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1912  translation initiation factor Sui1  42.68 
 
 
108 aa  68.9  2e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.70884e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02391  translation initiation factor SUI1  42.68 
 
 
107 aa  68.9  2e-11  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2237  translation initiation factor Sui1  42.68 
 
 
108 aa  68.9  2e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0294222  normal  0.0125302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4512  translation initiation factor SUI1  36.7 
 
 
112 aa  69.3  2e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.477068  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2023  translation initiation factor Sui1  42.68 
 
 
108 aa  68.9  2e-11  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.785803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2865  translation initiation factor SUI1  43.9 
 
 
119 aa  68.9  2e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0563  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  43.37 
 
 
83 aa  68.6  3e-11  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0717  translation initiation factor Sui1  39.51 
 
 
107 aa  68.2  3e-11  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00154405  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1201  translation initiation factor Sui1  40.96 
 
 
109 aa  68.2  3e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0177618  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2734  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  47.37 
 
 
141 aa  68.6  3e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0691  translation initiation factor Sui1  43.9 
 
 
121 aa  67.8  4e-11  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402227  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2186  translation initiation factor Sui1  43.9 
 
 
108 aa  68.2  4e-11  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.019439  hitchhiker  0.000338309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3345  translation initiation factor Sui1  40.96 
 
 
109 aa  68.2  4e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0321  translation initiation factor SUI1  38.66 
 
 
124 aa  67.8  4e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1200  translation initiation factor Sui1  40.96 
 
 
109 aa  66.2  1e-10  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  7.64802e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07040  translation initiation factor Sui1  46.59 
 
 
123 aa  66.2  1e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1271  translation initiation factor Sui1  40.96 
 
 
109 aa  66.6  1e-10  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  4.28708e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1592  translation initiation factor SUI1  42.68 
 
 
106 aa  66.6  1e-10  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1267  translation initiation factor Sui1  38.27 
 
 
102 aa  65.9  2e-10  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  7.76224e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1345  translation initiation factor Sui1  40.96 
 
 
112 aa  65.9  2e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00294429  hitchhiker  5.46863e-10 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1625  translation initiation factor Sui1  43.9 
 
 
108 aa  65.9  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00194965  hitchhiker  4.78145e-19 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01821  translation initiation factor SUI1  42.11 
 
 
108 aa  65.5  2e-10  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3018  translation initiation factor Sui1  40.96 
 
 
112 aa  65.9  2e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000751139  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1443  translation initiation factor Sui1  43.9 
 
 
108 aa  65.9  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.85964e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1835  translation initiation factor Sui1  43.9 
 
 
108 aa  65.9  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00136333  hitchhiker  0.000244384 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3033  translation initiation factor Sui1  40.96 
 
 
112 aa  65.9  2e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.99492e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1704  translation initiation factor SUI1  41.46 
 
 
108 aa  65.9  2e-10  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00246322  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1830  translation initiation factor Sui1  43.9 
 
 
108 aa  65.9  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0277649  hitchhiker  8.59561e-28 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2639  translation initiation factor Sui1  35.96 
 
 
109 aa  66.2  2e-10  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1892  translation initiation factor Sui1  43.9 
 
 
108 aa  65.9  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137818  hitchhiker  6.26787e-14 
 
 
-
 
NC_002950  PG0248  translation initation factor SUI1, putative  41.77 
 
 
110 aa  65.9  2e-10  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0651  translation initiation factor Sui1  38.27 
 
 
102 aa  65.9  2e-10  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  4.33453e-10  decreased coverage  6.13351e-05 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1737  translation initiation factor SUI1  42.68 
 
 
108 aa  65.9  2e-10  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084137  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0172  translation initiation factor Sui1  38.27 
 
 
102 aa  65.9  2e-10  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  1.41332e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3176  translation initiation factor Sui1  40.96 
 
 
112 aa  65.9  2e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00012053  hitchhiker  0.0057416 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1757  translation initiation factor SUI1  51.32 
 
 
120 aa  65.1  3e-10  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2851  translation initiation factor Sui1  39.29 
 
 
109 aa  64.7  5e-10  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181646  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4188  translation initiation factor SUI1  35.83 
 
 
141 aa  64.3  5e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0972  translation initiation factor 1 (eIF-1/SUI1)  42.11 
 
 
105 aa  64.3  5e-10  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  1.7895e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1511  translation initiation factor Sui1  41.46 
 
 
108 aa  63.9  6e-10  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  9.72273e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2680  translation initiation factor Sui1  37.74 
 
 
109 aa  64.3  6e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01715  Sui1 family protein  40.79 
 
 
110 aa  64.3  6e-10  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2344  translation initiation factor Sui1  41.46 
 
 
108 aa  63.9  7e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000454927  unclonable  1.5805e-08 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01270  hypothetical protein  41.46 
 
 
108 aa  63.9  7e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  5.44894e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1394  translation initiation factor Sui1  41.46 
 
 
108 aa  63.9  7e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  5.98621e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1485  translation initiation factor Sui1  41.46 
 
 
108 aa  63.9  7e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.05323e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1185  translation initiation factor SUI1  35.51 
 
 
114 aa  63.9  7e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00309802  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2365  translation initiation factor SUI1  41.46 
 
 
108 aa  63.9  7e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.10904e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01259  translation initiation factor Sui1  41.46 
 
 
108 aa  63.9  7e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  6.86676e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2646  translation initiation factor Sui1  43.42 
 
 
108 aa  63.5  9e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000146872  hitchhiker  6.03572e-06 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1846  translation initiation factor Sui1  41.46 
 
 
109 aa  63.5  9e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.34227e-06  hitchhiker  8.5212e-20 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05783  translation initiation factor Sui1  43.9 
 
 
103 aa  63.2  1e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2364  translation initiation factor Sui1  36.45 
 
 
111 aa  63.2  1e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0271288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>