More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_1154 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1154  shikimate 5-dehydrogenase  100 
 
 
298 aa  610  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3106  shikimate 5-dehydrogenase  79.02 
 
 
289 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2187  shikimate 5-dehydrogenase  62.13 
 
 
301 aa  358  7e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0690  shikimate 5-dehydrogenase  58.6 
 
 
288 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2736  shikimate 5-dehydrogenase  55.17 
 
 
298 aa  315  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4417  shikimate 5-dehydrogenase  56.14 
 
 
288 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4481  shikimate 5-dehydrogenase  56.14 
 
 
288 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2467  shikimate 5-dehydrogenase  55.24 
 
 
288 aa  309  2.9999999999999997e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502359  hitchhiker  0.0000000000141391 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18411  shikimate / quinate 5-dehydrogenase  43.54 
 
 
300 aa  242  5e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.611208 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2675  shikimate 5-dehydrogenase  45.52 
 
 
289 aa  240  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30051  shikimate 5-dehydrogenase  44.75 
 
 
322 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.355106 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2304  shikimate 5-dehydrogenase  43.75 
 
 
289 aa  233  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18961  shikimate 5-dehydrogenase  39.93 
 
 
285 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18961  shikimate 5-dehydrogenase  38.91 
 
 
286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1798  shikimate 5-dehydrogenase  40.83 
 
 
286 aa  221  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19151  shikimate 5-dehydrogenase  40.14 
 
 
286 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21871  shikimate 5-dehydrogenase  38.78 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1314  shikimate 5-dehydrogenase  37.54 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3060  shikimate 5-dehydrogenase  41.76 
 
 
277 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0854  shikimate dehydrogenase  38.91 
 
 
298 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4467  shikimate 5-dehydrogenase  39.5 
 
 
277 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00323757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4080  shikimate 5-dehydrogenase  40.07 
 
 
277 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4415  shikimate 5-dehydrogenase  39.72 
 
 
277 aa  192  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4070  shikimate 5-dehydrogenase  40.07 
 
 
277 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000710125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4185  shikimate 5-dehydrogenase  40.14 
 
 
277 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.263341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4356  shikimate 5-dehydrogenase  40.07 
 
 
277 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4232  shikimate 5-dehydrogenase  40.07 
 
 
277 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3564  shikimate dehydrogenase  39.65 
 
 
279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4561  shikimate 5-dehydrogenase  41 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.120804  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1503  shikimate 5-dehydrogenase  39.78 
 
 
284 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1392  shikimate dehydrogenase  42.21 
 
 
286 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.975798 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4454  shikimate 5-dehydrogenase  39.5 
 
 
277 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.809096  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2458  shikimate 5-dehydrogenase  38.7 
 
 
277 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000134489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0783  shikimate 5-dehydrogenase  39.72 
 
 
277 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000231913  hitchhiker  0.0000496147 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0022  shikimate dehydrogenase  38.6 
 
 
286 aa  183  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.301777  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0183  shikimate 5-dehydrogenase  41.29 
 
 
280 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0148  shikimate 5-dehydrogenase  39.21 
 
 
297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0524  shikimate 5-dehydrogenase  36.27 
 
 
290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1018  shikimate 5-dehydrogenase  38.23 
 
 
291 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0743  shikimate 5-dehydrogenase  38.25 
 
 
280 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.738673  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0182  shikimate 5-dehydrogenase  35.12 
 
 
298 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0361  shikimate 5-dehydrogenase  35.12 
 
 
298 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.746823 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1719  shikimate 5-dehydrogenase  41.26 
 
 
279 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.049913  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0450  shikimate 5-dehydrogenase  39.19 
 
 
278 aa  176  4e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0121036  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2746  shikimate 5-dehydrogenase  40.91 
 
 
288 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0290691  normal  0.306598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0663  shikimate 5-dehydrogenase  33.58 
 
 
294 aa  175  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2596  shikimate 5-dehydrogenase  41.42 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1962  shikimate 5-dehydrogenase  36.27 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1630  shikimate 5-dehydrogenase  41.79 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05960  shikimate 5-dehydrogenase  36.6 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0656  shikimate 5-dehydrogenase  39.12 
 
 
297 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2150  shikimate 5-dehydrogenase-like oxidoreductase  37.46 
 
 
283 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.411469  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1054  shikimate 5-dehydrogenase  38.43 
 
 
275 aa  169  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1490  shikimate 5-dehydrogenase  40.44 
 
 
286 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0290047  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3384  shikimate 5-dehydrogenase  34.72 
 
 
292 aa  165  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1558  shikimate dehydrogenase  39.79 
 
 
295 aa  163  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.523819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0108  shikimate 5-dehydrogenase  37.32 
 
 
289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2683  shikimate 5-dehydrogenase  38.6 
 
 
289 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.905975  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1652  shikimate 5-dehydrogenase  36.9 
 
 
293 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3572  shikimate 5-dehydrogenase  34.41 
 
 
284 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162128  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0993  shikimate 5-dehydrogenase  37.88 
 
 
276 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0923  shikimate dehydrogenase  36.88 
 
 
280 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1767  shikimate 5-dehydrogenase  36.77 
 
 
288 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393552  normal  0.147032 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2848  shikimate 5-dehydrogenase  35.89 
 
 
301 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1303  shikimate 5-dehydrogenase  32.75 
 
 
279 aa  159  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00894856  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0851  shikimate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 
292 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0253  shikimate 5-dehydrogenase  38.24 
 
 
284 aa  157  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2860  shikimate 5-dehydrogenase  36.53 
 
 
276 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.928598  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_004310  BR2069  shikimate 5-dehydrogenase  33.81 
 
 
284 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1184  shikimate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.504249  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1989  shikimate 5-dehydrogenase  33.7 
 
 
289 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6806  shikimate 5-dehydrogenase  36.11 
 
 
282 aa  155  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0429993  normal  0.348952 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2976  shikimate dehydrogenase  32.53 
 
 
280 aa  155  9e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1489  shikimate 5-dehydrogenase  37.28 
 
 
278 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1809  shikimate dehydrogenase  33.92 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4803  shikimate 5-dehydrogenase  34.78 
 
 
278 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.742777  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0708  shikimate dehydrogenase  36.86 
 
 
295 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0442  shikimate 5-dehydrogenase  35.71 
 
 
286 aa  152  8e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.437298  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0550  shikimate 5-dehydrogenase  36.2 
 
 
273 aa  151  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_408  shikimate 5-dehydrogenase  35.71 
 
 
286 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1774  shikimate 5-dehydrogenase  35.79 
 
 
293 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0689  shikimate 5-dehydrogenase  34.38 
 
 
285 aa  150  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3613  shikimate 5-dehydrogenase  38.46 
 
 
283 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2016  shikimate 5-dehydrogenase  35.94 
 
 
283 aa  149  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0465  shikimate 5-dehydrogenase  35.34 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1797  shikimate 5-dehydrogenase  33.68 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.910555  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3480  shikimate 5-dehydrogenase  35.88 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2671  shikimate 5-dehydrogenase  35.82 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2977  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  35.17 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188578  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1109  shikimate 5-dehydrogenase  36.52 
 
 
285 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2356  shikimate 5-dehydrogenase  30.9 
 
 
283 aa  146  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.49241e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1302  shikimate 5-dehydrogenase  34.77 
 
 
280 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0196  shikimate 5-dehydrogenase  33.81 
 
 
278 aa  146  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0088  shikimate 5-dehydrogenase  37.91 
 
 
271 aa  145  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1654  Shikimate dehydrogenase substrate binding domain protein  34.72 
 
 
290 aa  145  9e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.910773  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1385  quinate/shikimate dehydrogenase  32.26 
 
 
289 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.859901  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1168  shikimate dehydrogenase  34.46 
 
 
274 aa  144  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00990538  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2895  shikimate 5-dehydrogenase  35.07 
 
 
279 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0777149  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4263  shikimate 5-dehydrogenase  34.18 
 
 
285 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43866  normal  0.585644 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0693  shikimate 5-dehydrogenase  35.74 
 
 
271 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.324204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>