49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_0198 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0198  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 
178 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.183058  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0286  exonuclease  53.61 
 
 
192 aa  190  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.887668  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2846  exonuclease  38.32 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4730  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  38.04 
 
 
181 aa  109  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0819226  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0199  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  33.33 
 
 
227 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3566  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.84 
 
 
181 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1246  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  34.44 
 
 
279 aa  104  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2512  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  35.67 
 
 
182 aa  103  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105502  normal  0.618089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29850  Exonuclease  33.33 
 
 
185 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1602  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  33.93 
 
 
180 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.038144  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3951  exonuclease  35.09 
 
 
180 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152362  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1832  exonuclease  33.73 
 
 
181 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.408826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2023  exonuclease, putative  33.14 
 
 
180 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0659436  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3753  hypothetical protein  33.92 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3813  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.67 
 
 
183 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431588  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1621  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  36.26 
 
 
183 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.586954  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44130  hypothetical protein  33.73 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4247  exonuclease  35.67 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.351378  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0403  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.96 
 
 
201 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1896  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.34 
 
 
196 aa  93.6  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5536  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.39 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.794333  normal  0.986186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3013  sporulation inhibitor KapD  26.11 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2192  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.21 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0192  sporulation inhibitor KapD  24.84 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5042  sporulation inhibitor KapD  24.84 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5049  sporulation inhibitor KapD  24.84 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5054  sporulation inhibitor KapD  24.84 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4642  sporulation inhibitor KapD  24.84 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4732  sporulation inhibitor KapD  25.48 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0507  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  28.95 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.589563  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3521  sporulation inhibitor KapD  23.57 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4780  sporulation inhibitor KapD  24.2 
 
 
207 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5021  sporulation inhibitor KapD  24.2 
 
 
207 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5142  sporulation inhibitor KapD  24.2 
 
 
207 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4620  sporulation inhibitor KapD  24.2 
 
 
207 aa  62  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3552  exonuclease  25.66 
 
 
281 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000804471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3247  exonuclease  26.32 
 
 
281 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3296  exonuclease  26.32 
 
 
281 aa  58.2  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.1337599999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3556  exonuclease  26.32 
 
 
281 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3547  exonuclease  26.32 
 
 
281 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.95667e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3332  exonuclease  26.32 
 
 
281 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000115219  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01810  conserved hypothetical protein  35.05 
 
 
602 aa  57.4  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3241  exonuclease  25.49 
 
 
281 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000143121  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2121  exonuclease family protein  24.54 
 
 
300 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1671  exonuclease  25.62 
 
 
281 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000109537  decreased coverage  8.31519e-23 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2409  exonuclease family protein  24.54 
 
 
300 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.16874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3646  exonuclease  25 
 
 
281 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  26.86 
 
 
1407 aa  42.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1823  putative exonuclease  23.95 
 
 
184 aa  40.8  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000276682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>