114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_0056 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0056  WD40 domain-containing protein  100 
 
 
184 aa  377  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0520  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  80.33 
 
 
186 aa  309  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.118512  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4015  WD40 domain protein beta Propeller  61.96 
 
 
174 aa  207  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.482104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2651  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  55.36 
 
 
190 aa  200  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.136026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3466  WD40 domain protein beta Propeller  55.36 
 
 
190 aa  200  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  57.24 
 
 
197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4021  WD40 domain protein beta Propeller  47.79 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3979  hypothetical protein  47.79 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  41.95 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  41.43 
 
 
197 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  41.43 
 
 
197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0522  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  41.61 
 
 
172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  39.87 
 
 
160 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  39.87 
 
 
160 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0057  WD40 domain-containing protein  42.42 
 
 
175 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2013  hypothetical protein  41.48 
 
 
175 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.57132 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0417  hypothetical protein  31.21 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2264  hypothetical protein  29.75 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03171  hypothetical protein  29.03 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.954075 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  35.48 
 
 
428 aa  58.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2263  hypothetical protein  31.4 
 
 
176 aa  54.7  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.596766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  27.84 
 
 
560 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03181  hypothetical protein  29.27 
 
 
133 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_002620  TC0888  translocation protein TolB  29.71 
 
 
426 aa  50.4  0.00001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0416  hypothetical protein  29.36 
 
 
146 aa  50.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  28.03 
 
 
403 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  32.82 
 
 
440 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  31.15 
 
 
435 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  26.05 
 
 
442 aa  49.3  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  28.36 
 
 
436 aa  49.3  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  30.58 
 
 
440 aa  48.9  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  24.86 
 
 
444 aa  48.9  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  29.92 
 
 
421 aa  48.5  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  24.37 
 
 
442 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  24.37 
 
 
442 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  24.37 
 
 
442 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  24.37 
 
 
442 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  27.73 
 
 
427 aa  47.8  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  23.53 
 
 
442 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  25.21 
 
 
441 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  28.69 
 
 
432 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.08 
 
 
444 aa  47.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  30 
 
 
728 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  26.32 
 
 
438 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  23.53 
 
 
442 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  23.53 
 
 
442 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  32.37 
 
 
457 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  23.53 
 
 
442 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  23.53 
 
 
442 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  32.99 
 
 
431 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  31.96 
 
 
431 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  28.93 
 
 
451 aa  45.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  31.96 
 
 
431 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  28.32 
 
 
450 aa  46.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  31.03 
 
 
1059 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  28.95 
 
 
442 aa  45.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  31.96 
 
 
431 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  31.96 
 
 
431 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  30.93 
 
 
463 aa  45.1  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  29.37 
 
 
426 aa  45.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  28.57 
 
 
440 aa  45.1  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  28.57 
 
 
437 aa  45.1  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  24.37 
 
 
442 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  31.96 
 
 
431 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  35.05 
 
 
430 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  26.21 
 
 
567 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  35.05 
 
 
430 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  24.37 
 
 
441 aa  44.7  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  30.93 
 
 
431 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  30 
 
 
461 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  29.92 
 
 
443 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3117  WD40 domain-containing protein  25.52 
 
 
548 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000028868  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  35.05 
 
 
430 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  29.92 
 
 
440 aa  43.9  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  29.9 
 
 
463 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  26.56 
 
 
434 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3233  WD-40-like repeat-containing protein  23.19 
 
 
1048 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  29.77 
 
 
438 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.92 
 
 
1028 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  29.9 
 
 
430 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  29.9 
 
 
430 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  27.27 
 
 
1097 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  25.21 
 
 
440 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  29.46 
 
 
441 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  26.5 
 
 
444 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  26.89 
 
 
441 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  27.73 
 
 
432 aa  42.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  27.35 
 
 
449 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  27.35 
 
 
450 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  32.99 
 
 
446 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.74 
 
 
617 aa  42.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  27.62 
 
 
425 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  30 
 
 
449 aa  42.4  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  28.69 
 
 
428 aa  42.4  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.12 
 
 
428 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  26.5 
 
 
450 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1429  tol biopolymer transport system, periplasmic protein  30.28 
 
 
313 aa  42  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  0.112486 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  26.5 
 
 
450 aa  41.6  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.91 
 
 
652 aa  41.6  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.948007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  26.5 
 
 
449 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>