More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4792 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  89.2 
 
 		 528 aa  991    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 528 aa  1095    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  89.39 
 
 		 528 aa  993    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  55.26 
 
 		 526 aa  569  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  55.06 
 
 		 526 aa  567  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  52.5 
 
 		 544 aa  556  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  49.7 
 
 		 531 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  45.86 
 
 		 528 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  44.18 
 
 		 528 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  46 
 
 		 556 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  45.88 
 
 		 531 aa  440  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  43.94 
 
 		 527 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  43.59 
 
 		 532 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  44.44 
 
 		 526 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  42.75 
 
 		 527 aa  430  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  44.83 
 
 		 527 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  44.25 
 
 		 528 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  42.2 
 
 		 526 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  43.03 
 
 		 526 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  44.4 
 
 		 532 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  40.54 
 
 		 529 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  41.58 
 
 		 538 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  42.72 
 
 		 530 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0423  extracellular solute-binding protein  43.37 
 
 		 527 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204725  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  41.91 
 
 		 520 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  39.52 
 
 		 523 aa  368  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  39.31 
 
 		 523 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  40.12 
 
 		 526 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 		 524 aa  350  4e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  38.01 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  35.38 
 
 		 517 aa  325  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  36.17 
 
 		 514 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 		 528 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  33.58 
 
 		 535 aa  302  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  34.65 
 
 		 509 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 		 531 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  33.59 
 
 		 516 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  35.92 
 
 		 538 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  31.64 
 
 		 514 aa  286  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  34.46 
 
 		 535 aa  286  8e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  34.81 
 
 		 520 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  35.06 
 
 		 530 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  34.19 
 
 		 595 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  35.03 
 
 		 520 aa  279  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  34.42 
 
 		 533 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  33.59 
 
 		 519 aa  277  3e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.77 
 
 		 542 aa  277  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  32.6 
 
 		 526 aa  276  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 		 517 aa  274  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  33.21 
 
 		 517 aa  270  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  33.65 
 
 		 533 aa  270  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  35.16 
 
 		 532 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  34.77 
 
 		 532 aa  269  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  34.58 
 
 		 516 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  33.79 
 
 		 516 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  34.03 
 
 		 526 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  31.79 
 
 		 525 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  33.27 
 
 		 514 aa  262  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  34.26 
 
 		 528 aa  259  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 		 520 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  33.27 
 
 		 522 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  33.01 
 
 		 524 aa  258  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  33.14 
 
 		 512 aa  257  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 		 544 aa  256  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  32.11 
 
 		 521 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  30.34 
 
 		 537 aa  249  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  32.47 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.91 
 
 		 521 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  31.47 
 
 		 549 aa  240  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  32.6 
 
 		 515 aa  236  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  30.48 
 
 		 518 aa  236  8e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  32.72 
 
 		 534 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  32.45 
 
 		 534 aa  233  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 		 505 aa  210  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.96 
 
 		 534 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 		 521 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  31.12 
 
 		 521 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  31.12 
 
 		 521 aa  204  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  31.12 
 
 		 521 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  30.9 
 
 		 521 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  29.47 
 
 		 535 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 		 497 aa  179  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  23.61 
 
 		 527 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 532 aa  170  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 495 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 521 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 531 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 495 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3737  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 517 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  28.51 
 
 		 532 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 510 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.41 
 
 		 520 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 535 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  27.9 
 
 		 531 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 516 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.44 
 
 		 502 aa  157  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 532 aa  157  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>