More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4788 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.05 
 
 
849 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.83 
 
 
850 aa  641    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.28 
 
 
850 aa  649    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  44.89 
 
 
840 aa  655    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.47 
 
 
842 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.72 
 
 
849 aa  684    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.62 
 
 
851 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.83 
 
 
885 aa  746    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
892 aa  1742    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  44.66 
 
 
850 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  44.49 
 
 
850 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  44.32 
 
 
822 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.2 
 
 
843 aa  593  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.04 
 
 
840 aa  515  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  40.91 
 
 
783 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  40.34 
 
 
844 aa  498  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.08 
 
 
844 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:flavodoxin/nitric oxide synthase  48.36 
 
 
511 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0428  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.23 
 
 
526 aa  347  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5636  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  46.25 
 
 
533 aa  339  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.926538  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  45.26 
 
 
466 aa  333  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3992  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.06 
 
 
521 aa  332  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  44 
 
 
534 aa  312  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12370  sulfite reductase, NADPH flavoprotein alpha-component  45.72 
 
 
513 aa  307  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.23 
 
 
461 aa  298  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  38.96 
 
 
380 aa  231  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  38.96 
 
 
380 aa  231  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  41.51 
 
 
381 aa  226  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  32.97 
 
 
1257 aa  204  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  31.68 
 
 
1338 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  33.77 
 
 
397 aa  187  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  26.83 
 
 
607 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  31.51 
 
 
1357 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  31.32 
 
 
1341 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  30.3 
 
 
381 aa  181  5.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  37.6 
 
 
398 aa  177  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.97 
 
 
1401 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.27 
 
 
398 aa  171  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.89 
 
 
403 aa  171  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  29.89 
 
 
1396 aa  171  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  29.69 
 
 
1403 aa  170  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.29 
 
 
600 aa  169  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  29.35 
 
 
1400 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  32.06 
 
 
1313 aa  169  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.29 
 
 
588 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  29.29 
 
 
588 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  30.04 
 
 
1397 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1305  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.12 
 
 
610 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  29.85 
 
 
1397 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.93 
 
 
1395 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  34.7 
 
 
1342 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  31.25 
 
 
1394 aa  161  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.02 
 
 
613 aa  161  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  31.44 
 
 
1370 aa  161  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  27.11 
 
 
623 aa  161  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  29.26 
 
 
602 aa  161  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  29.35 
 
 
1312 aa  161  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  36.18 
 
 
411 aa  160  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  28.93 
 
 
584 aa  160  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  30.66 
 
 
1395 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  30.66 
 
 
1395 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  30.29 
 
 
1395 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.7 
 
 
607 aa  157  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3229  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.56 
 
 
1271 aa  157  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00976953  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  29.74 
 
 
1405 aa  157  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3291  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.56 
 
 
1271 aa  157  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.362066 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 
1407 aa  157  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  28.92 
 
 
614 aa  157  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  26.26 
 
 
608 aa  157  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  27.21 
 
 
631 aa  155  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3240  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.43 
 
 
1271 aa  155  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476034  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  30.38 
 
 
1405 aa  154  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.04 
 
 
591 aa  153  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  33.15 
 
 
388 aa  153  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  25.69 
 
 
969 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2225  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.92 
 
 
509 aa  152  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.653659  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  27.95 
 
 
599 aa  151  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  30.28 
 
 
1427 aa  152  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  25.54 
 
 
626 aa  152  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  25.54 
 
 
629 aa  151  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.99 
 
 
613 aa  151  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  27.77 
 
 
599 aa  151  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  27.7 
 
 
599 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  28.35 
 
 
607 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0233  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.22 
 
 
734 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  29.91 
 
 
1418 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  29.91 
 
 
1418 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5483  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.41 
 
 
589 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248188  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4916  PepSY-associated TM helix domain protein  34.5 
 
 
381 aa  149  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  29.91 
 
 
1418 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  29.91 
 
 
1398 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  25.73 
 
 
613 aa  149  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  29.91 
 
 
1418 aa  149  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  28.14 
 
 
1409 aa  149  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  29.91 
 
 
1418 aa  149  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  29.91 
 
 
1418 aa  149  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  27.16 
 
 
599 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  28.5 
 
 
1232 aa  147  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  27.04 
 
 
599 aa  147  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  30.18 
 
 
612 aa  147  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>