197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4764 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  71.61 
 
 
791 aa  1183    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  58.63 
 
 
799 aa  954    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  59.51 
 
 
822 aa  940    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  51.66 
 
 
860 aa  816    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  65.21 
 
 
774 aa  1022    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  100 
 
 
820 aa  1669    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  57.37 
 
 
814 aa  904    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  71.61 
 
 
783 aa  1159    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  67.45 
 
 
856 aa  1045    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  44.37 
 
 
819 aa  632  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  38.43 
 
 
811 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  39.06 
 
 
824 aa  508  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  37.74 
 
 
810 aa  505  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  38.36 
 
 
786 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  37.83 
 
 
813 aa  498  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  38.24 
 
 
786 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  37.7 
 
 
813 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  37.73 
 
 
786 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  37.48 
 
 
786 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  37.5 
 
 
786 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  37.62 
 
 
787 aa  487  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  36 
 
 
788 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  37.48 
 
 
786 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  37.48 
 
 
786 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  39.13 
 
 
863 aa  485  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  37.62 
 
 
787 aa  482  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  37.62 
 
 
787 aa  482  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  37.62 
 
 
787 aa  482  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  37.62 
 
 
787 aa  482  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  37.62 
 
 
787 aa  482  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  37.62 
 
 
787 aa  482  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  37.63 
 
 
761 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  35.37 
 
 
788 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  35.58 
 
 
789 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  36.88 
 
 
728 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  35.87 
 
 
836 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  34.37 
 
 
929 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  32.47 
 
 
808 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  33.09 
 
 
849 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  32.63 
 
 
776 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  32.5 
 
 
803 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  30.03 
 
 
841 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  33.43 
 
 
753 aa  360  4e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  31.02 
 
 
816 aa  357  6.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  32.41 
 
 
813 aa  342  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  32.53 
 
 
738 aa  330  9e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  30.65 
 
 
826 aa  323  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  30.21 
 
 
792 aa  316  9.999999999999999e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  31.36 
 
 
926 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  30.09 
 
 
792 aa  310  5.9999999999999995e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  29.7 
 
 
934 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  30.55 
 
 
757 aa  306  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  28.99 
 
 
935 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  29.7 
 
 
932 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  30.07 
 
 
794 aa  297  4e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  28.46 
 
 
937 aa  296  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  28.96 
 
 
905 aa  294  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  28.06 
 
 
839 aa  291  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  28.73 
 
 
922 aa  290  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  27.93 
 
 
839 aa  290  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  28.92 
 
 
764 aa  287  5e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  29.55 
 
 
924 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  30.56 
 
 
751 aa  283  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  31.35 
 
 
778 aa  283  9e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  28.61 
 
 
938 aa  280  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  28.78 
 
 
766 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  29.25 
 
 
774 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  29.76 
 
 
735 aa  273  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  29.44 
 
 
773 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  28.2 
 
 
774 aa  266  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  27.51 
 
 
1091 aa  261  4e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  28.24 
 
 
773 aa  258  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  28 
 
 
766 aa  258  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  28.23 
 
 
750 aa  257  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  27.47 
 
 
919 aa  254  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  26.84 
 
 
765 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  26.84 
 
 
765 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  28.39 
 
 
727 aa  252  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  26.81 
 
 
765 aa  252  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  28.39 
 
 
701 aa  251  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  26.47 
 
 
765 aa  250  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3636  organic solvent tolerance protein  26.51 
 
 
765 aa  248  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  27.18 
 
 
790 aa  248  4.9999999999999997e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  26.82 
 
 
765 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  26.94 
 
 
771 aa  244  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  26.68 
 
 
765 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  26.68 
 
 
765 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  26.68 
 
 
765 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  29.05 
 
 
794 aa  238  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2076  organic solvent tolerance protein  25.62 
 
 
870 aa  237  7e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0583626  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  27.01 
 
 
801 aa  237  8e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0106  organic solvent tolerance protein  25.5 
 
 
870 aa  234  5e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.307862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0603  organic solvent tolerance protein  26.4 
 
 
781 aa  231  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000490445  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  26.25 
 
 
799 aa  227  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0205  organic solvent tolerance protein  26.08 
 
 
781 aa  227  7e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.420377  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0058  organic solvent tolerance protein  26.39 
 
 
785 aa  226  9e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000119427  normal  0.365449 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0048  organic solvent tolerance protein  26.17 
 
 
784 aa  226  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000576585  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  26.33 
 
 
786 aa  225  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0102  organic solvent tolerance protein  26.33 
 
 
786 aa  225  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000015449  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0097  organic solvent tolerance protein  26.33 
 
 
786 aa  225  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0159547  normal  0.564558 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>