More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4686 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4686  DNA protecting protein DprA  100 
 
 		 408 aa  791    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4049  Fis family transcriptional regulator  69.78 
 
 		 386 aa  496  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3394  DNA protecting protein DprA  69.98 
 
 		 386 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4084  DNA protecting protein DprA  64.46 
 
 		 399 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4641  DNA processing protein DprA, putative  59.2 
 
 		 374 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5115  DNA protecting protein DprA  61.82 
 
 		 382 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3862  DNA processing protein DprA, putative  56.16 
 
 		 409 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3881  DNA protecting protein DprA  62.81 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0835  DNA protecting protein DprA  60.59 
 
 		 405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  57.99 
 
 		 365 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0348  DNA protecting protein DprA  55.53 
 
 		 379 aa  343  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.083083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0068  SMF protein  52.11 
 
 		 401 aa  331  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  51.06 
 
 		 336 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3681  DNA protecting protein DprA  52.61 
 
 		 402 aa  323  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3410  SMF protein  49.5 
 
 		 379 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487064  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3358  DNA protecting protein DprA  52.11 
 
 		 401 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.496729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0097  DNA protecting protein DprA  51.71 
 
 		 387 aa  315  9e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  50.75 
 
 		 358 aa  305  9.000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0395  DNA processing protein DprA, putative  47.74 
 
 		 372 aa  301  9e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0193  smf protein  48.4 
 
 		 375 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3567  DNA processing protein DprA, putative  50.37 
 
 		 371 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4417  SMF protein  45.54 
 
 		 421 aa  293  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0194  DNA processing protein DprA, putative  46.98 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0034  DNA protecting protein DprA  45.84 
 
 		 389 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0012  SMF protein  50.56 
 
 		 320 aa  286  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.143146 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  46.57 
 
 		 379 aa  280  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0308  DNA protecting protein DprA  45.31 
 
 		 422 aa  279  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3012  SMF protein  47.76 
 
 		 368 aa  278  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  45.75 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2841  DNA processing protein DprA, putative  44.55 
 
 		 364 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0148  DNA protecting protein DprA  47.42 
 
 		 434 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6479  SMF protein  42.63 
 
 		 448 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.848521 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0157  DNA protecting protein DprA  47.17 
 
 		 434 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38909  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0141  DNA processing protein DprA, putative  47.15 
 
 		 396 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2808  DNA protecting protein DprA  47.15 
 
 		 434 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2350  DNA protecting protein DprA  47.15 
 
 		 434 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2273  DNA protecting protein DprA  47.15 
 
 		 396 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  45.05 
 
 		 422 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  44.81 
 
 		 475 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  46.98 
 
 		 308 aa  262  6.999999999999999e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0345  SMF family protein  47.15 
 
 		 434 aa  262  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0017  DNA processing protein DprA, putative  46.58 
 
 		 365 aa  260  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  46.98 
 
 		 296 aa  260  4e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  44.58 
 
 		 475 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0018  DNA protecting protein DprA  46.58 
 
 		 365 aa  260  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645037  normal  0.109485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3066  DNA protecting protein DprA  44.5 
 
 		 422 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  43.79 
 
 		 422 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  46.4 
 
 		 433 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2275  DNA protecting protein DprA  44.61 
 
 		 377 aa  253  6e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  51.75 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2088  DNA protecting protein DprA  45.1 
 
 		 384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.972888  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2650  hypothetical protein  43.9 
 
 		 361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2520  hypothetical protein  43.73 
 
 		 361 aa  244  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  38.4 
 
 		 369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0023  filamentous haemagglutinin-like protein  40.88 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1931  DNA processing chain A  41.44 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1867  DNA protecting protein DprA  41.44 
 
 		 381 aa  233  6e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0890  SMF protein  41.01 
 
 		 358 aa  232  9e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000185705  hitchhiker  0.000000000000633505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  39.65 
 
 		 369 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  35.79 
 
 		 370 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  39.95 
 
 		 362 aa  229  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1985  DNA protecting protein DprA  42.09 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2444  DNA protecting protein DprA  39.8 
 
 		 389 aa  227  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000433746  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0022  DNA-processing protein smf chain A  50.16 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638184  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3125  DNA protecting protein DprA  43.42 
 
 		 425 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.142757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  42.39 
 
 		 365 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  43.33 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0019  SMF protein  40.55 
 
 		 366 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000611984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0025  DNA protecting protein DprA  40.12 
 
 		 379 aa  223  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2550  DNA processing protein DprA  38.58 
 
 		 356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304192  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002059  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  38 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04053  DNA protecting protein DprA  47 
 
 		 311 aa  223  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00230  putative Rossmann fold nucleotide-binding protein  56.36 
 
 		 362 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  37.92 
 
 		 352 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  47.37 
 
 		 366 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0474  DNA protecting protein DprA  40.74 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0037  DNA protecting protein DprA  37.09 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249396  normal  0.109899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3690  DNA protecting protein DprA  38.17 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216312  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  41.95 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0529  DNA protecting protein DprA  39.15 
 
 		 371 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102387  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  41.64 
 
 		 338 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  41.34 
 
 		 338 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0022  putative DNA processing protein DprA  36.54 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  41.99 
 
 		 365 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0040  DNA protecting protein DprA  43.32 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.529295 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  39.67 
 
 		 338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  42.72 
 
 		 365 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0034  DNA processing protein DprA, putative  43.13 
 
 		 338 aa  216  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  39.5 
 
 		 386 aa  216  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  38.05 
 
 		 361 aa  215  9e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  42.95 
 
 		 338 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  38.74 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0033  DNA protecting protein DprA  42.63 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150023 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0408  Rossmann-fold nucleotide-binding protein  39.9 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000102128  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  45.28 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  31.99 
 
 		 374 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0026  DNA protecting protein DprA  43.04 
 
 		 340 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0034  DNA protecting protein DprA  42.63 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3267  DNA protecting protein DprA  38.13 
 
 		 364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000733179  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0029  DNA protecting protein DprA  42.63 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>