More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4661 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4661  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  501  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.384248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  55.14 
 
 		 258 aa  239  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3370  transcriptional regulator, TetR family  57.37 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0063882  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2413  transcriptional regulator, TetR family  45.74 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  28.42 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  44.71 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  46.84 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  26.84 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0468  Transcriptional regulator TetR  52.94 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2892  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0741527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  34.94 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0401  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.533862  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  58 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14520  Transcriptional regulator PsrA  50 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  36.56 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1794  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.152901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.51 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  37.01 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  46.43 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  46.43 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3282  regulatory protein, TetR  46.43 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1789  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.461504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.12 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.12 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0462  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.573533  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  43.84 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  44.26 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2880  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 195 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  38.89 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  44.83 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0392  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 201 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  42.59 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 186 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  41.49 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 211 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1814  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0819  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.23 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.852921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 233 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2556  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.23 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1287  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.46 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  41.82 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  42.59 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>