More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4638 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  100 
 
 
224 aa  441  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  91.07 
 
 
224 aa  408  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  91.89 
 
 
224 aa  407  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  88.39 
 
 
224 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  89.64 
 
 
223 aa  401  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  89.19 
 
 
224 aa  397  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  87.84 
 
 
223 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  89.64 
 
 
226 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  86.49 
 
 
224 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  80.63 
 
 
223 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  77.58 
 
 
223 aa  352  4e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  77.48 
 
 
282 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  77.48 
 
 
282 aa  339  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  77.48 
 
 
252 aa  338  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  77.48 
 
 
242 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  77.48 
 
 
242 aa  338  5e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  77.48 
 
 
242 aa  337  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  77.03 
 
 
273 aa  337  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  76.47 
 
 
229 aa  337  9e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  76.58 
 
 
229 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  75.45 
 
 
266 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  76.02 
 
 
260 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  76.23 
 
 
247 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  76.23 
 
 
250 aa  332  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  76.92 
 
 
291 aa  332  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  75.78 
 
 
247 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  76.23 
 
 
247 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  76.23 
 
 
247 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  76.23 
 
 
247 aa  332  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  74.66 
 
 
253 aa  330  9e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.66 
 
 
235 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.54 
 
 
236 aa  321  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0550  response regulator transcription regulator protein  71.11 
 
 
232 aa  304  8.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.837595  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  70.59 
 
 
223 aa  297  8e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.68 
 
 
230 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.95 
 
 
220 aa  231  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  56.5 
 
 
220 aa  228  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.66 
 
 
224 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  53.57 
 
 
224 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 
230 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1190  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.64 
 
 
227 aa  218  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.3352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  56.05 
 
 
220 aa  218  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  51.82 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  52.91 
 
 
226 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  51.82 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  51.82 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  51.82 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  51.82 
 
 
223 aa  215  4e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  51.82 
 
 
287 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 
224 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 
224 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 
224 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 
224 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  52.02 
 
 
224 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  52.27 
 
 
223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  49.55 
 
 
232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  51.36 
 
 
267 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  52.04 
 
 
222 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  52.27 
 
 
223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 
225 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  49.1 
 
 
223 aa  211  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 
226 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 
225 aa  208  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  56.05 
 
 
220 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.77 
 
 
218 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  56.05 
 
 
220 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  56.05 
 
 
220 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  56.56 
 
 
220 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  56.05 
 
 
220 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  56.56 
 
 
224 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  56.05 
 
 
220 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  49.32 
 
 
226 aa  205  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  56.11 
 
 
241 aa  205  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  55.2 
 
 
225 aa  204  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  56.11 
 
 
224 aa  204  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  51.57 
 
 
229 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  50 
 
 
223 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 
223 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  50.45 
 
 
221 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 
222 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  55.2 
 
 
220 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  55.66 
 
 
283 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  50.67 
 
 
221 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  50.91 
 
 
223 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  51.58 
 
 
223 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 
239 aa  201  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4301  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 
223 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285594  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  47.96 
 
 
221 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 
222 aa  200  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 
223 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 
221 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.18 
 
 
231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2264  two component transcriptional regulator  52.04 
 
 
221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.664043  normal  0.0314152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.09 
 
 
221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 
221 aa  198  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  52.07 
 
 
220 aa  198  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  50 
 
 
223 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3169  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.121131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 
219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>