67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4560 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4560  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  100 
 
 
284 aa  570  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98407  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  43.92 
 
 
305 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  44.17 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  43.75 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.74 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.11 
 
 
126 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.88 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  34.43 
 
 
478 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.65 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.43 
 
 
478 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.92 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.24 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.71 
 
 
273 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  31.67 
 
 
144 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  28.97 
 
 
246 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.28 
 
 
165 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  30.61 
 
 
144 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.93 
 
 
524 aa  56.2  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1063  lipoprotein  32.2 
 
 
193 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  22.51 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
154 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3248  lipoprotein  30.48 
 
 
194 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  20.44 
 
 
297 aa  53.5  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  31 
 
 
132 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  30 
 
 
132 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  29.63 
 
 
281 aa  52.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3035  hypothetical protein  26.67 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3124  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.59 
 
 
143 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000058993  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3075  putative lipoprotein  26.13 
 
 
173 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000475601  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3216  putative lipoprotein  26.13 
 
 
173 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696284  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.17 
 
 
146 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0921  glycoprotein/polysaccharide metabolism  26.56 
 
 
189 aa  49.3  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.226366  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1112  putative lipoprotein  32.47 
 
 
163 aa  48.9  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000897823  hitchhiker  0.00000162029 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3054  lipoprotein  29.21 
 
 
185 aa  48.9  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0385716  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  29.79 
 
 
132 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  28.57 
 
 
132 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  29.79 
 
 
132 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0743  hypothetical protein  26.28 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.25 
 
 
150 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.11 
 
 
197 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1083  putative lipoprotein  28.12 
 
 
132 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0275  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.94 
 
 
145 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.69 
 
 
335 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0509  putative lipoprotein  23.48 
 
 
189 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0506  putative lipoprotein  23.48 
 
 
189 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0525  putative lipoprotein  23.48 
 
 
189 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465904  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0515  putative lipoprotein  23.48 
 
 
189 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0568  hypothetical protein  23.48 
 
 
189 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00405  predicted outer membrane lipoprotein  24.35 
 
 
190 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1969  putative lipoprotein  33.72 
 
 
162 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0543  putative lipoprotein  24.35 
 
 
185 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50203  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0489  putative lipoprotein  24.35 
 
 
190 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0530  putative lipoprotein  24.35 
 
 
190 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3162  glycoprotein/polysaccharide metabolism  24.35 
 
 
190 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0497  putative lipoprotein  24.35 
 
 
190 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00409  hypothetical protein  24.35 
 
 
190 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0582  putative lipoprotein  28.16 
 
 
143 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000375847  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4623  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.27 
 
 
257 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179388  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.51 
 
 
241 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  32.67 
 
 
141 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.63 
 
 
279 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  27.66 
 
 
132 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.69 
 
 
152 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0847  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.84 
 
 
144 aa  42.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.687312 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.35 
 
 
283 aa  43.1  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2767  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.15 
 
 
151 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795518  normal  0.509159 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3156  conserved hypothetical protein  23.48 
 
 
190 aa  42.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>