More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4344 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4344  porin  100 
 
 		 340 aa  686    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  50.14 
 
 		 327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  55.26 
 
 		 336 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  54.68 
 
 		 336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  51.14 
 
 		 329 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0130  outer membrane porin protein  41.57 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258844  normal  0.0261696 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  31.62 
 
 		 374 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  30.77 
 
 		 366 aa  119  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  33.51 
 
 		 362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  33.06 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  31.25 
 
 		 362 aa  113  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  31.81 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  34.12 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  30.86 
 
 		 335 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  28.17 
 
 		 374 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  33.12 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  30.14 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  30.46 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  28.4 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  30.87 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  33.61 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  29.94 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  29.78 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  29.07 
 
 		 376 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  29.35 
 
 		 373 aa  97.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  30.45 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  30.77 
 
 		 356 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  28.75 
 
 		 385 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  28.75 
 
 		 385 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  30.08 
 
 		 403 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  29.28 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2492  outer membrane protein (porin)  29.23 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  29.66 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  28.3 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5070  porin  29.81 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.189644 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  30.3 
 
 		 387 aa  94  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  29.74 
 
 		 436 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  30.75 
 
 		 364 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  28.84 
 
 		 368 aa  94  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  31.44 
 
 		 388 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  29.1 
 
 		 372 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  29.5 
 
 		 436 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  30.19 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  30.2 
 
 		 356 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  30.2 
 
 		 356 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  30.19 
 
 		 352 aa  93.2  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  29.71 
 
 		 386 aa  92.4  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  29.71 
 
 		 386 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  29.71 
 
 		 386 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  29.71 
 
 		 386 aa  92.4  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  29.71 
 
 		 386 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3897  porin  28.79 
 
 		 372 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239452 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  30 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  28.96 
 
 		 402 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  31.61 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  31.3 
 
 		 372 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  28.61 
 
 		 414 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  28.93 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7462  outer membrane protein (porin)  30.08 
 
 		 360 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00141122  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  32.04 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  31.83 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  30.13 
 
 		 363 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  42.01 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  29.62 
 
 		 359 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  29.97 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  27.27 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  29.54 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  32.35 
 
 		 389 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  31.36 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  27.69 
 
 		 384 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1245  porin  31.96 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240847  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  28.21 
 
 		 383 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  42.07 
 
 		 394 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  28.21 
 
 		 383 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  28.73 
 
 		 382 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  28.76 
 
 		 365 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0333  outer membrane porin, putative  28.4 
 
 		 365 aa  86.7  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277065  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  27.84 
 
 		 426 aa  86.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  27.59 
 
 		 383 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  29.57 
 
 		 372 aa  86.3  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  27.85 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  30.65 
 
 		 383 aa  86.3  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  28.33 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  28.33 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  28.72 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  28.42 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  28.74 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  35.93 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  30.08 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  29.32 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  29.82 
 
 		 384 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  30.73 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  27.91 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  29.26 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5190  outer membrane porin  27.56 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.353922 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  29.58 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  28.92 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  28.18 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  28.03 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  29.85 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>