201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4255 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  100 
 
 
441 aa  875    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  44.35 
 
 
475 aa  273  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  48.35 
 
 
337 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  46.53 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  43.33 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  40.21 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  48.68 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  48.68 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  45.33 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  42.86 
 
 
317 aa  72.8  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  41.76 
 
 
282 aa  72  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  47.5 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  41.67 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  43.21 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  39.13 
 
 
342 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  39.13 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  42.68 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  34.39 
 
 
231 aa  67  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  39.29 
 
 
360 aa  67  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  40.79 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  33.83 
 
 
231 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2943  protein TolA  42.22 
 
 
338 aa  64.7  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  40 
 
 
237 aa  64.3  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3117  protein TolA  35.48 
 
 
309 aa  63.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  41.98 
 
 
244 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  44.87 
 
 
245 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  40.24 
 
 
245 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  39.02 
 
 
226 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  39.02 
 
 
243 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  40.74 
 
 
245 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  37.8 
 
 
243 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  37.8 
 
 
226 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  37.8 
 
 
243 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0304  protein TolA  37.65 
 
 
275 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.28757  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  35.82 
 
 
283 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  41.77 
 
 
237 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  44.16 
 
 
212 aa  57.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0276  TonB domain-containing protein  40.96 
 
 
283 aa  57.4  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  35.66 
 
 
244 aa  56.6  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  30.6 
 
 
447 aa  56.6  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  35.66 
 
 
244 aa  56.6  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  42.31 
 
 
249 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  36.59 
 
 
245 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  37.18 
 
 
248 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  37.18 
 
 
248 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  40.48 
 
 
121 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  43.18 
 
 
219 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  37.18 
 
 
229 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  37.18 
 
 
246 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  37.18 
 
 
229 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  37.5 
 
 
243 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  37.18 
 
 
244 aa  55.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  43.18 
 
 
219 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  42.31 
 
 
266 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  42.31 
 
 
266 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  41.25 
 
 
269 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  37.18 
 
 
246 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  37.18 
 
 
246 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  42.31 
 
 
273 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  39.24 
 
 
277 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0734  TOLA-like transport transmembrane protein  34.52 
 
 
345 aa  54.3  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  39.24 
 
 
273 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  40.51 
 
 
233 aa  53.9  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  39.24 
 
 
274 aa  53.9  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  40.26 
 
 
258 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  36.25 
 
 
276 aa  53.5  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  39.24 
 
 
286 aa  53.5  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  31.82 
 
 
467 aa  53.5  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  50.98 
 
 
316 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  36.67 
 
 
285 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  32.35 
 
 
700 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  39.24 
 
 
275 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  38.1 
 
 
291 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  35.9 
 
 
295 aa  53.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  40.51 
 
 
193 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  31.91 
 
 
203 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  44.93 
 
 
507 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  39.77 
 
 
253 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  40 
 
 
117 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  40.51 
 
 
308 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  28.57 
 
 
203 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  40.51 
 
 
248 aa  51.6  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  35.77 
 
 
249 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  30.85 
 
 
203 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  35.56 
 
 
319 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  40.79 
 
 
289 aa  50.8  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  38.46 
 
 
275 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  35.44 
 
 
270 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  34.94 
 
 
351 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  31.17 
 
 
367 aa  50.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  29.79 
 
 
203 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  33 
 
 
252 aa  50.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  35.44 
 
 
264 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  29.79 
 
 
203 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  37.8 
 
 
218 aa  50.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  29.79 
 
 
203 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  36.71 
 
 
256 aa  50.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  34.18 
 
 
184 aa  50.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  34.57 
 
 
230 aa  50.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  36.71 
 
 
259 aa  50.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>