201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4108 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2898  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 
263 aa  544  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.160115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  100 
 
 
263 aa  544  1e-154  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  hitchhiker  0.00000213835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1638  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  70.57 
 
 
264 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.355798  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0177  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  71.21 
 
 
263 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.044334 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1697  hypothetical protein  70.08 
 
 
262 aa  394  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1068  DNA adenine methylase  70.08 
 
 
262 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.859034  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0463  putative N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  68.94 
 
 
263 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1923  DNA adenine methylase  69.7 
 
 
323 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595545  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1850  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  69.7 
 
 
262 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000906575  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1221  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  64.45 
 
 
265 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0898175  hitchhiker  0.0000277159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2112  DNA adenine methylase  62.99 
 
 
253 aa  338  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2158  DNA adenine methylase  62.99 
 
 
253 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000173496  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3388  DNA adenine methylase, putative  64.98 
 
 
264 aa  338  7e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3728  DNA adenine methylase  63.78 
 
 
274 aa  338  7e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0690  type II DNA modification methyltransferase, putative  62.6 
 
 
253 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2979  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  60.8 
 
 
254 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0181  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  59.84 
 
 
251 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2682  DNA adenine methylase  62.06 
 
 
263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1401  DNA adenine methylase  56.4 
 
 
253 aa  299  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.990942  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0660  prophage PSPPH06, putative adenine modification methytransferase  57.34 
 
 
225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3360  adenine specific DNA methyltransferase, D12 class  42.59 
 
 
262 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0051  putative modification methylase dpniia  39.22 
 
 
259 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0481115  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3004  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  42.45 
 
 
321 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3376  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  42.02 
 
 
268 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.684699  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3635  putative adenine-specific DNA methyltransferase  42.02 
 
 
268 aa  188  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0650243  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2052  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, D12 class  42.02 
 
 
268 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0637864  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1627  putative N-6 adenine-specific DNA methylase  41.31 
 
 
268 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3769  adenine-specific DNA methyltransferase  41.63 
 
 
268 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307242  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3649  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.45 
 
 
291 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.782627  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3396  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.32 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181939  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3085  Site-specific DNA methylase protein  44.62 
 
 
251 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0834  DNA adenine methylase  37.55 
 
 
251 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000010943  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0220  DNA adenine methylase  32.4 
 
 
271 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1279  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.1 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.230898  hitchhiker  0.0056893 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2787  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.42 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113292  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0139  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  37.1 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1568  methyltransferase, putative  36.56 
 
 
296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.58261  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1475  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.85 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0465  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  31.72 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.821976  normal  0.340502 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1787  hypothetical protein  56.18 
 
 
93 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4452  DNA adenine methyltransferase  29.52 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3349  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  35.48 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1108  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.9 
 
 
673 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1822  DNA adenine methylase  30.62 
 
 
273 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0677  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  32.88 
 
 
271 aa  92  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0743  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  33.33 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0512045  hitchhiker  0.00111999 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4275  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.87 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.020773  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2376  DNA adenine methyltransferase  29.52 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00648987  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4006  DNA adenine methylase  25.86 
 
 
279 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081668 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1973  hypothetical protein  60.87 
 
 
87 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.108643  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1246  hypothetical protein  60.87 
 
 
87 aa  85.5  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0261  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.83 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2345  hypothetical protein  58.73 
 
 
73 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2500  hypothetical protein  57.35 
 
 
87 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2747  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  34.22 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.356078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1897  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.78 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2739  DNA adenine methylase  29.15 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3140  DNA adenine methylase  27.62 
 
 
638 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3363  DNA adenine methylase  29.15 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.757208  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0647  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.95 
 
 
704 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1737  DNA adenine methylase  27.74 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00929025  normal  0.808648 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0670  DNA adenine methylase  30.82 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0429675  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4929  DNA adenine methylase  33.68 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.307357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2470  DNA adenine methylase  28.35 
 
 
280 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1163  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.68 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2663  DNA adenine methylase  28.73 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00294021  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3758  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.05 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98981  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0179  DNA adenine methylase  31.41 
 
 
278 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000431718  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3347  DNA adenine methylase  27.92 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.873533  normal  0.758382 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04430  DNA adenine methylase  25.42 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4254  DNA adenine methylase  23.32 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5102  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.72 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2199  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  29.06 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608262 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4215  DNA adenine methylase  23.32 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3351  DNA adenine methylase  25 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28151  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4115  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.33 
 
 
530 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2016  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.07 
 
 
306 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.469174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1989  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.07 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2646  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  28.94 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3991  DNA adenine methylase  23.49 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.075904  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0836  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  30.23 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3837  DNA adenine methylase  25.54 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1093  DNA adenine methylase  32.82 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.118835  hitchhiker  0.000226621 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2380  DNA adenine methylase  50.75 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3321  DNA adenine methylase  24.64 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0264  DNA adenine methylase  23.66 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0659762  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0884  DNA adenine methylase  25.52 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000960446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.27 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0103783  normal  0.290519 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1499  DNA adenine methylase  23.66 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.142483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4602  DNA adenine methylase  32.76 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0997785  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1513  DNA adenine methylase  26.98 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971855  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0216  DNA adenine methylase  24.73 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0213822 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1929  DNA adenine methylase  47.44 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168288  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4704  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  27.46 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0118751  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1835  DNA adenine methylase  29.41 
 
 
302 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3043  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.15 
 
 
287 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  0.895873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5496  D12 class N6 adenine-specific DNA methyltransferase  26.74 
 
 
286 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2339  hypothetical protein  51.61 
 
 
102 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4262  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  25 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0349455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0828  DNA adenine methylase  23.83 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.90544  normal  0.644022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>