More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3981 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  74.1 
 
 
872 aa  1196  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  100 
 
 
861 aa  1725  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  74.71 
 
 
890 aa  1258  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  70.09 
 
 
855 aa  1145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  85.83 
 
 
875 aa  1471  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  85.85 
 
 
861 aa  1450  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  74.18 
 
 
855 aa  1217  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  62.84 
 
 
856 aa  1064  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  74.18 
 
 
855 aa  1253  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  66.74 
 
 
857 aa  1158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  69.04 
 
 
856 aa  1182  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  75.44 
 
 
862 aa  1216  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  68.15 
 
 
856 aa  1147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  47.07 
 
 
871 aa  705  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  69 
 
 
858 aa  1193  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  54.02 
 
 
896 aa  885  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  85.73 
 
 
861 aa  1447  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  70.09 
 
 
855 aa  1145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  63.48 
 
 
856 aa  1074  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  73.66 
 
 
865 aa  1238  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.42292e-09 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  39.37 
 
 
876 aa  617  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  43.71 
 
 
878 aa  613  1e-174  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  40.89 
 
 
906 aa  605  1e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  40.23 
 
 
895 aa  598  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  43.14 
 
 
883 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  38.24 
 
 
894 aa  593  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  42.32 
 
 
886 aa  595  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  42.32 
 
 
886 aa  595  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  41.23 
 
 
894 aa  588  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  38.68 
 
 
882 aa  582  1e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  41.99 
 
 
910 aa  583  1e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  38.83 
 
 
893 aa  578  1e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  37.91 
 
 
887 aa  575  1e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  40.23 
 
 
902 aa  570  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  41.18 
 
 
914 aa  567  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  43.31 
 
 
879 aa  563  1e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  39.73 
 
 
877 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  39.61 
 
 
877 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  40.32 
 
 
881 aa  556  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  41.2 
 
 
908 aa  553  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  39.52 
 
 
879 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  40 
 
 
918 aa  552  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  38.37 
 
 
885 aa  546  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  39.7 
 
 
901 aa  535  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  34.99 
 
 
874 aa  514  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  38.95 
 
 
900 aa  514  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  34.39 
 
 
874 aa  508  1e-142  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  37.46 
 
 
939 aa  508  1e-142  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  44.24 
 
 
755 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  41.34 
 
 
746 aa  485  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  40.6 
 
 
741 aa  476  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  40.17 
 
 
751 aa  471  1e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  42.07 
 
 
723 aa  472  1e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  39.67 
 
 
727 aa  462  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.02251e-09 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  42.58 
 
 
722 aa  460  1e-128  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  40 
 
 
730 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  39.39 
 
 
743 aa  455  1e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  39.37 
 
 
730 aa  456  1e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  39.73 
 
 
744 aa  449  1e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  39.79 
 
 
723 aa  443  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  39.71 
 
 
727 aa  440  1e-122  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  40.52 
 
 
748 aa  428  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  28.84 
 
 
622 aa  224  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  31.78 
 
 
636 aa  216  2e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  31.68 
 
 
637 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  31.25 
 
 
646 aa  211  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  22.58 
 
 
741 aa  211  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.48446e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  36.97 
 
 
538 aa  208  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  33.4 
 
 
664 aa  204  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  33.83 
 
 
584 aa  198  5e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  28.39 
 
 
560 aa  197  9e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.69 
 
 
778 aa  194  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.69 
 
 
778 aa  193  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  31.37 
 
 
573 aa  189  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  39.04 
 
 
576 aa  188  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  33.86 
 
 
328 aa  184  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  30 
 
 
647 aa  176  2e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  35.91 
 
 
593 aa  176  2e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  38.17 
 
 
581 aa  175  3e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.62 
 
 
757 aa  174  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.56 
 
 
755 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.31 
 
 
755 aa  172  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  37.38 
 
 
585 aa  170  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  36.48 
 
 
579 aa  170  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  38.17 
 
 
581 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  38.17 
 
 
581 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  35.6 
 
 
597 aa  169  3e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  37.54 
 
 
581 aa  168  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  37.22 
 
 
593 aa  164  5e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  36.16 
 
 
562 aa  164  8e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  35.91 
 
 
571 aa  163  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  35.65 
 
 
594 aa  162  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  35.65 
 
 
594 aa  162  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  35.65 
 
 
594 aa  162  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  36.56 
 
 
585 aa  161  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  36.88 
 
 
569 aa  160  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  35.83 
 
 
584 aa  160  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 
1103 aa  159  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3641  glutathione synthase  34.7 
 
 
595 aa  159  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  37.11 
 
 
579 aa  156  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>