More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3937 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  660  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  85.57 
 
 
339 aa  525  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  74.85 
 
 
330 aa  498  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  74.85 
 
 
330 aa  494  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  74.75 
 
 
335 aa  438  1e-122  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  63.91 
 
 
335 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  63.47 
 
 
334 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  55.95 
 
 
345 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  55.95 
 
 
345 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  56.68 
 
 
333 aa  362  5e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  56.17 
 
 
360 aa  361  9e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  56.31 
 
 
339 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  52.98 
 
 
336 aa  355  9e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  53.94 
 
 
328 aa  352  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  53.92 
 
 
328 aa  352  6e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  54.09 
 
 
327 aa  352  6e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  54.13 
 
 
333 aa  349  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  56.15 
 
 
324 aa  348  6e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  51.2 
 
 
331 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  51.06 
 
 
344 aa  346  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  56.19 
 
 
328 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  51.23 
 
 
333 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  52.73 
 
 
314 aa  342  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  51.5 
 
 
325 aa  341  8e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  51.43 
 
 
327 aa  342  8e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  54.15 
 
 
330 aa  340  3e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  53.85 
 
 
327 aa  337  1e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  52.32 
 
 
331 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  53.85 
 
 
328 aa  332  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  51.42 
 
 
318 aa  332  5e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  55.18 
 
 
323 aa  331  9e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  51.32 
 
 
328 aa  330  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  51.32 
 
 
328 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  51.4 
 
 
326 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  54.18 
 
 
331 aa  328  6e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  51.86 
 
 
349 aa  328  1e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  50.9 
 
 
358 aa  327  1e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  52.84 
 
 
324 aa  327  2e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  52 
 
 
327 aa  324  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  52 
 
 
325 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  54.64 
 
 
330 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  51.8 
 
 
322 aa  322  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  51.26 
 
 
323 aa  322  7e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  51.51 
 
 
330 aa  322  8e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  51.51 
 
 
330 aa  322  8e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  54.49 
 
 
325 aa  321  8e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  49.06 
 
 
325 aa  321  9e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  51.82 
 
 
330 aa  320  2e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  50 
 
 
339 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  49.54 
 
 
328 aa  319  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  50.67 
 
 
321 aa  320  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  49.84 
 
 
356 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  51.53 
 
 
336 aa  319  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  51.6 
 
 
330 aa  318  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3547  hypothetical protein  53.25 
 
 
330 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  46.75 
 
 
322 aa  318  9e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  47.51 
 
 
325 aa  316  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  51.34 
 
 
326 aa  315  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  51.3 
 
 
341 aa  315  6e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  51.68 
 
 
325 aa  315  6e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  48.78 
 
 
329 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  50.31 
 
 
328 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  50 
 
 
326 aa  314  1e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  50.76 
 
 
330 aa  313  2e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  50.83 
 
 
335 aa  313  2e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  50.65 
 
 
335 aa  313  2e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  51.34 
 
 
324 aa  313  2e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  48 
 
 
330 aa  313  3e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  49.37 
 
 
324 aa  313  3e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  49.84 
 
 
324 aa  312  5e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  50.31 
 
 
322 aa  312  5e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  50.82 
 
 
359 aa  312  6e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  47.92 
 
 
337 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  47.45 
 
 
344 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  50 
 
 
339 aa  309  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  52.56 
 
 
329 aa  309  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  49.85 
 
 
331 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  47.55 
 
 
326 aa  308  9e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  50.48 
 
 
320 aa  308  1e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  1.0806e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  53.74 
 
 
330 aa  308  1e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  47.19 
 
 
336 aa  307  2e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  49.66 
 
 
321 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  49.83 
 
 
334 aa  305  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  47.35 
 
 
349 aa  305  7e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  49.83 
 
 
327 aa  304  1e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  49.03 
 
 
331 aa  304  1e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  49.85 
 
 
386 aa  303  3e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  50.34 
 
 
335 aa  303  3e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  46.8 
 
 
325 aa  302  4e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  47.56 
 
 
337 aa  303  4e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  46.64 
 
 
334 aa  302  4e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  45.43 
 
 
334 aa  302  5e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  54.7 
 
 
328 aa  301  9e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  47.83 
 
 
334 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  50.17 
 
 
326 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  49.83 
 
 
322 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  43.83 
 
 
328 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  45.45 
 
 
336 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  45.48 
 
 
332 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  49.01 
 
 
335 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>