232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3829 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  67.77 
 
 
545 aa  684    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  66.79 
 
 
553 aa  667    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  67.03 
 
 
549 aa  680    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  67.82 
 
 
549 aa  676    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  68.32 
 
 
552 aa  670    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  70.04 
 
 
553 aa  733    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  67.96 
 
 
545 aa  686    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  70.22 
 
 
553 aa  737    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  70.77 
 
 
554 aa  732    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  68.01 
 
 
552 aa  689    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  67.82 
 
 
548 aa  695    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  65.25 
 
 
537 aa  652    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  67.64 
 
 
549 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  67.46 
 
 
552 aa  685    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  67.83 
 
 
575 aa  694    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  66.12 
 
 
550 aa  686    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
547 aa  1089    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  78.24 
 
 
556 aa  824    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  67.16 
 
 
553 aa  671    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  73.24 
 
 
558 aa  748    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  80.44 
 
 
545 aa  825    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  67.83 
 
 
575 aa  694    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  65.38 
 
 
556 aa  648    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  66.06 
 
 
551 aa  689    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  67.16 
 
 
553 aa  670    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  67.59 
 
 
545 aa  682    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  67.02 
 
 
566 aa  682    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  68.45 
 
 
552 aa  689    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  65.5 
 
 
546 aa  639    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  61.17 
 
 
553 aa  624  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  55.82 
 
 
538 aa  570  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  54.45 
 
 
467 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  54.45 
 
 
467 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  53.46 
 
 
467 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  55.58 
 
 
475 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  55.35 
 
 
467 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  42.98 
 
 
570 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  47.59 
 
 
456 aa  385  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  45.58 
 
 
471 aa  379  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  44.76 
 
 
463 aa  371  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  42.81 
 
 
507 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  45.15 
 
 
464 aa  366  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  46.5 
 
 
464 aa  363  5.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  47.17 
 
 
455 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  44.72 
 
 
518 aa  349  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  45.27 
 
 
448 aa  345  1e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 
433 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  33.26 
 
 
418 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  34.75 
 
 
412 aa  248  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  35.15 
 
 
411 aa  248  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  36.58 
 
 
421 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  35.07 
 
 
413 aa  239  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 
424 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  35.02 
 
 
424 aa  236  9e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  35.86 
 
 
406 aa  225  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  34.78 
 
 
424 aa  224  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  36.44 
 
 
397 aa  204  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  29.89 
 
 
401 aa  199  9e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  31.06 
 
 
428 aa  178  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  31.5 
 
 
442 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
453 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 
453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  30.69 
 
 
938 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  27.84 
 
 
419 aa  127  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
425 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  25.3 
 
 
418 aa  123  8e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  27.42 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  36.11 
 
 
679 aa  114  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
415 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  24.76 
 
 
391 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  25.27 
 
 
412 aa  111  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  27.71 
 
 
438 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 
421 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 
408 aa  100  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
430 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  23.98 
 
 
410 aa  97.8  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
414 aa  97.8  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  25.29 
 
 
421 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 
421 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  26.07 
 
 
431 aa  95.1  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
421 aa  94.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  28.36 
 
 
404 aa  93.2  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  25.92 
 
 
429 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 
465 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  28.25 
 
 
430 aa  91.3  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 
434 aa  91.3  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  24.93 
 
 
436 aa  91.3  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  22.37 
 
 
402 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  22.37 
 
 
402 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  23.61 
 
 
455 aa  89  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  25.05 
 
 
454 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  22.93 
 
 
402 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  22.93 
 
 
400 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  22.93 
 
 
402 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  25 
 
 
398 aa  87.4  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  25 
 
 
398 aa  87.4  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  25 
 
 
398 aa  87.4  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  23.64 
 
 
408 aa  87  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>