More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3805 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 
404 aa  816    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  59.4 
 
 
402 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  60.15 
 
 
415 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  55.78 
 
 
410 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  57.89 
 
 
402 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  57.14 
 
 
402 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  54.61 
 
 
410 aa  455  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  56.36 
 
 
411 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  54.21 
 
 
411 aa  449  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  56.28 
 
 
416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  56.36 
 
 
412 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  53.92 
 
 
408 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  54.86 
 
 
414 aa  418  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  51.52 
 
 
409 aa  365  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  50 
 
 
413 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3135  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  52.01 
 
 
404 aa  359  4e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167539  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2337  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  47.49 
 
 
408 aa  339  5.9999999999999996e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.91 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.81 
 
 
419 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.04 
 
 
428 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.91 
 
 
429 aa  279  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.2 
 
 
416 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.36 
 
 
430 aa  256  4e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.4 
 
 
442 aa  249  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.01 
 
 
417 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.52 
 
 
440 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1290  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.56 
 
 
414 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.58 
 
 
508 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.15 
 
 
415 aa  206  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.3 
 
 
428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.01 
 
 
397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.41 
 
 
392 aa  166  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0681  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.5 
 
 
416 aa  162  7e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30 
 
 
405 aa  158  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00881  diaminopimelate decarboxylase protein  32.82 
 
 
413 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1275  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.95 
 
 
421 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.548043  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  29.75 
 
 
420 aa  155  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3735  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.7 
 
 
388 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0413562  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3096  diaminopimelate decarboxylase  32.35 
 
 
394 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294938  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0114  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.84 
 
 
400 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.84 
 
 
400 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  31.34 
 
 
422 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2676  Diaminopimelate decarboxylase  31.43 
 
 
418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.438266  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  30.35 
 
 
402 aa  145  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  31.03 
 
 
427 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0717  diaminopimelate decarboxylase  32.02 
 
 
402 aa  144  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0591874 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  31.77 
 
 
419 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  31.77 
 
 
419 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.08 
 
 
418 aa  143  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  30.16 
 
 
402 aa  142  8e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  30.7 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  30.65 
 
 
421 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  31.28 
 
 
427 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  30.08 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4782  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.02 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49913  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  29.62 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  30.81 
 
 
421 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  31.43 
 
 
421 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6954  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.59 
 
 
403 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160275  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2585  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2:Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.26 
 
 
402 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.126508  decreased coverage  0.000677908 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001062  vibrioferrin decarboxylase protein PvsE  27.97 
 
 
400 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  31.75 
 
 
394 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  28.54 
 
 
447 aa  136  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  30.26 
 
 
422 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  28.4 
 
 
429 aa  135  9e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1147  diaminopimelate decarboxylase  31.61 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  30.91 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  29.53 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  29.77 
 
 
421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  27.74 
 
 
407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8366  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.07 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4395  decarboxylase domain-containing protein  53.91 
 
 
171 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  29.47 
 
 
430 aa  134  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2972  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.01 
 
 
362 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.980745 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  28.16 
 
 
418 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  30.58 
 
 
416 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1362  diaminopimelate decarboxylase  29.6 
 
 
401 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.884156  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  26.8 
 
 
419 aa  133  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  31.6 
 
 
423 aa  133  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  29.72 
 
 
422 aa  132  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  29.27 
 
 
422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  29.52 
 
 
430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  27.18 
 
 
399 aa  130  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  28.85 
 
 
434 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  28.61 
 
 
401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  29.78 
 
 
429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  29.51 
 
 
418 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  29.23 
 
 
421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  30.81 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  31.27 
 
 
414 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  29.51 
 
 
421 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  30.39 
 
 
416 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0878  diaminopimelate decarboxylase  28.57 
 
 
465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.109774  normal  0.537155 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  26.45 
 
 
420 aa  126  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  29.78 
 
 
415 aa  126  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  30.56 
 
 
451 aa  126  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  28.82 
 
 
421 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  27.65 
 
 
445 aa  126  8.000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  28.09 
 
 
421 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  29.9 
 
 
421 aa  126  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.844313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>