More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3783 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  56.85 
 
 
792 aa  910    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  69.18 
 
 
756 aa  1019    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  70.93 
 
 
572 aa  852    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  63.97 
 
 
794 aa  940    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  63.69 
 
 
748 aa  1009    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  61.06 
 
 
841 aa  661    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  68.89 
 
 
755 aa  1013    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
785 aa  1619    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  61.21 
 
 
778 aa  955    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  61.06 
 
 
841 aa  661    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  63.57 
 
 
907 aa  1017    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  60.47 
 
 
838 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  63.98 
 
 
774 aa  1015    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  63.03 
 
 
730 aa  994    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  61.06 
 
 
841 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  69.43 
 
 
788 aa  1090    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  42.76 
 
 
734 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  42.76 
 
 
734 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  42.76 
 
 
734 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  42.8 
 
 
731 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  42.76 
 
 
734 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  42.76 
 
 
734 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  42.76 
 
 
734 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  44.73 
 
 
731 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  54.47 
 
 
901 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  56.4 
 
 
886 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  43.76 
 
 
734 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  53.7 
 
 
975 aa  574  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  42.64 
 
 
741 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  43.47 
 
 
734 aa  572  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  41.83 
 
 
757 aa  568  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  42.76 
 
 
741 aa  567  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  41.44 
 
 
741 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  39.55 
 
 
771 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  41.09 
 
 
712 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  40.47 
 
 
689 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  41.55 
 
 
724 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  40.82 
 
 
689 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  40.13 
 
 
767 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  40 
 
 
767 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  39.07 
 
 
794 aa  511  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  45.07 
 
 
780 aa  507  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  43.64 
 
 
777 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  37.5 
 
 
792 aa  485  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  37.69 
 
 
796 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  41.53 
 
 
725 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  44.91 
 
 
687 aa  455  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  42.1 
 
 
743 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  37.23 
 
 
783 aa  449  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  44.19 
 
 
646 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  42.61 
 
 
645 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  44.19 
 
 
643 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  40.03 
 
 
729 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  42.5 
 
 
676 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  39.87 
 
 
729 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  38.96 
 
 
714 aa  438  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  40.16 
 
 
769 aa  438  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  39.47 
 
 
730 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  35.41 
 
 
1981 aa  432  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  36.88 
 
 
703 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  37.92 
 
 
683 aa  422  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  38.69 
 
 
735 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  37.54 
 
 
683 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  37.67 
 
 
753 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  39.86 
 
 
775 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  39.86 
 
 
775 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  40.04 
 
 
775 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  39.86 
 
 
775 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  40.04 
 
 
775 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  39.86 
 
 
775 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  40.04 
 
 
775 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  40.32 
 
 
618 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  35.22 
 
 
872 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  34.79 
 
 
858 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  34.79 
 
 
930 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  34.79 
 
 
896 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  34.11 
 
 
1057 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  37.46 
 
 
661 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  37.95 
 
 
661 aa  376  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  37.62 
 
 
661 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  37.46 
 
 
661 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  37.46 
 
 
661 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  37.46 
 
 
661 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  37.46 
 
 
661 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  37.77 
 
 
661 aa  372  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  32.09 
 
 
741 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  32.88 
 
 
741 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  36.7 
 
 
922 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  36.7 
 
 
874 aa  365  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  36.7 
 
 
916 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  40.12 
 
 
540 aa  366  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  38.28 
 
 
618 aa  364  4e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  35.33 
 
 
1048 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  35 
 
 
668 aa  360  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  33.65 
 
 
692 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  34.71 
 
 
669 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  35.26 
 
 
641 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  35.47 
 
 
613 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  38.28 
 
 
616 aa  353  8e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  36.83 
 
 
614 aa  352  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>