More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3675 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  100 
 
 
103 aa  204  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  96.12 
 
 
103 aa  196  1e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  95.15 
 
 
103 aa  194  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  93.14 
 
 
103 aa  192  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  93.2 
 
 
103 aa  191  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  93.14 
 
 
103 aa  188  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  88.24 
 
 
131 aa  184  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  89.11 
 
 
103 aa  184  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  89.11 
 
 
103 aa  184  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  87.13 
 
 
103 aa  181  2e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  86.14 
 
 
103 aa  180  5e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  76.7 
 
 
103 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  76.7 
 
 
103 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  75.73 
 
 
103 aa  164  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  75.73 
 
 
103 aa  164  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  75.73 
 
 
103 aa  163  6e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  74.76 
 
 
103 aa  163  7e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  70.87 
 
 
103 aa  160  8e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  72.82 
 
 
103 aa  158  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  3.99206e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  71.84 
 
 
103 aa  156  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  73.79 
 
 
103 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  1.032e-07  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  73.79 
 
 
103 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  1.78483e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  73.79 
 
 
103 aa  154  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  73.79 
 
 
103 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  73.79 
 
 
103 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  6.19372e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  73.79 
 
 
103 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  2.05057e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  73.79 
 
 
103 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  72.82 
 
 
103 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  72.82 
 
 
103 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  72.82 
 
 
103 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  72.82 
 
 
103 aa  152  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  72.82 
 
 
103 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  72.82 
 
 
103 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  72.82 
 
 
103 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  72.82 
 
 
103 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  72.82 
 
 
103 aa  151  3e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  72.82 
 
 
103 aa  151  3e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  66.02 
 
 
103 aa  148  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  64.71 
 
 
103 aa  145  2e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  67.96 
 
 
104 aa  144  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.52954e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 
103 aa  127  4e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 
103 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0701  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 
103 aa  127  7e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  57.28 
 
 
103 aa  125  1e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  5.79103e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 
103 aa  126  1e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0797  ribosomal protein L21  56.31 
 
 
103 aa  126  1e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 
103 aa  125  2e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
103 aa  125  2e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  58.42 
 
 
103 aa  124  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  61.39 
 
 
102 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.44419e-06  hitchhiker  2.01625e-07 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
104 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
104 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 
103 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 
103 aa  123  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
104 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
104 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 
104 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  56.31 
 
 
103 aa  121  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1119  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 
105 aa  120  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  57.28 
 
 
103 aa  119  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  57.84 
 
 
115 aa  119  1e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  56.86 
 
 
115 aa  118  2e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  1.96723e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  117  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  2.70537e-12  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  6.20592e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
103 aa  117  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  6.50093e-10  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  55.88 
 
 
103 aa  117  8e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  53.4 
 
 
103 aa  116  1e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  2.30006e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  116  1e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 
102 aa  115  2e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  2.82146e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  114  4e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  6.34591e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  114  4e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  114  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  2.36829e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  54.81 
 
 
104 aa  114  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.33447e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  51.46 
 
 
103 aa  114  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.80256e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  113  8e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  2.80512e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  113  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  113  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  2.43272e-05  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  112  1e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 
102 aa  113  1e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  54.9 
 
 
103 aa  113  1e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.2148e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  113  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.60043e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  49.02 
 
 
103 aa  112  1e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.21247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  113  1e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  6.47108e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  112  2e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  9.28168e-06  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  112  2e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  2.16305e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  112  2e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  48.54 
 
 
103 aa  112  2e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  112  2e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  112  2e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.25607e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  112  2e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  6.37379e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  112  2e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  7.66256e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  112  2e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  4.42245e-09  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  112  2e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  3.3092e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  112  2e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  1.90707e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  112  2e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.86548e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  112  2e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.68941e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  112  2e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.11872e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  112  2e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>