More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3657 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  649    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  84.85 
 
 
330 aa  525  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  77.56 
 
 
326 aa  497  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  63.42 
 
 
353 aa  391  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  61.54 
 
 
355 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0594  hypothetical protein  66.09 
 
 
233 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  48.32 
 
 
327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  44.48 
 
 
326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  44.97 
 
 
328 aa  279  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  44.97 
 
 
328 aa  278  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  45.9 
 
 
324 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45 
 
 
358 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  43.48 
 
 
328 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  46.86 
 
 
333 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  48.66 
 
 
335 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  45.94 
 
 
331 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.41 
 
 
339 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.62 
 
 
327 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  42.27 
 
 
325 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  46.15 
 
 
326 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  47.56 
 
 
330 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  43.85 
 
 
332 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  44.15 
 
 
325 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  46.56 
 
 
314 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.61 
 
 
328 aa  268  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  46.89 
 
 
360 aa  267  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  46.31 
 
 
339 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.2 
 
 
333 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.63 
 
 
339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.35 
 
 
328 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  44.98 
 
 
339 aa  265  8e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  42.81 
 
 
336 aa  264  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  44.63 
 
 
330 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  44.63 
 
 
330 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  43.71 
 
 
337 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  41.88 
 
 
322 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  43.93 
 
 
345 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  43.93 
 
 
345 aa  262  6e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  43.48 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  44.15 
 
 
324 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  45.15 
 
 
328 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.33 
 
 
327 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.38 
 
 
335 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.95 
 
 
344 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  43.48 
 
 
328 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  42.05 
 
 
337 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  43.03 
 
 
344 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44.3 
 
 
331 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  45.48 
 
 
323 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.81 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  44.48 
 
 
324 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  40.99 
 
 
330 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.62 
 
 
325 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  43.14 
 
 
324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  40.26 
 
 
318 aa  252  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  42.14 
 
 
321 aa  252  7e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  44.26 
 
 
325 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  42.28 
 
 
322 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  48.04 
 
 
334 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  45.64 
 
 
325 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  41.77 
 
 
331 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  42.77 
 
 
343 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  43.27 
 
 
336 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.95 
 
 
328 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.81 
 
 
325 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  41.18 
 
 
323 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  43.81 
 
 
322 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  41.93 
 
 
328 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 
335 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  44.37 
 
 
322 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  40.56 
 
 
332 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.15 
 
 
327 aa  249  6e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  40.81 
 
 
332 aa  248  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  40.81 
 
 
333 aa  247  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.08 
 
 
333 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.98 
 
 
333 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0909  hypothetical protein  44.71 
 
 
329 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  42.63 
 
 
343 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 
330 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  42.81 
 
 
326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40.44 
 
 
322 aa  245  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2416  hypothetical protein  44.63 
 
 
323 aa  245  8e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  40.8 
 
 
329 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  43.05 
 
 
325 aa  245  8e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  40.98 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  41.56 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2989  hypothetical protein  44.63 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593529  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  44.82 
 
 
324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  42.76 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  43.39 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  43.09 
 
 
320 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  43.27 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  41.72 
 
 
331 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  39.13 
 
 
331 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  41.93 
 
 
326 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  38.92 
 
 
334 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  39.13 
 
 
331 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  42.81 
 
 
334 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  39.75 
 
 
346 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  43.38 
 
 
324 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>