More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3624 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  674    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  76.51 
 
 
317 aa  484  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  76.17 
 
 
317 aa  482  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0250  hypothetical protein  78.26 
 
 
319 aa  464  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  64.11 
 
 
322 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  57.4 
 
 
351 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  63.88 
 
 
322 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  57.41 
 
 
321 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  60.56 
 
 
320 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2485  hypothetical protein  60.44 
 
 
320 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000714276 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  56.4 
 
 
334 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  48.36 
 
 
330 aa  289  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  47.99 
 
 
330 aa  286  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  43.93 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.35 
 
 
339 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  46.5 
 
 
318 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  45.48 
 
 
336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  46.69 
 
 
335 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  48.16 
 
 
328 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  44.65 
 
 
333 aa  269  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  47.16 
 
 
327 aa  268  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.05 
 
 
331 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  45.48 
 
 
330 aa  266  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  45.48 
 
 
330 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  47.6 
 
 
338 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  43.9 
 
 
335 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  45.09 
 
 
330 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  44.97 
 
 
338 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43.56 
 
 
334 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  46.82 
 
 
328 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  46.15 
 
 
345 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  46.15 
 
 
345 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.98 
 
 
332 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  47.47 
 
 
335 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.76 
 
 
349 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  45.2 
 
 
334 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  42.24 
 
 
336 aa  260  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  41.36 
 
 
329 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  42.33 
 
 
328 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  42.77 
 
 
328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  42.62 
 
 
322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  42.15 
 
 
356 aa  258  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  45.82 
 
 
331 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.48 
 
 
327 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  42.59 
 
 
324 aa  257  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  44.16 
 
 
331 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  41.64 
 
 
698 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  42.86 
 
 
325 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  41.78 
 
 
332 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  44.37 
 
 
325 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  41.3 
 
 
325 aa  256  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  43.96 
 
 
327 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.68 
 
 
325 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  43.96 
 
 
325 aa  256  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.17 
 
 
328 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.34 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.61 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  44.29 
 
 
361 aa  253  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  43.96 
 
 
341 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.3 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  43.49 
 
 
334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  43.22 
 
 
322 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3371  twin-arginine translocation pathway signal  45.92 
 
 
341 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5699  hypothetical protein  42.14 
 
 
327 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5302  hypothetical protein  42.77 
 
 
326 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  41.74 
 
 
333 aa  252  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  40.43 
 
 
325 aa  252  8.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  42.9 
 
 
332 aa  251  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.12 
 
 
331 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  40.92 
 
 
329 aa  251  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  40.56 
 
 
325 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.62 
 
 
330 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  38.65 
 
 
337 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  43.81 
 
 
324 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  40.25 
 
 
325 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.12 
 
 
331 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  41.12 
 
 
343 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  41.95 
 
 
334 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.89 
 
 
335 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.43 
 
 
333 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  46.44 
 
 
330 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.59 
 
 
326 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.14 
 
 
314 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  42.28 
 
 
339 aa  248  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  42.86 
 
 
328 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  43.1 
 
 
327 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  40.74 
 
 
335 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  39.69 
 
 
326 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  44.29 
 
 
326 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.08 
 
 
358 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.62 
 
 
339 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  44.63 
 
 
360 aa  248  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2876  hypothetical protein  40.12 
 
 
328 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.364701  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  40.8 
 
 
321 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  43.85 
 
 
325 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4278  hypothetical protein  41.61 
 
 
332 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239022  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  44.52 
 
 
334 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  43.73 
 
 
335 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.24 
 
 
323 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  41.49 
 
 
324 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>