93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3589 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  100 
 
 		 225 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  40.24 
 
 		 264 aa  89  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  33.04 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  29.13 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  30.9 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  33.62 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  30.34 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  38.93 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  29.02 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  27.8 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  31.65 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  35.42 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  24.34 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  29.77 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  30.26 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  25.94 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1549  Cro/CI family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  30.99 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  30.3 
 
 		 239 aa  68.2  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  35.61 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  29.86 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  29.85 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  28.51 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  30.94 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  28.51 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  27.27 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2131  putative phage repressor  29.32 
 
 		 289 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131906  hitchhiker  0.000000754842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3398  putative phage repressor  29.33 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0077186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  31.48 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1991  putative phage repressor  29.32 
 
 		 289 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000855833  hitchhiker  0.0000527672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  30.26 
 
 		 273 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3772  putative phage repressor  29.32 
 
 		 289 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0262025  unclonable  0.000000544418 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  30.92 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  27.41 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  28.21 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  25.97 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  27.62 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  29.52 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 248 aa  58.2  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  32.26 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1395  putative phage repressor  30.58 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  30.61 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  36.67 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  30.53 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4976  putative phage repressor  29.27 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  30 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2394  Cro/CI family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 283 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  32.52 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  26 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1911  putative phage repressor  52 
 
 		 331 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0192387  normal  0.0833716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  27.04 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3237  putative repressor protein  28.65 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150382  hitchhiker  0.000476613 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  38.2 
 
 		 251 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  25.71 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  31.31 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1166  phage-related repressor protein  28.57 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000408495  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1553  putative phage repressor  32.1 
 
 		 240 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.559929  normal  0.0333856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  25.53 
 
 		 243 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1066  putative phage repressor  31.53 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000341462  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  34.07 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  30.5 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  30.56 
 
 		 269 aa  49.3  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  27.45 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  31.3 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1013  DNA-binding protein  30.28 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.149474  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0818  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.051861  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  31.3 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  32.99 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1150  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 229 aa  46.2  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0272  transcriptional regulator, putative  30.15 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2543  putative phage repressor  31.13 
 
 		 289 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  30.93 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  27.01 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0976  putative phage repressor  30.77 
 
 		 284 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.786838  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  28.74 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  23.96 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  23.32 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  27.18 
 
 		 289 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  32.18 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  29.89 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  25.33 
 
 		 243 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  30.1 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  27.59 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  30.23 
 
 		 205 aa  42  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4635  putative phage repressor  24.39 
 
 		 214 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.671239 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  28.74 
 
 		 210 aa  42.4  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 209 aa  42  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  26.44 
 
 		 210 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  32.14 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>