More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3564 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  100 
 
 		 544 aa  1114    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  56.85 
 
 		 539 aa  625  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1931  histidine kinase  55.74 
 
 		 541 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1649  histidine kinase  55.74 
 
 		 541 aa  597  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2357  histidine kinase  57.58 
 
 		 533 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0826278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  55.74 
 
 		 541 aa  594  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2700  histidine kinase  54.95 
 
 		 534 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0483155  normal  0.0451896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  56.71 
 
 		 544 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  53.57 
 
 		 534 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0880  histidine kinase  53.01 
 
 		 534 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  55.4 
 
 		 507 aa  554  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  54.72 
 
 		 531 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  53.96 
 
 		 533 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  54.1 
 
 		 533 aa  547  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6213  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.02 
 
 		 559 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.1 
 
 		 789 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4534  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.1 
 
 		 789 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 807 aa  333  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0044  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.03 
 
 		 810 aa  326  7e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.4 
 
 		 957 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4749  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 		 781 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.872225  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 		 1089 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.36 
 
 		 743 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.56 
 
 		 1076 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.62 
 
 		 1105 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3491  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 		 966 aa  309  9e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691252 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6946  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 		 789 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3596  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 		 926 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.94 
 
 		 1260 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 		 1260 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.45 
 
 		 655 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.04 
 
 		 1050 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.42 
 
 		 1053 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4711  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.99 
 
 		 683 aa  302  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0542  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.75 
 
 		 1050 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.757487  normal  0.763027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.73 
 
 		 1651 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  41.59 
 
 		 936 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  39.76 
 
 		 692 aa  300  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  40.71 
 
 		 529 aa  300  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2024  fused PAS sensor histidine kinase protein and response regulator  33.4 
 
 		 1005 aa  299  7e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00627468  normal  0.216163 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2780  histidine kinase  45.01 
 
 		 558 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1835  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.54 
 
 		 782 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.448152 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.36 
 
 		 1022 aa  298  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.12 
 
 		 1095 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  40.61 
 
 		 812 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 		 1036 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.705021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 		 936 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.33 
 
 		 926 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.44 
 
 		 1381 aa  296  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.56 
 
 		 573 aa  296  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.87 
 
 		 999 aa  296  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3791  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.88 
 
 		 492 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.107728 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0134  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.05 
 
 		 682 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.574481  normal  0.0374693 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.22 
 
 		 1646 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5545  two component sensor kinase/response regulator hybrid  42.42 
 
 		 1036 aa  295  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.47 
 
 		 1631 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6778  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.4 
 
 		 905 aa  293  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.433337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0038  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.39 
 
 		 681 aa  293  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0323591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 		 673 aa  293  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  37.6 
 
 		 695 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.65 
 
 		 1165 aa  292  9e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.88 
 
 		 977 aa  292  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0119  sensor histidine kinase with PAS/PAC  43.13 
 
 		 909 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0024  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.72 
 
 		 734 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.78 
 
 		 890 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  42.56 
 
 		 490 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.62 
 
 		 686 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5407  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 815 aa  290  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0018  ATPase domain-containing protein  41.42 
 
 		 681 aa  289  7e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.24 
 
 		 1065 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.8 
 
 		 732 aa  289  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.598305 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 		 916 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 		 1132 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.42 
 
 		 681 aa  289  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.746553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5841  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.4 
 
 		 887 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.111175 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5205  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.33 
 
 		 727 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5728  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.36 
 
 		 727 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.82 
 
 		 1103 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  42.89 
 
 		 847 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  44.82 
 
 		 1092 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4234  sensor histidine kinase  36.35 
 
 		 761 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  40 
 
 		 537 aa  286  8e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3112  putative PAS/PAC sensor protein  37.45 
 
 		 733 aa  286  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 		 943 aa  286  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0366  GAF sensor hybrid histidine kinase  44.19 
 
 		 618 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  38.63 
 
 		 1065 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2967  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 		 949 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.291071  normal  0.350737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2976  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.54 
 
 		 889 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.29382  normal  0.115477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.15 
 
 		 830 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 769 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 		 650 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2045  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 		 812 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000148537 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 		 508 aa  283  6.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3535  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 		 695 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.63 
 
 		 807 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  35.12 
 
 		 949 aa  282  9e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  37.3 
 
 		 695 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0163  sensory box histidine kinase/response regulator  43.8 
 
 		 611 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2717  sensory box histidine kinase/response regulator  37.47 
 
 		 676 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.230475  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0531  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.61 
 
 		 1193 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>