More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3515 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
226 aa  455  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  83.1 
 
 
226 aa  374  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  74.65 
 
 
222 aa  343  9e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  76.28 
 
 
222 aa  340  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  69.41 
 
 
224 aa  322  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  62.62 
 
 
232 aa  276  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  60.1 
 
 
224 aa  269  3e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  59.13 
 
 
249 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  60 
 
 
221 aa  261  7e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  61.39 
 
 
221 aa  241  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  57.62 
 
 
218 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  49.5 
 
 
219 aa  184  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  53.85 
 
 
245 aa  177  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  47.78 
 
 
231 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  45.27 
 
 
232 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  44.83 
 
 
233 aa  148  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  40.48 
 
 
236 aa  145  7e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  45.03 
 
 
194 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  37.91 
 
 
232 aa  130  1e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
236 aa  128  8e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  37.32 
 
 
215 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  37.14 
 
 
227 aa  122  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  40.38 
 
 
225 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  38.46 
 
 
235 aa  117  2e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
224 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 
236 aa  111  7e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
224 aa  110  1e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
216 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
224 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 
247 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 
245 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  29.9 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 
223 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
265 aa  88.6  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  37.82 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  9.51338e-07 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
267 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
242 aa  84.7  1e-15  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
229 aa  82.4  5e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
242 aa  82.4  5e-15  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 
233 aa  82.4  6e-15  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
217 aa  82  7e-15  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  38.69 
 
 
223 aa  82  8e-15  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
223 aa  82  8e-15  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 
240 aa  81.6  9e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
227 aa  81.6  9e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1979  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 
220 aa  81.6  9e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
222 aa  80.9  1e-14  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 
232 aa  79.7  3e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 
222 aa  79.7  3e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  31.96 
 
 
227 aa  79.3  4e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 
241 aa  79  6e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
242 aa  79  6e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 
232 aa  79  6e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 
238 aa  79  6e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
242 aa  79  6e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
241 aa  79  6e-14  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17475e-07 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 
242 aa  78.6  8e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
228 aa  77.8  1e-13  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
222 aa  77.4  2e-13  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  34.15 
 
 
239 aa  77  2e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 
222 aa  77.4  2e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
228 aa  77.4  2e-13  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 
233 aa  77.4  2e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
231 aa  76.3  4e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  31.29 
 
 
249 aa  76.3  4e-13  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  35.1 
 
 
222 aa  75.9  5e-13  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
223 aa  75.5  6e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
226 aa  75.5  6e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
230 aa  75.1  8e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  36.97 
 
 
243 aa  75.1  8e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
227 aa  74.3  1e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  37.09 
 
 
229 aa  74.3  1e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 
231 aa  73.9  2e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
229 aa  74.3  2e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  28.16 
 
 
226 aa  73.6  2e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
235 aa  73.9  2e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3141  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
229 aa  73.6  2e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167888  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4143  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
230 aa  73.9  2e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0628  transcriptional regulator protein  34.66 
 
 
207 aa  73.9  2e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
233 aa  73.6  2e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 
254 aa  73.2  3e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0394  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 
250 aa  73.2  3e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.143272  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
258 aa  73.2  3e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2458  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
235 aa  72.8  4e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
245 aa  72.4  5e-12  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  27.86 
 
 
209 aa  72.8  5e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.46 
 
 
233 aa  72.4  6e-12  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
234 aa  72.4  6e-12  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
223 aa  72  7e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
223 aa  71.6  8e-12  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  8.31441e-07  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
223 aa  71.6  8e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
223 aa  71.6  8e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
254 aa  72  8e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
223 aa  71.6  8e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 
223 aa  71.6  8e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  1.08879e-05 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
226 aa  71.2  1e-11  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
241 aa  70.9  1e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5872  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
255 aa  71.6  1e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
234 aa  71.2  1e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  37.5 
 
 
242 aa  71.2  1e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>