More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3514 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
429 aa  856    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  88.16 
 
 
429 aa  748    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  80.24 
 
 
411 aa  678    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  69.64 
 
 
423 aa  593  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  60.96 
 
 
420 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  60.24 
 
 
420 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  59.61 
 
 
430 aa  497  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  60.72 
 
 
420 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  61.67 
 
 
420 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  61.67 
 
 
420 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  56.43 
 
 
428 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  55.95 
 
 
428 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  56.62 
 
 
428 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  57.07 
 
 
428 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  56.13 
 
 
409 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  55.88 
 
 
409 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0370  major facilitator transporter  58.21 
 
 
419 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  54.79 
 
 
409 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  55.88 
 
 
428 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3588  major facilitator superfamily MFS_1  57.97 
 
 
419 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  hitchhiker  0.00000294686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  55.72 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  55.28 
 
 
423 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  55.28 
 
 
423 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  54.77 
 
 
435 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  54.52 
 
 
432 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  54.76 
 
 
432 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  56.86 
 
 
433 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  55.01 
 
 
432 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  54.52 
 
 
432 aa  456  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4975  major facilitator transporter  57.18 
 
 
429 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  55.02 
 
 
434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  55.23 
 
 
434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1281  major facilitator superfamily MFS_1  52.16 
 
 
436 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.901209  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4045  major facilitator superfamily MFS_1  54.13 
 
 
415 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3932  major facilitator superfamily MFS_1  54.13 
 
 
415 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.643989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  51.08 
 
 
428 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  51.08 
 
 
423 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  49.88 
 
 
434 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  49.64 
 
 
425 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  49.64 
 
 
425 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_003296  RS05189  metabolite transporter  53.51 
 
 
416 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.448327  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  49.29 
 
 
445 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1030  major facilitator transporter  52.58 
 
 
437 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  49.29 
 
 
445 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  49.4 
 
 
428 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  49.28 
 
 
429 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2798  general substrate transporter  49.76 
 
 
429 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.564516  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  48.55 
 
 
428 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0670  major facilitator family transporter  50.13 
 
 
398 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  50.36 
 
 
432 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0487  major facilitator family transporter  50.13 
 
 
398 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  50.13 
 
 
398 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  49.03 
 
 
424 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1095  major facilitator family transporter  48.53 
 
 
435 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1295  major facilitator transporter  48.79 
 
 
424 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0174718  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4022  major facilitator transporter  49.03 
 
 
424 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  48.9 
 
 
434 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  46.56 
 
 
474 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  46.1 
 
 
474 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  48.56 
 
 
423 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  46.1 
 
 
474 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5191  major facilitator transporter  49.28 
 
 
430 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  45.87 
 
 
474 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  46.1 
 
 
474 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  46.35 
 
 
457 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  46.35 
 
 
457 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  47.55 
 
 
441 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  49.52 
 
 
421 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  47.8 
 
 
433 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  49.3 
 
 
436 aa  358  9e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  41.69 
 
 
428 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  44.1 
 
 
436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  39.66 
 
 
428 aa  323  4e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4834  major facilitator transporter  44.28 
 
 
411 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  31.75 
 
 
418 aa  215  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  32.42 
 
 
491 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  31.97 
 
 
412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  33.08 
 
 
415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  32.68 
 
 
415 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  32.68 
 
 
415 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  35.7 
 
 
402 aa  196  9e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_003296  RS01910  transport transmembrane protein  33.25 
 
 
418 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  32.58 
 
 
410 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  32.59 
 
 
412 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  32.83 
 
 
410 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  31.41 
 
 
415 aa  189  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  32.33 
 
 
415 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  32.58 
 
 
415 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  32.33 
 
 
415 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  33.42 
 
 
408 aa  186  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
410 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  28.74 
 
 
433 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 
451 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  28.74 
 
 
432 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  28.74 
 
 
433 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  28.74 
 
 
425 aa  180  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  28.5 
 
 
432 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  29.21 
 
 
433 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  32.11 
 
 
399 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  28.57 
 
 
432 aa  179  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>