225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3513 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 251 aa  488  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  75.6 
 
 		 252 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  72.29 
 
 		 256 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  74.4 
 
 		 255 aa  345  3e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  67.74 
 
 		 254 aa  343  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  69.35 
 
 		 254 aa  334  7e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  69.35 
 
 		 255 aa  330  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  61.04 
 
 		 252 aa  305  6e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  66.4 
 
 		 257 aa  303  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  67.07 
 
 		 304 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  58.57 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  59.44 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  57.37 
 
 		 254 aa  280  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  62 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  58.96 
 
 		 252 aa  276  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  60.64 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  60.64 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  60.64 
 
 		 254 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  57.26 
 
 		 253 aa  275  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  59.44 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  54.58 
 
 		 255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  59.6 
 
 		 255 aa  265  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  57.6 
 
 		 251 aa  264  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  53.17 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  56.63 
 
 		 249 aa  262  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  52.82 
 
 		 258 aa  261  6e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  54.22 
 
 		 249 aa  260  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  56.52 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  59.44 
 
 		 253 aa  259  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  57.43 
 
 		 254 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  57.14 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0535  LamB/YcsF family protein  59.27 
 
 		 256 aa  254  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.884685  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1451  LamB/YcsF family protein  58.23 
 
 		 252 aa  254  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  55.02 
 
 		 260 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  52.21 
 
 		 257 aa  252  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  55.42 
 
 		 260 aa  251  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  55.92 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  52.59 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  54.37 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  53.97 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  0.0000404715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  52.33 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  52.42 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  53.23 
 
 		 255 aa  244  8e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  47.35 
 
 		 255 aa  242  3e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  54.22 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  52 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  51.84 
 
 		 253 aa  240  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  53.41 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  52.02 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  54.07 
 
 		 255 aa  238  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  44.94 
 
 		 256 aa  237  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  52.02 
 
 		 273 aa  234  9e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  51.79 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  46 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  52.02 
 
 		 256 aa  231  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  43.87 
 
 		 255 aa  231  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 		 255 aa  231  7.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  43.48 
 
 		 255 aa  229  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  46.15 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 		 264 aa  228  7e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  49.2 
 
 		 256 aa  228  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  48.8 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  47.18 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  46.34 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  52.42 
 
 		 255 aa  224  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  47.18 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 		 253 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  45.53 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 258 aa  220  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  44.72 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  46.37 
 
 		 250 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  44.72 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0361  LamB/YcsF family protein  44 
 
 		 256 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.135278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  48.41 
 
 		 257 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  45.12 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  44.72 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  51.23 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  44.72 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  44.9 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  45.82 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  44.72 
 
 		 253 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2936  LamB/YcsF family protein  44 
 
 		 251 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  46.53 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  47.35 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  46.53 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  46.53 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  46.53 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  43.2 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  43.2 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2920  hypothetical protein  43.87 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  46.53 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  47.08 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  46.53 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  46.53 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>