58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3512 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3512  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  542  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.635527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5379  hypothetical protein  77.32 
 
 
268 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.477329  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2449  hypothetical protein  83 
 
 
270 aa  424  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0498  hypothetical protein  72.49 
 
 
264 aa  404  1e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0321  hypothetical protein  76.77 
 
 
263 aa  399  1e-110  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5849  hypothetical protein  75.82 
 
 
268 aa  388  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00315108  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0534  hypothetical protein  72.08 
 
 
267 aa  339  3e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.645229  normal  0.0111523 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2200  protein of unknown function DUF1445  66 
 
 
262 aa  334  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3555  protein of unknown function DUF1445  67.33 
 
 
260 aa  332  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14927  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5194  hypothetical protein  63.97 
 
 
262 aa  320  1e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.633751  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0093  hypothetical protein  62.26 
 
 
270 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5735  hypothetical protein  64.37 
 
 
251 aa  312  4e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3576  hypothetical protein  57.53 
 
 
267 aa  305  6e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1597  hypothetical protein  60.24 
 
 
265 aa  301  6e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2483  hypothetical protein  60.96 
 
 
259 aa  299  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0307873 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01960  hypothetical protein  58 
 
 
256 aa  298  8e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19220  hypothetical protein  59.76 
 
 
270 aa  294  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0174  hypothetical protein  56.85 
 
 
279 aa  293  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4424  hypothetical protein  59.04 
 
 
254 aa  292  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369265  normal  0.270561 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1142  hypothetical protein  52.8 
 
 
261 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.585996  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22470  hypothetical protein  61.09 
 
 
261 aa  285  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0707  protein of unknown function DUF1445  58.51 
 
 
267 aa  280  1e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00164756  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3292  hypothetical protein  55.13 
 
 
271 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1103  hypothetical protein  51.44 
 
 
263 aa  271  6e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00199325  normal  0.0783421 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3152  hypothetical protein  55.65 
 
 
300 aa  270  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.808227  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2409  hypothetical protein  56.42 
 
 
259 aa  269  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.558045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3393  hypothetical protein  53.88 
 
 
261 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0256921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1776  hypothetical protein  53.79 
 
 
274 aa  262  5e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0657384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3350  hypothetical protein  53.73 
 
 
271 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.834671  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13975  predicted protein  51.59 
 
 
290 aa  260  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.722114  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2570  hypothetical protein  54.62 
 
 
266 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4977  hypothetical protein  51.82 
 
 
260 aa  259  5e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1666  hypothetical protein  51.78 
 
 
271 aa  259  5e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1097  hypothetical protein  53.67 
 
 
271 aa  258  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00235966  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0337  protein of unknown function DUF1445  48.22 
 
 
255 aa  258  7e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.915447  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2364  hypothetical protein  55.04 
 
 
257 aa  258  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4744  hypothetical protein  54.44 
 
 
294 aa  258  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1947  hypothetical protein  50.96 
 
 
272 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2125  hypothetical protein  50.37 
 
 
269 aa  254  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.04664  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3550  hypothetical protein  51.82 
 
 
257 aa  253  2e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.354619  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5282  hypothetical protein  51.98 
 
 
257 aa  253  2e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393918  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3459  hypothetical protein  51.98 
 
 
257 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2883  hypothetical protein  47.92 
 
 
272 aa  252  5e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1846  hypothetical protein  52.82 
 
 
272 aa  252  5e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.140697  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5125  hypothetical protein  52.23 
 
 
260 aa  251  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.039985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3621  hypothetical protein  51 
 
 
272 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.574773 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2576  hypothetical protein  52.7 
 
 
257 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3969  hypothetical protein  51.45 
 
 
257 aa  245  5e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0539312 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4813  hypothetical protein  50.2 
 
 
259 aa  244  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575572 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1435  hypothetical protein  46.83 
 
 
261 aa  244  1e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1503  hypothetical protein  45.86 
 
 
276 aa  243  2e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979061  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1731  hypothetical protein  42.35 
 
 
269 aa  232  4e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.22733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37210  hypothetical protein  50.43 
 
 
265 aa  231  7e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00953297  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3193  hypothetical protein  49.14 
 
 
265 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2258  hypothetical protein  46.62 
 
 
279 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.761835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0610  hypothetical protein  50.21 
 
 
260 aa  222  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05290  conserved hypothetical protein  41.41 
 
 
276 aa  178  1e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2940  protein of unknown function DUF1445  60.61 
 
 
137 aa  132  8e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>