More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3511 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  68.9 
 
 		 531 aa  696    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  69.89 
 
 		 553 aa  709    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  69.05 
 
 		 549 aa  717    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  100 
 
 		 539 aa  1048    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  60.82 
 
 		 534 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  58.93 
 
 		 541 aa  591  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  57.28 
 
 		 539 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  58.3 
 
 		 536 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  51.3 
 
 		 522 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  49.54 
 
 		 562 aa  450  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  54.66 
 
 		 518 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0095  urea amidolyase related protein  49.36 
 
 		 555 aa  441  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  49.91 
 
 		 539 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19250  biotin-dependent carboxylase-like protein  45.45 
 
 		 585 aa  358  9.999999999999999e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3520  Allophanate hydrolase subunit 2  48.68 
 
 		 510 aa  349  9e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0100  Allophanate hydrolase subunit 2  42.71 
 
 		 564 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368046  normal  0.0250714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2769  urea amidolyase related protein  41.32 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0149332  hitchhiker  0.000017266 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29770  allophanate hydrolase subunit 2  41.55 
 
 		 592 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  59.9 
 
 		 203 aa  230  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06210  biotin-dependent carboxylase-like protein  49.48 
 
 		 290 aa  229  7e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.447378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  34.45 
 
 		 506 aa  229  8e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2601  urea amidolyase-like protein  48.05 
 
 		 312 aa  229  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.983467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2196  urea amidolyase related protein  51.38 
 
 		 293 aa  225  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  36.09 
 
 		 499 aa  221  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3556  urea amidolyase related protein  49.31 
 
 		 308 aa  217  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  32.06 
 
 		 549 aa  216  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  57.21 
 
 		 203 aa  215  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1968  allophanate hydrolase subunit 2  49.66 
 
 		 286 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  53.47 
 
 		 204 aa  207  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00380  biotin-dependent carboxylase-like protein  45.12 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.301441 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0095  urea amidolyase related protein  49.82 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00390  allophanate hydrolase subunit 1  54.77 
 
 		 203 aa  201  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  51.49 
 
 		 201 aa  200  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6834  urea amidolyase related protein  50 
 
 		 285 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2600  allophanate hydrolase subunit 1  56.12 
 
 		 204 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3557  Allophanate hydrolase subunit 1  52.71 
 
 		 205 aa  197  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0098  urea amidolyase related protein  51.52 
 
 		 312 aa  196  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2975  allophanate hydrolase  42.86 
 
 		 288 aa  194  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2976  urea amidolyase related protein  49.15 
 
 		 298 aa  193  6e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1267  urea amidolyase related protein  47.72 
 
 		 288 aa  189  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0092  urea amidolyase related protein  50.55 
 
 		 282 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2974  allophanate hydrolase subunit 1  48.5 
 
 		 248 aa  184  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0811525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0257  urea amidolyase related protein  43.38 
 
 		 292 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.170917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0267  allophanate hydrolase subunit 2  43.38 
 
 		 292 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0277  urea amidolyase related protein  43.38 
 
 		 292 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.957119  normal  0.165219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7094  allophanate hydrolase subunit 2  42.81 
 
 		 325 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1379  urea amidolyase related protein  46.92 
 
 		 282 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0813478  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0378  urea amidolyase related protein  41.83 
 
 		 298 aa  177  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00676966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0258  allophanate hydrolase subunit 1  51.27 
 
 		 221 aa  177  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.161763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0268  allophanate hydrolase subunit 1  51.27 
 
 		 221 aa  177  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0278  allophanate hydrolase subunit 1  51.27 
 
 		 221 aa  177  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2337  urea amidolyase related protein  41.69 
 
 		 323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0304  allophanate hydrolase subunit 1  50.48 
 
 		 235 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4801  Allophanate hydrolase subunit 1  50.5 
 
 		 212 aa  174  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.440705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0377  allophanate hydrolase subunit 1  51.53 
 
 		 233 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0129741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4802  urea amidolyase related protein  46.42 
 
 		 288 aa  172  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.467113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10267  hypothetical protein  41.02 
 
 		 300 aa  169  9e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.368185  normal  0.239017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7093  allophanate hydrolase subunit 2  49.23 
 
 		 209 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0303  urea amidolyase related protein  42.12 
 
 		 314 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2977  allophanate hydrolase subunit 1  48.29 
 
 		 203 aa  161  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358004  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2904  urea amidolyase related protein  36.73 
 
 		 350 aa  160  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.293477 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3742  urea amidolyase related protein  37.69 
 
 		 350 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6832  Allophanate hydrolase subunit 1  48.74 
 
 		 200 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0194  Urea amidolyase-related protein  37.69 
 
 		 350 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1596  urea amidolyase related protein  33.67 
 
 		 334 aa  158  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  42.67 
 
 		 229 aa  156  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1256  urea amidolyase related protein  37.5 
 
 		 310 aa  154  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0977176  normal  0.848518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12470  allophanate hydrolase/urea amidolyase-related protein  38.89 
 
 		 301 aa  151  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0799674  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2921  urea amidolyase related protein  39.46 
 
 		 309 aa  150  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0593  allophanate hydrolase subunit 1  47.17 
 
 		 234 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0362915  normal  0.623241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4366  urea amidolyase related protein  39.07 
 
 		 332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  47.92 
 
 		 242 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  42.4 
 
 		 246 aa  148  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1268  Allophanate hydrolase subunit 1  42.01 
 
 		 219 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  40.28 
 
 		 218 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  40.65 
 
 		 242 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1973  urea amidolyase related protein  36.36 
 
 		 348 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2373  urea amidolyase related protein  36.36 
 
 		 349 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  normal  0.68742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0063  allophanate hydrolase subunit 2  38.74 
 
 		 339 aa  146  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  48.54 
 
 		 256 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2922  urea amidolyase related protein  39.47 
 
 		 323 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2809  urea amidolyase-like protein  31.7 
 
 		 329 aa  145  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2225  urea amidolyase related protein  31.37 
 
 		 319 aa  144  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  43.68 
 
 		 242 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2873  urea amidolyase related protein  32.9 
 
 		 329 aa  143  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  46.02 
 
 		 216 aa  143  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1949  urea amidolyase related protein  33.33 
 
 		 328 aa  143  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276448  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2770  urea amidolyase related protein  39.47 
 
 		 323 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2120  urea amidolyase related protein  39.34 
 
 		 323 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00861242  normal  0.545781 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  47.95 
 
 		 218 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  47.95 
 
 		 218 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  47.95 
 
 		 256 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  47.95 
 
 		 256 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  47.95 
 
 		 218 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  47.95 
 
 		 259 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  47.95 
 
 		 218 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  44.74 
 
 		 230 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2170  hypothetical protein  37.34 
 
 		 353 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.723282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2860  urea amidolyase related protein  39.53 
 
 		 323 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0238503  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2636  hypothetical protein  42.86 
 
 		 242 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.24477  decreased coverage  0.0000373796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>