More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3486 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  72.29 
 
 
841 aa  810    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  70.28 
 
 
730 aa  1123    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  84.7 
 
 
788 aa  1370    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  65.13 
 
 
792 aa  1077    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  82.32 
 
 
756 aa  1298    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  72.48 
 
 
841 aa  815    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  74.56 
 
 
778 aa  1113    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  89.51 
 
 
748 aa  1436    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  71.71 
 
 
838 aa  809    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  83.25 
 
 
755 aa  1301    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  80.98 
 
 
907 aa  1323    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  72.48 
 
 
841 aa  815    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  74.27 
 
 
794 aa  1107    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  64.07 
 
 
785 aa  1023    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
774 aa  1610    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  95.28 
 
 
572 aa  1151    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  43.34 
 
 
734 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  43.34 
 
 
734 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  43.34 
 
 
734 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  43.34 
 
 
734 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  43.34 
 
 
734 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  43.34 
 
 
734 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  59.39 
 
 
886 aa  627  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  43.55 
 
 
741 aa  628  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  43.23 
 
 
731 aa  625  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  43.23 
 
 
731 aa  623  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  43.29 
 
 
741 aa  625  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  55.77 
 
 
901 aa  621  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  56.54 
 
 
975 aa  618  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  43.29 
 
 
741 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  41.13 
 
 
734 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  41.44 
 
 
734 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  41.16 
 
 
771 aa  588  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  40.03 
 
 
712 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  46.34 
 
 
757 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  41.74 
 
 
689 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  41.58 
 
 
689 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  45.63 
 
 
780 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  42.92 
 
 
724 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  38.89 
 
 
767 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  45.54 
 
 
777 aa  544  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  38.76 
 
 
767 aa  538  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  45.43 
 
 
796 aa  528  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  38.68 
 
 
794 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  49.26 
 
 
687 aa  521  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  37.34 
 
 
792 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  44.73 
 
 
645 aa  502  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  38.17 
 
 
783 aa  496  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  43.03 
 
 
743 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  40.95 
 
 
725 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  42.28 
 
 
729 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  42.28 
 
 
729 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  42.39 
 
 
646 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  41.81 
 
 
730 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  41.88 
 
 
643 aa  465  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  39.3 
 
 
714 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  40.13 
 
 
769 aa  462  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  36.9 
 
 
703 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  38.8 
 
 
683 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  40.78 
 
 
753 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  37.89 
 
 
683 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  39.72 
 
 
676 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  38.79 
 
 
735 aa  445  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  38.3 
 
 
1981 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  39.33 
 
 
775 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  39.33 
 
 
775 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  39.33 
 
 
775 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  39.33 
 
 
775 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  39.33 
 
 
775 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  39.33 
 
 
775 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  39.33 
 
 
775 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  40.83 
 
 
618 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  33.85 
 
 
872 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  34.73 
 
 
874 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  33.98 
 
 
930 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  33.98 
 
 
858 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  37.66 
 
 
661 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  34.73 
 
 
916 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  34.4 
 
 
709 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  33.98 
 
 
896 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  34.73 
 
 
922 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  34.56 
 
 
1048 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  37.18 
 
 
661 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  37.69 
 
 
614 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  37.18 
 
 
661 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  37.42 
 
 
661 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  37.34 
 
 
661 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  37.18 
 
 
661 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  37.18 
 
 
661 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  37.18 
 
 
661 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  33.71 
 
 
1057 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  37.7 
 
 
616 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  38.85 
 
 
618 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  34.38 
 
 
692 aa  379  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  39.73 
 
 
540 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  37.08 
 
 
613 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  36.8 
 
 
668 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  34.15 
 
 
692 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  32.13 
 
 
704 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  31.87 
 
 
754 aa  368  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>