More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3451 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
169 aa  340  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  85.03 
 
 
165 aa  291  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  88.82 
 
 
165 aa  285  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  73.01 
 
 
170 aa  254  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  76.97 
 
 
167 aa  248  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  68.45 
 
 
169 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  74.07 
 
 
164 aa  238  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  77.14 
 
 
179 aa  235  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  68.29 
 
 
171 aa  231  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  67.48 
 
 
164 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  61.18 
 
 
173 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  60.24 
 
 
178 aa  204  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  60.62 
 
 
174 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  60 
 
 
174 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  58.39 
 
 
176 aa  197  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  58.02 
 
 
172 aa  197  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  57.41 
 
 
172 aa  194  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  58.23 
 
 
166 aa  188  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  55.69 
 
 
170 aa  181  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  54.43 
 
 
166 aa  180  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  55.06 
 
 
166 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  53.8 
 
 
166 aa  177  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  53.16 
 
 
166 aa  177  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  53.8 
 
 
166 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  53.8 
 
 
166 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  53.8 
 
 
166 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  53.16 
 
 
166 aa  175  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  53.16 
 
 
166 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  53.16 
 
 
166 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  53.16 
 
 
166 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  53.16 
 
 
166 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  53.16 
 
 
166 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  53.16 
 
 
166 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  53.16 
 
 
166 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  54 
 
 
160 aa  154  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  50.67 
 
 
163 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  47.77 
 
 
170 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  46.36 
 
 
159 aa  147  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  53.24 
 
 
182 aa  147  9e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  49.01 
 
 
180 aa  144  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  52.08 
 
 
157 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  52.41 
 
 
162 aa  142  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  47.37 
 
 
178 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  50.34 
 
 
151 aa  140  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  51.02 
 
 
154 aa  138  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  45.22 
 
 
176 aa  138  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 
170 aa  137  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  48.05 
 
 
163 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  50.68 
 
 
167 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  48.92 
 
 
164 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  45.51 
 
 
168 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  48.73 
 
 
173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  48.99 
 
 
170 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  44.1 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  46.98 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  44.1 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  46.98 
 
 
166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 
170 aa  131  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  44.3 
 
 
168 aa  131  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  46.5 
 
 
359 aa  131  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  47.02 
 
 
168 aa  131  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  46.5 
 
 
359 aa  131  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 
176 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  44.1 
 
 
164 aa  130  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  44.1 
 
 
164 aa  130  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  43.48 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  48.32 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  43.23 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  43.23 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  43.48 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  45.81 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  43.48 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  45.28 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  43.48 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  43.48 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  45.81 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 
170 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  45.03 
 
 
171 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  45.81 
 
 
166 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  45.03 
 
 
171 aa  128  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  45.81 
 
 
166 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  45.81 
 
 
166 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  44.59 
 
 
169 aa  128  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  45.81 
 
 
166 aa  127  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
170 aa  127  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 
163 aa  127  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
170 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
170 aa  127  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1404  lipoprotein signal peptidase  50.35 
 
 
176 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  47.83 
 
 
169 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  46.9 
 
 
166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  47.73 
 
 
181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  45.22 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 
165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  47.97 
 
 
169 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  43.42 
 
 
154 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  45.22 
 
 
169 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>