299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3388 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3388  cytochrome c553-like protein  100 
 
 		 283 aa  557  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485669  normal  0.152505 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  67.32 
 
 		 240 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1242  putative cytochrome c  67.66 
 
 		 245 aa  279  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.291072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  66.17 
 
 		 228 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  53.36 
 
 		 281 aa  258  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3448  putative cytochrome c  61.08 
 
 		 257 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.582918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  61.14 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1283  putative cytochrome c  57.75 
 
 		 261 aa  249  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.558146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4653  putative cytochrome c  57.35 
 
 		 243 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0629  cytochrome c, class I  56.03 
 
 		 236 aa  241  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5996  cytochrome c, class I  56.7 
 
 		 236 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.203421 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0250  cytochrome c4, putative  53.85 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603849  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0916  cytochrome c  53.85 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422985  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0737  putative cytochrome  53.85 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0750  putative cytochrome  53.85 
 
 		 249 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2462  putative cytochrome c4  53.85 
 
 		 249 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2381  putative cytochrome c4  53.85 
 
 		 249 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336933  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  55.36 
 
 		 229 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  55.36 
 
 		 229 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2057  cytochrome c, class I  55.17 
 
 		 254 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2668  cytochrome c, class I  55.17 
 
 		 254 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2697  cytochrome c, class I  55.17 
 
 		 236 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2696  putative cytochrome c4  58.79 
 
 		 234 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  55.45 
 
 		 239 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0609  cytochrome c4, putative  53.42 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2878  cytochrome c4, putative  54.77 
 
 		 238 aa  215  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  51.4 
 
 		 243 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1488  cytochrome c  52.04 
 
 		 238 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.308857  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  50.93 
 
 		 243 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1355  putative cytochrome c  52.04 
 
 		 236 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1349  putative cytochrome c  52.04 
 
 		 236 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.708882  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  49.3 
 
 		 239 aa  208  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1399  cytochrome c553-like  54.23 
 
 		 203 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.994918 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  49.75 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8113  putative cytochrome c4  45.99 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1720  cytochrome c  48.53 
 
 		 217 aa  205  7e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0626  putative periplasmic cytochrome c protein  50.25 
 
 		 237 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0822145  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0351  putative periplasmic cytochrome c protein  47.37 
 
 		 240 aa  205  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4074  putative periplasmic cytochrome c protein  47.32 
 
 		 257 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2279  cytochrome c  48.98 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  37.17 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  38.15 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  36.84 
 
 		 213 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  35.96 
 
 		 216 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  35.39 
 
 		 217 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  36.17 
 
 		 217 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  35.39 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  31.84 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 220 aa  109  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  36.61 
 
 		 217 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  35.11 
 
 		 216 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  32.97 
 
 		 202 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  36.47 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  30.41 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  34.62 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  32.34 
 
 		 206 aa  98.6  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 207 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  32.85 
 
 		 207 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  31.28 
 
 		 203 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 207 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  32.09 
 
 		 208 aa  96.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  29.46 
 
 		 206 aa  96.3  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  35.06 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  32.68 
 
 		 207 aa  95.9  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  31.75 
 
 		 224 aa  95.5  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  30.04 
 
 		 206 aa  95.1  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  33.73 
 
 		 208 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  32 
 
 		 210 aa  93.6  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  34.12 
 
 		 208 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  31.88 
 
 		 207 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  31.88 
 
 		 207 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  31.88 
 
 		 207 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  29.53 
 
 		 205 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  31.88 
 
 		 207 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  33.73 
 
 		 208 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  34.12 
 
 		 208 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  33.73 
 
 		 208 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  33.73 
 
 		 208 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  29.89 
 
 		 256 aa  92.4  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  30.73 
 
 		 199 aa  92.4  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  33.18 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  32.39 
 
 		 219 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  29.86 
 
 		 205 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  30.33 
 
 		 205 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  32.39 
 
 		 219 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  32.94 
 
 		 221 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  32.35 
 
 		 204 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  33.99 
 
 		 196 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4759  cytochrome c class I protein  33.33 
 
 		 373 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.880991  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  29.05 
 
 		 227 aa  90.1  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  29.59 
 
 		 209 aa  89.7  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  31.18 
 
 		 201 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  30.33 
 
 		 205 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  30.77 
 
 		 205 aa  89.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  30.33 
 
 		 205 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  28.41 
 
 		 205 aa  89.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  33.15 
 
 		 219 aa  89.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  31.94 
 
 		 222 aa  89.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  30.59 
 
 		 196 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  31.36 
 
 		 208 aa  89  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>