98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3357 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  100 
 
 
437 aa  884    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  34.73 
 
 
430 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  30.54 
 
 
452 aa  195  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  30.82 
 
 
455 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  32.59 
 
 
422 aa  187  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  31.09 
 
 
449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  31.85 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  32.74 
 
 
410 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  43.13 
 
 
482 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  31.79 
 
 
478 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  26.56 
 
 
422 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  28.65 
 
 
403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  25.57 
 
 
421 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  24.73 
 
 
440 aa  123  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  28.92 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  28.99 
 
 
406 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  37.21 
 
 
408 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  27.49 
 
 
454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  27.25 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  26.48 
 
 
427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  32.06 
 
 
445 aa  110  6e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  36.89 
 
 
442 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  41.13 
 
 
203 aa  107  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  46.25 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  30.13 
 
 
464 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  26.1 
 
 
445 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  33.55 
 
 
577 aa  76.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  25.16 
 
 
464 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  31.41 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  32.47 
 
 
453 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  41.25 
 
 
709 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.47 
 
 
429 aa  64.3  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  25.3 
 
 
532 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  37.65 
 
 
769 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  23.17 
 
 
623 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  32.84 
 
 
619 aa  60.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  34.07 
 
 
736 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  28.57 
 
 
414 aa  59.7  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  27.87 
 
 
415 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  21.33 
 
 
369 aa  57.8  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  23.88 
 
 
368 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  34.12 
 
 
418 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  32.71 
 
 
176 aa  55.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  32.98 
 
 
606 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  22 
 
 
336 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  29.89 
 
 
588 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  34.88 
 
 
457 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3514  hypothetical protein  35.35 
 
 
562 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  25.85 
 
 
670 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0524  hypothetical protein  41.18 
 
 
251 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  31.25 
 
 
610 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  42.86 
 
 
452 aa  51.2  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  33.66 
 
 
452 aa  51.2  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  37.7 
 
 
712 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.24 
 
 
669 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  32.04 
 
 
352 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  29.76 
 
 
530 aa  50.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  33.01 
 
 
353 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  26.92 
 
 
601 aa  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  34.78 
 
 
378 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  24.8 
 
 
427 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1750  ATPase  36.54 
 
 
515 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.52576  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  36.67 
 
 
582 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0883  hypothetical protein  34.72 
 
 
79 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  21.58 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  22.81 
 
 
369 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  22.22 
 
 
447 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.43 
 
 
652 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0571  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.2 
 
 
614 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  28.09 
 
 
708 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  30.56 
 
 
450 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  34.65 
 
 
691 aa  47  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  36.49 
 
 
484 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  28.12 
 
 
382 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  42.11 
 
 
496 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  47.62 
 
 
1074 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  42.11 
 
 
596 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  30.91 
 
 
608 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  29.37 
 
 
368 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0004  recombination protein F  37.1 
 
 
401 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.582462  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  30.6 
 
 
443 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2084  hypothetical protein  25 
 
 
506 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330543 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  28.47 
 
 
540 aa  44.3  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  46.15 
 
 
708 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  31.96 
 
 
382 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  29.85 
 
 
533 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  32.11 
 
 
264 aa  44.3  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  30.23 
 
 
519 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  31.96 
 
 
382 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3524  hypothetical protein  34.62 
 
 
228 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  42.59 
 
 
1151 aa  43.9  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1004  hypothetical protein  34.48 
 
 
567 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0319616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0737  hypothetical protein  24.32 
 
 
509 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1783  hypothetical protein  31.11 
 
 
447 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  30.48 
 
 
650 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.02 
 
 
647 aa  43.1  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.99 
 
 
616 aa  43.1  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3691  ea59 protein  31.11 
 
 
513 aa  43.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>