More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3347 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  69.14 
 
 
794 aa  790    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  61.06 
 
 
785 aa  661    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  71.71 
 
 
756 aa  808    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  99.88 
 
 
841 aa  1736    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
841 aa  1738    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  72.48 
 
 
774 aa  815    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  43.21 
 
 
975 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  53.86 
 
 
886 aa  640    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  71.71 
 
 
572 aa  801    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  67.84 
 
 
730 aa  754    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  69.34 
 
 
778 aa  792    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  72.29 
 
 
907 aa  810    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  82.78 
 
 
838 aa  1453    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  71.71 
 
 
788 aa  808    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  68.08 
 
 
792 aa  780    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  97.38 
 
 
841 aa  1654    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  44.52 
 
 
901 aa  657    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  72.67 
 
 
748 aa  814    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  71.32 
 
 
755 aa  797    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  50.1 
 
 
734 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  50.1 
 
 
734 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  50.1 
 
 
734 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  50.79 
 
 
780 aa  525  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  50.1 
 
 
734 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  49.5 
 
 
757 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  50.1 
 
 
734 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  50.1 
 
 
734 aa  525  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  50 
 
 
731 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  49.3 
 
 
734 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  48.91 
 
 
734 aa  515  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  49.8 
 
 
731 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  48.82 
 
 
777 aa  508  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  49.31 
 
 
796 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  46.46 
 
 
687 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  46.72 
 
 
741 aa  459  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  46.72 
 
 
741 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  45.92 
 
 
689 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  46.52 
 
 
689 aa  452  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  45.94 
 
 
741 aa  445  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  46.03 
 
 
646 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  45.06 
 
 
643 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  43.81 
 
 
724 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  43.98 
 
 
645 aa  432  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  43 
 
 
683 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  42.1 
 
 
775 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  42.8 
 
 
730 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  43.24 
 
 
771 aa  419  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  42.1 
 
 
775 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  42.13 
 
 
683 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  41.9 
 
 
775 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  42.1 
 
 
775 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  44.27 
 
 
743 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  41.9 
 
 
775 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  41.9 
 
 
775 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  42.1 
 
 
775 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  43.56 
 
 
729 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  43.37 
 
 
729 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  42.24 
 
 
769 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  42.21 
 
 
753 aa  416  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  42.8 
 
 
712 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  41.36 
 
 
714 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  42.61 
 
 
735 aa  412  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  41.14 
 
 
676 aa  406  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  41.75 
 
 
725 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  41.07 
 
 
1981 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  42.24 
 
 
794 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  33.5 
 
 
767 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  33.18 
 
 
783 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  33.5 
 
 
767 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  39.84 
 
 
540 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  31.3 
 
 
822 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  32.27 
 
 
968 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  38.94 
 
 
874 aa  362  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  38.94 
 
 
922 aa  362  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  38.94 
 
 
916 aa  362  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  38.68 
 
 
618 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  38.31 
 
 
1048 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  36.53 
 
 
1057 aa  357  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  38.1 
 
 
619 aa  356  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  37.36 
 
 
872 aa  352  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  39.33 
 
 
645 aa  351  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  37.16 
 
 
858 aa  351  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  37.16 
 
 
896 aa  351  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  37.16 
 
 
930 aa  351  4e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  31.18 
 
 
1048 aa  350  7e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  29.66 
 
 
826 aa  345  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  30.33 
 
 
843 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  30.34 
 
 
869 aa  341  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  30.45 
 
 
845 aa  340  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  37.13 
 
 
641 aa  340  8e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  37.38 
 
 
616 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  37.55 
 
 
661 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  37.16 
 
 
661 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  37.16 
 
 
661 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  37.16 
 
 
661 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  37.16 
 
 
661 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  37.16 
 
 
661 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  37.16 
 
 
661 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  37.74 
 
 
661 aa  335  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  36.65 
 
 
618 aa  335  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>