More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3345 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0483  PAAR repeat-containing protein  99.6 
 
 
597 aa  942    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  87.29 
 
 
1604 aa  2641    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  36.31 
 
 
1654 aa  779    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  100 
 
 
1583 aa  3220    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  36.11 
 
 
1446 aa  618  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  34.74 
 
 
1385 aa  598  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  34.51 
 
 
1229 aa  598  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  34.92 
 
 
1400 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  34.81 
 
 
1411 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  35.55 
 
 
1421 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  34.42 
 
 
1386 aa  549  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  32.53 
 
 
1409 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  30.81 
 
 
1410 aa  503  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  32.82 
 
 
1531 aa  489  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  31.64 
 
 
1140 aa  486  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  30.28 
 
 
1568 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  35.2 
 
 
1586 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  30.6 
 
 
1418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  30.52 
 
 
1390 aa  449  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  30.82 
 
 
1402 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  31.91 
 
 
1530 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  33.96 
 
 
1554 aa  422  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  29.64 
 
 
1520 aa  423  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  31.77 
 
 
1379 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  29.49 
 
 
1550 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  29.29 
 
 
1626 aa  410  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  30.23 
 
 
1359 aa  406  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  32.49 
 
 
1362 aa  407  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  32.13 
 
 
1348 aa  405  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  29.37 
 
 
1527 aa  407  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  29.6 
 
 
1551 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  33.05 
 
 
855 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  28.94 
 
 
1547 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  31.17 
 
 
924 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  29.1 
 
 
1560 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  29.14 
 
 
1419 aa  373  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  27.62 
 
 
1620 aa  364  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  30.4 
 
 
1319 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  32.9 
 
 
1602 aa  356  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  35.02 
 
 
866 aa  354  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  28.85 
 
 
1609 aa  350  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  28.38 
 
 
1509 aa  335  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  27.69 
 
 
1388 aa  327  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  28.37 
 
 
1525 aa  326  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  26.75 
 
 
1394 aa  325  4e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  26.69 
 
 
1409 aa  324  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  26.7 
 
 
1399 aa  323  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  26.71 
 
 
1411 aa  323  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  26.76 
 
 
1377 aa  323  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  28.31 
 
 
1528 aa  323  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  26.73 
 
 
1411 aa  323  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  26.86 
 
 
1397 aa  322  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  27.18 
 
 
1410 aa  322  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  31.77 
 
 
1317 aa  322  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  26.62 
 
 
1377 aa  320  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  26.78 
 
 
1397 aa  320  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  26.78 
 
 
1397 aa  320  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  26.66 
 
 
1411 aa  319  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  27.79 
 
 
1415 aa  318  4e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  26.73 
 
 
1411 aa  318  4e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  26.47 
 
 
1388 aa  318  4e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  27.25 
 
 
1268 aa  318  6e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  26.71 
 
 
1308 aa  318  7e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  32.66 
 
 
867 aa  318  7e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  27.83 
 
 
1428 aa  317  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  26.59 
 
 
1411 aa  317  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  26.69 
 
 
1400 aa  316  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  26.59 
 
 
1411 aa  317  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  26.64 
 
 
1397 aa  314  7.999999999999999e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  27.04 
 
 
1417 aa  311  8e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  26.91 
 
 
1426 aa  310  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  26.91 
 
 
1426 aa  310  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  27.1 
 
 
1426 aa  309  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  26.55 
 
 
1251 aa  308  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  26.52 
 
 
1398 aa  306  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  26.47 
 
 
1365 aa  298  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  27.31 
 
 
1434 aa  294  8e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  26.32 
 
 
1573 aa  290  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3343  RHS protein  68.69 
 
 
384 aa  289  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  28.03 
 
 
1490 aa  287  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  27.8 
 
 
1429 aa  286  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  26.33 
 
 
1593 aa  283  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  28.34 
 
 
1981 aa  283  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  27.75 
 
 
1405 aa  282  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4997  YD repeat-containing protein  33.97 
 
 
555 aa  280  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.4 
 
 
1572 aa  270  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  27.9 
 
 
1405 aa  269  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  27.75 
 
 
1200 aa  264  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  27.66 
 
 
1216 aa  264  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  27.33 
 
 
1611 aa  263  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  27.73 
 
 
1429 aa  261  8e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  26.91 
 
 
1539 aa  258  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.13 
 
 
1492 aa  257  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.06 
 
 
1576 aa  257  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3478  YD repeat-containing protein  35.23 
 
 
553 aa  253  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  26.87 
 
 
1199 aa  253  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  24.87 
 
 
1466 aa  252  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.43 
 
 
1595 aa  251  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  26.88 
 
 
1539 aa  251  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  27.65 
 
 
1586 aa  249  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.143254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>