140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3288 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3288  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 
385 aa  769    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.190691  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1388  tetratricopeptide repeat protein  80.26 
 
 
385 aa  585  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0712872  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2472  tetratricopeptide repeat protein  80 
 
 
385 aa  584  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251188  normal  0.3368 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3911  tetratricopeptide repeat protein  78.7 
 
 
385 aa  558  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0297232 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4727  tetratricopeptide repeat protein  71.36 
 
 
391 aa  555  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.841453  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1563  tetratricopeptide repeat protein  69.87 
 
 
385 aa  541  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1786  tetratricopeptide repeat protein  67.53 
 
 
381 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420165 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2799  tetratricopeptide repeat protein  69.61 
 
 
381 aa  514  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000578522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1611  tetratricopeptide repeat protein  67.35 
 
 
392 aa  500  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2247  tetratricopeptide repeat protein  51.47 
 
 
389 aa  351  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0967  tetratricopeptide repeat protein  51.03 
 
 
384 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0985  tetratricopeptide repeat protein  41.84 
 
 
391 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2998  tetratricopeptide repeat protein  41.58 
 
 
391 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0827469  hitchhiker  0.0038903 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0749  tetratricopeptide repeat protein  41.27 
 
 
391 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0880031  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4163  tetratricopeptide repeat protein  40.51 
 
 
390 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0782  tetratricopeptide repeat protein  38.24 
 
 
424 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0709697 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0912  tetratricopeptide repeat protein  37.32 
 
 
425 aa  262  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0853  tetratricopeptide repeat protein  38 
 
 
424 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.585626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1009  tetratricopeptide repeat protein  40.77 
 
 
390 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0748562  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0571  tetratricopeptide repeat protein  40.77 
 
 
390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1050  tetratricopeptide repeat protein  40.77 
 
 
390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0959  tetratricopeptide repeat protein  41.06 
 
 
394 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.214004  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0926  tetratricopeptide repeat protein  40.51 
 
 
390 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2254  tetratricopeptide repeat protein  40.98 
 
 
390 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0930  tetratricopeptide repeat protein  40.77 
 
 
390 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1641  tetratricopeptide repeat protein  39.95 
 
 
389 aa  255  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1283  tetratricopeptide repeat protein  39.44 
 
 
390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95391  normal  0.767339 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2879  tetratricopeptide repeat protein  40 
 
 
389 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0424  tetratricopeptide repeat protein  39.69 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.393015  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2990  tetratricopeptide repeat protein  39.69 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0725  tetratricopeptide repeat protein  38.05 
 
 
409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0176529  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2568  tetratricopeptide repeat protein  39.69 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0943  tetratricopeptide repeat protein  39.69 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2942  tetratricopeptide repeat protein  39.69 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0205  tetratricopeptide repeat protein  39.69 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2566  tetratricopeptide repeat protein  37.5 
 
 
407 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3032  tetratricopeptide repeat protein  39.62 
 
 
391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0924  tetratricopeptide repeat protein  37.43 
 
 
387 aa  222  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.262727  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1068  tetratricopeptide repeat protein  37.43 
 
 
387 aa  222  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.26691  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0502  tetratricopeptide repeat protein  35.35 
 
 
403 aa  213  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.914976  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1306  tetratricopeptide repeat protein  34.6 
 
 
403 aa  205  8e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.250179  hitchhiker  0.00000292633 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0560  tetratricopeptide repeat protein  35.06 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143452  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0934  tetratricopeptide repeat protein  35.81 
 
 
389 aa  197  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2224  tetratricopeptide repeat protein  30.91 
 
 
389 aa  189  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000811789  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00894  tetratricopeptide repeat protein  34.3 
 
 
392 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0775107  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1374  tetratricopeptide repeat protein  32.8 
 
 
389 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1378  tetratricopeptide repeat protein  32.54 
 
 
389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1502  tetratricopeptide repeat protein  29.69 
 
 
389 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018122  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0644  tetratricopeptide repeat protein  30.97 
 
 
388 aa  179  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132586  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1649  tetratricopeptide repeat protein  35.31 
 
 
392 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.165991  normal  0.0903087 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1533  tetratricopeptide repeat protein  31.19 
 
 
389 aa  177  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1735  tetratricopeptide repeat protein  30.67 
 
 
389 aa  176  6e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000233751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01257  hypothetical protein  30.47 
 
 
389 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000160117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2367  Tetratricopeptide domain protein  30.47 
 
 
389 aa  176  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000651113  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0185  tetratricopeptide repeat protein  33.33 
 
 
387 aa  176  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1914  tetratricopeptide repeat protein  30.47 
 
 
389 aa  176  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000156513  hitchhiker  3.47203e-22 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1391  tetratricopeptide repeat protein  30.47 
 
 
389 aa  176  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.935719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1482  tetratricopeptide repeat protein  30.47 
 
 
389 aa  176  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000455068  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2346  tetratricopeptide repeat protein  30.47 
 
 
389 aa  176  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000129079  unclonable  0.0000000238916 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1849  tetratricopeptide repeat protein  30.47 
 
 
389 aa  176  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000245858  unclonable  5.61509e-21 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1508  tetratricopeptide repeat protein  30.47 
 
 
389 aa  176  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000376435  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01268  hypothetical protein  30.47 
 
 
390 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000197215  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3221  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0588004  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2464  tetratricopeptide repeat protein  29.84 
 
 
389 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000301038  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1895  tetratricopeptide repeat protein  30.13 
 
 
389 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000228715  hitchhiker  4.98218e-17 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1837  tetratricopeptide repeat protein  30.13 
 
 
389 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000022719  hitchhiker  0.000343343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1622  tetratricopeptide repeat protein  30.13 
 
 
389 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000649442  decreased coverage  2.66656e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1832  tetratricopeptide repeat protein  30.13 
 
 
389 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00100254  unclonable  2.05101e-30 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1441  tetratricopeptide repeat protein  30.13 
 
 
389 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000153911  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02857  tetratricopeptide repeat protein  27.61 
 
 
391 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02118  tetratricopeptide repeat protein  29.49 
 
 
389 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000128021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2650  tetratricopeptide repeat protein  29.87 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000174406  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003023  putative heat shock protein  27.58 
 
 
373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000120972  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1594  tetratricopeptide repeat protein  32.82 
 
 
392 aa  167  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.632242  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1915  tetratricopeptide repeat protein  29.79 
 
 
389 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000481977  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2234  tetratricopeptide repeat protein  29.79 
 
 
389 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215898  hitchhiker  0.00382092 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2026  tetratricopeptide repeat protein  29.79 
 
 
389 aa  166  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000487285  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1216  tetratricopeptide repeat protein  31.35 
 
 
408 aa  166  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.608666  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1702  tetratricopeptide repeat protein  28.95 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000418527  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1537  tetratricopeptide repeat protein  33.08 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2076  tetratricopeptide repeat protein  28.94 
 
 
386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000100726  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2188  tetratricopeptide repeat protein  28.53 
 
 
389 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000146225  hitchhiker  0.0000569887 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1546  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 
397 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2338  tetratricopeptide repeat protein  27.3 
 
 
389 aa  159  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00445466  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3010  tetratricopeptide repeat protein  27.39 
 
 
390 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00816471  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2641  tetratricopeptide repeat protein  28.16 
 
 
389 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000590844  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2367  tetratricopeptide repeat protein  28.8 
 
 
389 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000126783  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2138  tetratricopeptide repeat protein  32.86 
 
 
401 aa  157  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00930218  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1739  tetratricopeptide repeat protein  30.29 
 
 
386 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000105333  hitchhiker  0.00275334 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2120  tetratricopeptide repeat protein  27.58 
 
 
386 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000410522  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1957  tetratricopeptide repeat protein  29.61 
 
 
386 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000379744  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2154  tetratricopeptide repeat protein  33.99 
 
 
394 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00078802  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2295  tetratricopeptide repeat protein  29.09 
 
 
386 aa  153  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2073  tetratricopeptide repeat protein  30.49 
 
 
386 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000729266  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2069  tetratricopeptide repeat protein  30.23 
 
 
386 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265574  unclonable  0.00000000000285968 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2039  tetratricopeptide repeat protein  30.57 
 
 
386 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2276  tetratricopeptide repeat protein  30.23 
 
 
386 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000164995  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2393  tetratricopeptide repeat protein  30.23 
 
 
386 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  unclonable  0.0000114116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2399  tetratricopeptide repeat protein  27.37 
 
 
386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1927  tetratricopeptide repeat protein  27.37 
 
 
386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000214151  unclonable  0.0000000000455272 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>