More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3242 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1900  helicase c2  54.61 
 
 
688 aa  641    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2178  helicase c2  60.72 
 
 
685 aa  796    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  58.1 
 
 
670 aa  786    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2617  helicase c2  55.16 
 
 
668 aa  683    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.203354  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3499  helicase c2  54.76 
 
 
724 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285018  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3242  helicase c2  100 
 
 
740 aa  1448    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4486  helicase c2  56.56 
 
 
714 aa  751    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24845  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  54.07 
 
 
668 aa  704    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1828  helicase c2  54.15 
 
 
688 aa  634  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.147958  normal  0.434412 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2005  putative ATP-dependent DNA helicase-related protein  49.46 
 
 
666 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.349435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  42.08 
 
 
743 aa  488  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.56 
 
 
641 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  40.54 
 
 
751 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  55.92 
 
 
658 aa  392  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  35.03 
 
 
652 aa  372  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  34.89 
 
 
652 aa  372  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  33.33 
 
 
646 aa  333  8e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1940  ATP-dependent helicase DinG  34.29 
 
 
665 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.497186  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  31.16 
 
 
674 aa  307  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  41.27 
 
 
725 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  41.27 
 
 
725 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  30.83 
 
 
843 aa  276  9e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  38.9 
 
 
639 aa  270  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  40.9 
 
 
639 aa  269  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  41.52 
 
 
639 aa  269  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  41.98 
 
 
639 aa  267  5.999999999999999e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  41.92 
 
 
640 aa  266  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  26.3 
 
 
846 aa  265  3e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  39.72 
 
 
636 aa  265  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  39.72 
 
 
636 aa  264  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  39.72 
 
 
636 aa  264  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  40.35 
 
 
636 aa  264  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  38.2 
 
 
651 aa  263  6e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  41.39 
 
 
634 aa  263  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  39.72 
 
 
636 aa  263  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  48.12 
 
 
634 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  48.12 
 
 
634 aa  263  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  39.95 
 
 
636 aa  261  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  39.95 
 
 
636 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  39.95 
 
 
636 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  39.95 
 
 
636 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  42.6 
 
 
653 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  39.95 
 
 
636 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  39.95 
 
 
636 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  39.95 
 
 
636 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  39.95 
 
 
636 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  39.95 
 
 
636 aa  260  7e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.04 
 
 
921 aa  259  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  39.43 
 
 
658 aa  259  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  40.58 
 
 
646 aa  259  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  42.14 
 
 
649 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  43.65 
 
 
646 aa  257  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  43.28 
 
 
757 aa  257  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  37.96 
 
 
755 aa  257  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  39 
 
 
646 aa  256  9e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.06 
 
 
957 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  36.59 
 
 
707 aa  254  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  40.26 
 
 
668 aa  254  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  44 
 
 
644 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  46.76 
 
 
634 aa  253  9.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  44.22 
 
 
649 aa  252  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  51.6 
 
 
755 aa  252  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1086  putative ATP-dependent helicase  51.75 
 
 
752 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00956322  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1326  ATP-dependent helicase, putative  51.75 
 
 
752 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0729389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0081  putative ATP-dependent helicase  51.75 
 
 
752 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892999  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1815  putative ATP-dependent helicase  51.75 
 
 
752 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2170  putative ATP-dependent helicase  51.75 
 
 
752 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.779886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2336  ATP-dependent helicase, putative  51.75 
 
 
752 aa  251  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6284  helicase c2  51.2 
 
 
749 aa  251  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1733  helicase c2  52 
 
 
747 aa  251  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336556  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1795  helicase c2  51.2 
 
 
749 aa  251  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1706  helicase c2  52 
 
 
747 aa  251  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702036  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  51.36 
 
 
749 aa  250  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1819  helicase c2  51.2 
 
 
749 aa  250  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.414686 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5096  helicase c2  51.6 
 
 
748 aa  249  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.334397 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  43.04 
 
 
651 aa  248  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  42.42 
 
 
640 aa  248  4e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  38.59 
 
 
636 aa  246  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  41.1 
 
 
647 aa  244  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  34.03 
 
 
690 aa  244  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  41.16 
 
 
645 aa  243  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  41.75 
 
 
641 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  41.75 
 
 
641 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  35.29 
 
 
665 aa  237  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  35.29 
 
 
665 aa  237  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  35.43 
 
 
665 aa  237  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  36.34 
 
 
659 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  36.34 
 
 
659 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  41.62 
 
 
643 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  37.96 
 
 
674 aa  234  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  36.76 
 
 
641 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  35.19 
 
 
641 aa  232  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  39.75 
 
 
675 aa  231  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  40.88 
 
 
664 aa  229  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  35.07 
 
 
669 aa  227  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  35.07 
 
 
669 aa  227  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  35.98 
 
 
633 aa  226  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  39.56 
 
 
681 aa  225  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  35.21 
 
 
640 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  35.07 
 
 
664 aa  225  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>