More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3174 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3174  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 399 aa  812    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0541097  normal  0.740982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4043  extracellular ligand-binding receptor  70.7 
 
 		 388 aa  579  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5126  extracellular ligand-binding receptor  57.33 
 
 		 388 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2120  Extracellular ligand-binding receptor  59.62 
 
 		 389 aa  471  1e-132  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.671824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0631  Extracellular ligand-binding receptor  55.26 
 
 		 390 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1987  extracellular ligand-binding receptor  53.7 
 
 		 389 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.378551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0641  Extracellular ligand-binding receptor  52.44 
 
 		 389 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.474288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0366  Extracellular ligand-binding receptor  55.62 
 
 		 401 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4488  extracellular ligand-binding receptor  55.43 
 
 		 391 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5379  Extracellular ligand-binding receptor  52.16 
 
 		 395 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4610  extracellular ligand-binding receptor  51.44 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3830  Extracellular ligand-binding receptor  53.97 
 
 		 390 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2686  putative ABC transporter substrate binding protein  50.65 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192979  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5095  ABC transporter substrate binding protei  52.76 
 
 		 381 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.263393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0862  extracellular ligand-binding receptor  51.64 
 
 		 379 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284446  normal  0.223955 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3998  extracellular ligand-binding receptor  49.23 
 
 		 389 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0350284  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2237  extracellular ligand-binding receptor  50.96 
 
 		 376 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3643  response regulator receiver protein  51.51 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0994  extracellular ligand-binding receptor  47.06 
 
 		 391 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000312387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4211  extracellular ligand-binding receptor  48.64 
 
 		 379 aa  361  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0456551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1212  Extracellular ligand-binding receptor  50.68 
 
 		 398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.787629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0732  hypothetical protein  46.39 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4401  extracellular ligand-binding receptor  47.12 
 
 		 407 aa  345  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.933784  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2460  extracellular ligand-binding receptor  43.62 
 
 		 390 aa  324  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0794  extracellular ligand-binding receptor  46.01 
 
 		 386 aa  322  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3268  hypothetical protein  49.73 
 
 		 387 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.781038 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4395  extracellular ligand-binding receptor  41.3 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0986  extracellular ligand-binding receptor  42.16 
 
 		 399 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.763691  unclonable  0.00000240352 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0175  putative ABC transporter binding protein  38.38 
 
 		 393 aa  279  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.673441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1329  extracellular ligand-binding receptor  36.62 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1779  extracellular ligand-binding receptor  36.8 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3135  Extracellular ligand-binding receptor  37.6 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1226  extracellular ligand-binding receptor  35.98 
 
 		 397 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15047  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2772  extracellular ligand-binding receptor  36.9 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0077  extracellular ligand-binding receptor  34.72 
 
 		 387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4371  twin-arginine translocation pathway signal  37.8 
 
 		 402 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.392335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4744  extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 		 390 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3653  extracellular ligand-binding receptor  35.39 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3089  Extracellular ligand-binding receptor  34.5 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4822  extracellular ligand-binding receptor  34.08 
 
 		 395 aa  210  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.623024  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4662  twin-arginine translocation pathway signal  36.24 
 
 		 402 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0214  extracellular ligand-binding receptor  33.58 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.486026  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1907  extracellular ligand-binding receptor  33.42 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1622  extracellular ligand-binding receptor  32.98 
 
 		 389 aa  207  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2984  twin-arginine translocation pathway signal  34.24 
 
 		 395 aa  206  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808904  normal  0.464937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4035  plasmid encoded RepA protein  35.79 
 
 		 406 aa  206  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2950  extracellular ligand-binding receptor  35.05 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.967573  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0087  Extracellular ligand-binding receptor  34.75 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0735  Extracellular ligand-binding receptor  34.71 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1017  twin-arginine translocation pathway signal  32.34 
 
 		 392 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2689  Extracellular ligand-binding receptor  31.64 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000331787  normal  0.185218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1586  twin-arginine translocation pathway signal  33.51 
 
 		 392 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.764817 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2302  Extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 		 410 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4559  Extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 		 392 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1579  extracellular ligand-binding receptor  32.35 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.409097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5707  branched-chain amino acid ABC transporter  31.4 
 
 		 392 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4181  Extracellular ligand-binding receptor  30.32 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5038  extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0193  extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1177  Extracellular ligand-binding receptor  31.39 
 
 		 390 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1747  Extracellular ligand-binding receptor  30.08 
 
 		 391 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.877738  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2270  extracellular ligand-binding receptor  31.33 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.733577  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4528  extracellular ligand-binding receptor  28.9 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3384  extracellular ligand-binding receptor  31.71 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5150  extracellular ligand-binding receptor  28.46 
 
 		 397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.156171 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6211  extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 		 413 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1365  extracellular ligand-binding receptor  29.02 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.780713  normal  0.67049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  27.87 
 
 		 423 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0759  extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.561575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0288  extracellular ligand-binding receptor  31.49 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0610  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  30.47 
 
 		 390 aa  139  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.110277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3688  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  29.35 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00171007  normal  0.751271 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0159  extracellular ligand-binding receptor  30.75 
 
 		 395 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2730  extracellular ligand-binding receptor  31.67 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0102883  hitchhiker  0.00729362 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0648  amino acid ABC transporter, periplasmic amino-acid binding protein  30.21 
 
 		 390 aa  137  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4136  Extracellular ligand-binding receptor  28.94 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.831108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3183  Extracellular ligand-binding receptor  30.1 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.596586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3475  Extracellular ligand-binding receptor  29.84 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3730  extracellular ligand-binding receptor  29.29 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  27.69 
 
 		 401 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2846  Extracellular ligand-binding receptor  27.45 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.530964 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2056  Extracellular ligand-binding receptor  29.61 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2449  Extracellular ligand-binding receptor  29.61 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1208  extracellular ligand-binding receptor  27.68 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5186  Extracellular ligand-binding receptor  29.72 
 
 		 425 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4217  extracellular ligand-binding receptor  29.32 
 
 		 390 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.35 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  27.5 
 
 		 390 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3724  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 384 aa  120  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.159594  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2244  substrate-binding periplasmic ABC transporter protein  27.11 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.219706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2581  hypothetical protein  31.37 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.516981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5444  ABC transporter substrate binding protein (branched amino acid)  27.17 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4295  Extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4775  putative ABC transporter substrate binding protein  28.11 
 
 		 393 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00131883  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2717  extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 		 396 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0418912  normal  0.429406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4465  extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 		 406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.662069  normal  0.481724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  29.48 
 
 		 445 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6330  twin-arginine translocation pathway signal  24.57 
 
 		 397 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238667  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  28.11 
 
 		 415 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3329  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  28.61 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>