143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3141 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  682  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  88.47 
 
 
322 aa  531  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  88.14 
 
 
322 aa  530  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  86.44 
 
 
323 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  71.78 
 
 
325 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  71.47 
 
 
325 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  73.36 
 
 
323 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  73.22 
 
 
322 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  67.99 
 
 
326 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  67.99 
 
 
326 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  7.85059e-07 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  71.53 
 
 
323 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  70.39 
 
 
329 aa  421  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  71.53 
 
 
321 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  71.53 
 
 
321 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  71.53 
 
 
321 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  71.86 
 
 
321 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  71.19 
 
 
321 aa  417  1e-115  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  67.92 
 
 
323 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  67.92 
 
 
323 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  67.92 
 
 
323 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  67.61 
 
 
323 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  67.92 
 
 
323 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  67.92 
 
 
323 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  67.3 
 
 
323 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  67.61 
 
 
323 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  67.12 
 
 
324 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  57.97 
 
 
343 aa  344  2e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  55.59 
 
 
341 aa  328  7e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  53 
 
 
324 aa  328  9e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  55.25 
 
 
341 aa  327  1e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  50.94 
 
 
317 aa  321  9e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  47.63 
 
 
370 aa  321  1e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  55.02 
 
 
317 aa  320  2e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.36 
 
 
321 aa  317  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  47.63 
 
 
349 aa  315  5e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  54.73 
 
 
319 aa  314  2e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  55.02 
 
 
321 aa  313  2e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  52.72 
 
 
317 aa  313  4e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  53.56 
 
 
323 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  51.7 
 
 
317 aa  307  1e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  50 
 
 
349 aa  307  2e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  53.24 
 
 
316 aa  305  7e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  46.77 
 
 
321 aa  280  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  47.75 
 
 
322 aa  272  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  45.54 
 
 
321 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.48 
 
 
327 aa  268  8e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  46.58 
 
 
325 aa  257  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  43.13 
 
 
337 aa  254  1e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  40.65 
 
 
329 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  42.11 
 
 
341 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.7856e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  43.14 
 
 
324 aa  236  6e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.37 
 
 
584 aa  231  1e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  40.96 
 
 
337 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  9.3059e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  43.01 
 
 
320 aa  228  9e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  40.61 
 
 
329 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  41.2 
 
 
335 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  39.32 
 
 
338 aa  213  3e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  42.25 
 
 
330 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  39.94 
 
 
340 aa  206  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  38.25 
 
 
322 aa  205  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  41.61 
 
 
336 aa  204  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  44.35 
 
 
270 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  38.96 
 
 
320 aa  195  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  36.04 
 
 
320 aa  193  4e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  3.17435e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  39.5 
 
 
319 aa  193  5e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  37.25 
 
 
332 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  35.03 
 
 
313 aa  189  8e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  35.57 
 
 
332 aa  184  1e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.04583e-09 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  36.05 
 
 
331 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  32.29 
 
 
347 aa  177  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.82856e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  32.76 
 
 
333 aa  176  4e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.38162e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  37.88 
 
 
331 aa  175  1e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  36.79 
 
 
328 aa  174  2e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  31.8 
 
 
329 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  35.91 
 
 
331 aa  168  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  32.34 
 
 
329 aa  165  1e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  31.21 
 
 
328 aa  161  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  30.58 
 
 
334 aa  162  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  29.35 
 
 
334 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  34.82 
 
 
640 aa  155  8e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  30.56 
 
 
298 aa  153  4e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  30.32 
 
 
359 aa  149  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  30.14 
 
 
327 aa  141  2e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  30.42 
 
 
344 aa  135  7e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  32.63 
 
 
322 aa  132  6e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.89 
 
 
344 aa  131  1e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.39 
 
 
352 aa  131  2e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  29.01 
 
 
355 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  32.39 
 
 
384 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  27.82 
 
 
322 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  30.25 
 
 
329 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  30.34 
 
 
354 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  28.52 
 
 
320 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  28.21 
 
 
328 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  26.85 
 
 
324 aa  96.3  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  26.21 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  25.64 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1048  hypothetical protein  26.83 
 
 
344 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2884  hypothetical protein  29.12 
 
 
365 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  29.96 
 
 
297 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>