More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3075 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3075  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  90.79 
 
 		 239 aa  455  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2959  Crp/FNR family transcriptional regulator  91.18 
 
 		 241 aa  450  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  90.38 
 
 		 239 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3326  Crp/FNR family transcriptional regulator  87.45 
 
 		 239 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  88.24 
 
 		 239 aa  434  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370075  normal  0.683237 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1913  CRP/FNR family transcriptional regulator  88.24 
 
 		 241 aa  435  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.205993  normal  0.953786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  85.77 
 
 		 239 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4308  cyclic nucleotide-binding protein  76.5 
 
 		 239 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4994  cyclic nucleotide-binding protein  71.12 
 
 		 247 aa  329  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  63.56 
 
 		 234 aa  285  7e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1058  CRP/FNR family transcriptional regulator  51.1 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0976  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.1 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2589  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 235 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2459  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 235 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000341213 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2565  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0695171  normal  0.0307054 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0351  putative transcriptional regulator  35.94 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03580  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000980911  hitchhiker  0.0000000000977836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4353  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1929  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.589711  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2541  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000812643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0199  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4881  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.65 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.65 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5872  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142608  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  29.28 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2665  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 239 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0675619  normal  0.290328 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.027549  normal  0.149867 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  32.75 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7045  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.73 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  0.0108856 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2266  transcriptional regulator, putative  33.03 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1089  cyclic nucleotide-binding protein  33.03 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2143  putative transcriptional regulator  33.03 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0938  cyclic nucleotide-binding protein  33.03 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0934  cyclic nucleotide-binding  33.03 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.059861  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0027  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 237 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0259  cyclic nucleotide-binding protein  29.36 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0894  cyclic nucleotide-binding  32.37 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3129  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.78 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0775  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0213  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 259 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01902  putative transcription regulator protein  31.63 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4045  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385107  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3029  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.91 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3223  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.319468 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4072  cyclic nucleotide-binding protein  28.7 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.426596  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4294  cyclic nucleotide-binding protein  28.7 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.803161  normal  0.987027 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0248  cyclic nucleotide-binding  30.45 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.65 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  31 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2608  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.700213  normal  0.0258786 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.15 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6768  cyclic nucleotide-binding protein  28.3 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1826  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4243  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 305 aa  98.6  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3781  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.53 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4858  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.53 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.748285 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1475  cyclic nucleotide-binding protein  28.5 
 
 		 284 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0510  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.5 
 
 		 284 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0137  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.5 
 
 		 284 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1395  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.5 
 
 		 304 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.553188  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  32.5 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5713  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4311  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 		 285 aa  95.9  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0853188  normal  0.342841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.95 
 
 		 224 aa  96.3  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1725  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.11 
 
 		 251 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.134143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0992  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.5 
 
 		 289 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0799157  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1075  cyclic nucleotide-binding protein  28.5 
 
 		 281 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2305  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.5 
 
 		 309 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003082  transcriptional regulator Crp/Fnr family  29.53 
 
 		 231 aa  95.1  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00863529  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1687  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.5 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2783  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.89 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.778441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.96 
 
 		 234 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4026  cyclic nucleotide-binding protein  29.5 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4138  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.5 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.60462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3712  cyclic nucleotide-binding protein  27.31 
 
 		 259 aa  91.7  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.971291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2580  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.6 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4190  cyclic nucleotide-binding protein  27.31 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.456577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.71 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5944  cyclic nucleotide-binding  28.44 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4309  cyclic nucleotide-binding  30 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5767  putative HTH Crp family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 253 aa  89.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 226 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.89 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 225 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.11 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>