278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2872 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  280  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  70.8 
 
 
135 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  70.8 
 
 
147 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  73.02 
 
 
143 aa  194  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  69.12 
 
 
148 aa  191  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1845  hypothetical protein  65.94 
 
 
147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128733  normal  0.528638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2566  phenylacetic acid degradation-related protein  67.65 
 
 
149 aa  176  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12442  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2918  thioesterase superfamily protein  63.7 
 
 
154 aa  174  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  61.19 
 
 
146 aa  163  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1855  thioesterase superfamily protein  56.72 
 
 
154 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  52.21 
 
 
165 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  53.66 
 
 
161 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  52.5 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  47.97 
 
 
159 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  49.59 
 
 
160 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  49.59 
 
 
160 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  49.59 
 
 
160 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  49.59 
 
 
160 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  49.59 
 
 
160 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  47.15 
 
 
159 aa  122  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  47.15 
 
 
159 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  49.59 
 
 
160 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  47.15 
 
 
159 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1932  thioesterase superfamily protein  50.41 
 
 
161 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.248061  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  47.15 
 
 
159 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  49.59 
 
 
160 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  49.59 
 
 
160 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  47.15 
 
 
159 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  47.15 
 
 
159 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1780  hypothetical protein  51.08 
 
 
176 aa  121  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.371406 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  45.83 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  43.61 
 
 
144 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  43.61 
 
 
144 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  44.36 
 
 
144 aa  114  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1036  thioesterase superfamily protein  49.59 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590803  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  36.51 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0167  phenylacetic acid degradation-like protein  40.65 
 
 
144 aa  98.6  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  40.46 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5767  thioesterase superfamily protein  43.59 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  36.72 
 
 
142 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3654  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 
144 aa  87  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00894045  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0210  phenylacetic acid degradation-related protein  35.25 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5764  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0207  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3424  thioesterase superfamily protein  34.43 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4364  thioesterase-related protein  34.68 
 
 
135 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  33.88 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1864  thioesterase superfamily protein  34.82 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.236393 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0100  hypothetical protein  36.27 
 
 
155 aa  72  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.420751  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
165 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  30.17 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
176 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
183 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0470  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.61831  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  29.17 
 
 
138 aa  67  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0175  thioesterase superfamily protein  39.36 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  30.77 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0149  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0131  hypothetical protein  38.3 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  28.36 
 
 
209 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2979  hypothetical protein  34.17 
 
 
182 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.106033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2924  hypothetical protein  32.84 
 
 
189 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  40.62 
 
 
169 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5993  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
182 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.202542 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3519  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 
149 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.768855  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4940  phenylacetic acid degradation-related protein  31.62 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  32.2 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1900  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
204 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0146088 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1696  phenylacetic acid degradation-related protein  31.75 
 
 
193 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  27.91 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0117  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1102  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
189 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.218192  normal  0.0165353 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3278  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3600  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 
181 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3546  phenylacetic acid degradation-related protein  31.3 
 
 
185 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.572373  normal  0.256771 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2142  hypothetical protein  31.62 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4820  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 
174 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
232 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
191 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0025  hypothetical protein  27.35 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000180686  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  30.83 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2878  hypothetical protein  32.61 
 
 
158 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  30 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1240  phenylacetic acid degradation-related protein  31.9 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154895  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0959  phenylacetic acid degradation-related protein  38.54 
 
 
169 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46096  normal  0.0335378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4539  thioesterase superfamily protein  32.73 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1510  hypothetical protein  32.61 
 
 
145 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>